More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4196 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4196  ABC transporter transmembrane region  100 
 
 		 580 aa  1142    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00643785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8453  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  43.63 
 
 		 564 aa  405  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00619084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5182  ABC transporter related  44.39 
 
 		 578 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.459442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0419  ABC transporter related protein  40.21 
 
 		 574 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.937876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2082  ABC transporter transmembrane region  40.52 
 
 		 575 aa  369  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4060  ABC transporter related protein  39.24 
 
 		 570 aa  369  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.282527  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0698  ABC transporter transmembrane region  41.51 
 
 		 612 aa  358  1.9999999999999998e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0748  ABC transporter transmembrane region  44.33 
 
 		 593 aa  356  5.999999999999999e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28420  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.35 
 
 		 607 aa  356  5.999999999999999e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.520014 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3041  ABC transporter transmembrane region  39.72 
 
 		 615 aa  354  2.9999999999999997e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327338 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1127  ABC transporter transmembrane region  45.25 
 
 		 580 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.97 
 
 		 588 aa  317  4e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2573  ABC transporter related protein  41.89 
 
 		 619 aa  316  6e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0847371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0647  ABC transporter transmembrane region  34.73 
 
 		 589 aa  311  2.9999999999999997e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.415337 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3727  ABC transporter related  36.05 
 
 		 578 aa  279  8e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202459  normal  0.0336359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3472  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.25 
 
 		 564 aa  158  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00244165  hitchhiker  0.00122928 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01280  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.03 
 
 		 530 aa  154  5.9999999999999996e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1593  ABC transporter related protein  32.37 
 
 		 587 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.317799  normal  0.0625099 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  24.52 
 
 		 600 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  28.19 
 
 		 584 aa  151  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  26.64 
 
 		 583 aa  150  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.24 
 
 		 583 aa  150  9e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  26.47 
 
 		 583 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  26.47 
 
 		 583 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.47 
 
 		 583 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.05 
 
 		 586 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.05 
 
 		 586 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.05 
 
 		 586 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  28.05 
 
 		 586 aa  148  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.05 
 
 		 586 aa  148  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.19 
 
 		 583 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  27.85 
 
 		 586 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2406  ABC transporter related  30.38 
 
 		 570 aa  147  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.37 
 
 		 583 aa  147  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  26.5 
 
 		 592 aa  147  7.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0856  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  32.84 
 
 		 566 aa  147  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  27.18 
 
 		 598 aa  147  7.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  25.9 
 
 		 616 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0809  ABC transporter ATP-binding/permease  27.85 
 
 		 586 aa  146  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00766142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0852  ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.85 
 
 		 586 aa  146  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0631  ABC transporter related  26.11 
 
 		 741 aa  144  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00287092  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  28.22 
 
 		 600 aa  144  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4432  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.64 
 
 		 548 aa  144  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000325117  normal  0.0473884 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21680  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.4 
 
 		 579 aa  144  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5067  ABC transporter related  35.25 
 
 		 549 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  25.6 
 
 		 583 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3715  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.22 
 
 		 583 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000980876  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  22.67 
 
 		 597 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  28.12 
 
 		 581 aa  141  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3720  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.01 
 
 		 583 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  26.38 
 
 		 592 aa  141  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  25.55 
 
 		 583 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  25.1 
 
 		 602 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  27.03 
 
 		 586 aa  140  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  27.71 
 
 		 610 aa  140  7.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.01 
 
 		 609 aa  140  8.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1258  hypothetical protein  24.08 
 
 		 578 aa  139  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1440  ABC transporter related protein  30.42 
 
 		 596 aa  139  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.531129 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  28.87 
 
 		 579 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  22.43 
 
 		 594 aa  139  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  25.18 
 
 		 592 aa  137  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3048  ABC transporter related  28.29 
 
 		 584 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.522258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  26.03 
 
 		 589 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8741  carbohydrate ABC transporter  29.57 
 
 		 577 aa  137  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  25.1 
 
 		 603 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  22.2 
 
 		 590 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11299  drug ABC transporter ATP-binding protein  25.95 
 
 		 582 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0460  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.55 
 
 		 581 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0396  ABC transporter related protein  25.17 
 
 		 574 aa  134  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000464799  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  26.49 
 
 		 602 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  25.71 
 
 		 607 aa  134  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  25.63 
 
 		 607 aa  133  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  22.75 
 
 		 577 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6064  ABC transporter related protein  27.66 
 
 		 575 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0018  ABC transporter related  23.87 
 
 		 581 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  23.35 
 
 		 594 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  23.57 
 
 		 597 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  24.95 
 
 		 611 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  23.57 
 
 		 597 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0921  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.46 
 
 		 579 aa  131  3e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.451099  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  24.4 
 
 		 601 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  26.35 
 
 		 582 aa  131  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  24.79 
 
 		 594 aa  131  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6289  ABC transporter related protein  28.38 
 
 		 584 aa  131  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0018  ABC transporter related  23.98 
 
 		 573 aa  130  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  24.39 
 
 		 622 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3852  ABC export transporter, fused inner membrane and ATPase subunits  30.52 
 
 		 724 aa  130  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382058  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  25.41 
 
 		 596 aa  130  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  26.57 
 
 		 672 aa  130  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.72 
 
 		 592 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5994  ABC transporter related  27.18 
 
 		 587 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7143  ABC transporter related  27.03 
 
 		 587 aa  130  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3689  ABC transporter related protein  29.47 
 
 		 560 aa  130  9.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1657  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.16 
 
 		 555 aa  130  9.000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  24.75 
 
 		 600 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2311  ABC transporter related  25.8 
 
 		 695 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.28541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  26.04 
 
 		 583 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1345  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.42 
 
 		 599 aa  129  1.0000000000000001e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0100192  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1961  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.34 
 
 		 586 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  21.92 
 
 		 585 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>