More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2573 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_28420  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  61.96 
 
 
607 aa  672    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.520014 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2573  ABC transporter related protein  100 
 
 
619 aa  1186    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0847371  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0698  ABC transporter transmembrane region  63.99 
 
 
612 aa  684    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3041  ABC transporter transmembrane region  58.5 
 
 
615 aa  633  1e-180  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327338 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0647  ABC transporter transmembrane region  52.08 
 
 
589 aa  530  1e-149  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.415337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8453  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  46.89 
 
 
564 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00619084  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0748  ABC transporter transmembrane region  53.32 
 
 
593 aa  432  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3727  ABC transporter related  47.04 
 
 
578 aa  416  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202459  normal  0.0336359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2082  ABC transporter transmembrane region  44.31 
 
 
575 aa  399  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  46.77 
 
 
588 aa  387  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5182  ABC transporter related  44.39 
 
 
578 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.459442  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0419  ABC transporter related protein  41.87 
 
 
574 aa  369  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.937876  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4060  ABC transporter related protein  39.66 
 
 
570 aa  362  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.282527  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4196  ABC transporter transmembrane region  41.86 
 
 
580 aa  313  6.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00643785  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1127  ABC transporter transmembrane region  45.33 
 
 
580 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3472  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.11 
 
 
564 aa  187  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00244165  hitchhiker  0.00122928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2406  ABC transporter related  34.44 
 
 
570 aa  182  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5067  ABC transporter related  36.3 
 
 
549 aa  173  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6064  ABC transporter related protein  32.75 
 
 
575 aa  173  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  29.22 
 
 
603 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  31.14 
 
 
581 aa  164  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  27.62 
 
 
581 aa  164  6e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  28.54 
 
 
603 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  25.96 
 
 
582 aa  159  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  25.95 
 
 
594 aa  158  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.5 
 
 
582 aa  158  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1783  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.3 
 
 
588 aa  157  4e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02052  ABC multidrug transporter (Eurofung)  27.02 
 
 
782 aa  157  5.0000000000000005e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1782  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.3 
 
 
588 aa  157  7e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0900  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.35 
 
 
583 aa  155  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0510675  normal  0.909726 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2674  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.13 
 
 
602 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0832532  normal  0.0804565 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1058  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  27.81 
 
 
588 aa  155  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.61208  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1593  ABC transporter related protein  34.13 
 
 
587 aa  155  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.317799  normal  0.0625099 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1668  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.91 
 
 
602 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1705  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.91 
 
 
602 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.433379  normal  0.881057 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1683  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.91 
 
 
602 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.47 
 
 
582 aa  154  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01535  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.98 
 
 
583 aa  154  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2802  ABC transporter, ATP-binding protein MsbA  28.21 
 
 
601 aa  152  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29 
 
 
600 aa  152  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3253  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  27.89 
 
 
589 aa  152  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.052561  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2584  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.14 
 
 
600 aa  152  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.544743  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  26.68 
 
 
610 aa  152  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  26.02 
 
 
580 aa  152  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  24.3 
 
 
608 aa  152  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.62 
 
 
582 aa  152  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4984  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.72 
 
 
602 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2041  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.87 
 
 
582 aa  152  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.68 
 
 
609 aa  152  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0830  ABC transporter related  29.28 
 
 
612 aa  151  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000934514 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  23.92 
 
 
597 aa  152  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0531  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.72 
 
 
603 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.140782 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2577  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.09 
 
 
582 aa  151  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436168  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2665  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.09 
 
 
582 aa  151  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789085  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1959  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.09 
 
 
582 aa  151  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278742  normal  0.389818 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1557  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.78 
 
 
602 aa  151  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.4 
 
 
582 aa  151  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5006  ABC transporter-related protein  28.49 
 
 
634 aa  150  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.4 
 
 
582 aa  150  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.4 
 
 
582 aa  150  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.4 
 
 
582 aa  150  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.4 
 
 
582 aa  150  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.4 
 
 
582 aa  150  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  27.34 
 
 
582 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.34 
 
 
582 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.34 
 
 
582 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.34 
 
 
582 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  27.34 
 
 
582 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  29.11 
 
 
581 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.03 
 
 
577 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.34 
 
 
582 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.34 
 
 
582 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.34 
 
 
582 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.34 
 
 
582 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.4 
 
 
597 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  23.71 
 
 
597 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02524  hypothetical protein  26.96 
 
 
579 aa  149  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2422  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.91 
 
 
601 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2492  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.91 
 
 
601 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677361  normal  0.121232 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4807  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.5 
 
 
602 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4935  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29.5 
 
 
602 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.302825  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.75 
 
 
579 aa  148  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1657  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.51 
 
 
555 aa  148  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.34 
 
 
586 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2254  ABC transporter related  26.79 
 
 
782 aa  147  6e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  25.34 
 
 
586 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.34 
 
 
586 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1433  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.34 
 
 
582 aa  147  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.855683  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  29.44 
 
 
579 aa  147  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  29.48 
 
 
650 aa  146  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4532  ABC transporter related  29.48 
 
 
650 aa  146  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.329885  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  29.84 
 
 
641 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  24.68 
 
 
583 aa  145  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  27.59 
 
 
589 aa  145  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3048  ABC transporter related  29.35 
 
 
584 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.522258  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  22.37 
 
 
589 aa  145  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  24.69 
 
 
584 aa  145  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  31 
 
 
1301 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.04 
 
 
586 aa  145  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.17 
 
 
586 aa  145  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>