More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3025 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3025  ABC transporter transmembrane region  100 
 
 		 619 aa  1174    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.946814  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3825  ABC transporter transmembrane region  50.27 
 
 		 514 aa  348  2e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0381949  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1593  ABC transporter related protein  41.68 
 
 		 587 aa  253  7e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.317799  normal  0.0625099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0856  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  34.25 
 
 		 566 aa  207  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6064  ABC transporter related protein  35.44 
 
 		 575 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2406  ABC transporter related  37.13 
 
 		 570 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3472  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.79 
 
 		 564 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00244165  hitchhiker  0.00122928 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3727  ABC transporter related  33.85 
 
 		 578 aa  187  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202459  normal  0.0336359 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3689  ABC transporter related protein  35.98 
 
 		 560 aa  183  7e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.84 
 
 		 597 aa  182  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5067  ABC transporter related  39.02 
 
 		 549 aa  169  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3041  ABC transporter transmembrane region  31.67 
 
 		 615 aa  166  8e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8453  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  30.48 
 
 		 564 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00619084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4060  ABC transporter related protein  31.75 
 
 		 570 aa  162  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.282527  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28420  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.95 
 
 		 607 aa  159  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.520014 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0698  ABC transporter transmembrane region  31.28 
 
 		 612 aa  157  7e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3048  ABC transporter related  30.92 
 
 		 584 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.522258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0419  ABC transporter related protein  28.95 
 
 		 574 aa  155  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.937876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5182  ABC transporter related  32.75 
 
 		 578 aa  153  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.459442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37360  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.21 
 
 		 619 aa  152  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2082  ABC transporter transmembrane region  30.78 
 
 		 575 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.09 
 
 		 588 aa  142  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2573  ABC transporter related protein  30.99 
 
 		 619 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0847371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0647  ABC transporter transmembrane region  27.57 
 
 		 589 aa  131  4.0000000000000003e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.415337 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0748  ABC transporter transmembrane region  35.03 
 
 		 593 aa  125  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4196  ABC transporter transmembrane region  30.24 
 
 		 580 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00643785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  23.52 
 
 		 589 aa  113  9e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  21.03 
 
 		 589 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0809  ABC transporter ATP-binding/permease  23.41 
 
 		 586 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00766142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0852  ABC transporter permease/ATP-binding protein  23.41 
 
 		 586 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.58 
 
 		 586 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.55 
 
 		 586 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  23.41 
 
 		 586 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  23.41 
 
 		 586 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.41 
 
 		 586 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  23.84 
 
 		 586 aa  111  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.83 
 
 		 586 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1555  ABC transporter related  31.84 
 
 		 601 aa  109  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.289579  hitchhiker  0.00295387 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.96 
 
 		 574 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.75 
 
 		 574 aa  109  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1548  ABC transporter related  26.49 
 
 		 593 aa  108  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.985805  normal  0.0736759 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0319  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  23.08 
 
 		 455 aa  106  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.15 
 
 		 632 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  22.94 
 
 		 607 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1141  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  21.9 
 
 		 586 aa  105  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1058  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  26.13 
 
 		 588 aa  105  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.61208  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  23.4 
 
 		 584 aa  104  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  24.9 
 
 		 603 aa  103  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3253  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  26.4 
 
 		 589 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.052561  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  21.75 
 
 		 578 aa  102  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  22.16 
 
 		 586 aa  101  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10431  ABC transporter  23.45 
 
 		 547 aa  101  4e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503648  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  24.34 
 
 		 614 aa  101  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  21.13 
 
 		 585 aa  101  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2019  ABC transporter related  25.4 
 
 		 590 aa  101  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.990408 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  25.19 
 
 		 603 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  25.73 
 
 		 582 aa  100  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  25.51 
 
 		 598 aa  100  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  26.33 
 
 		 592 aa  100  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1982  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.36 
 
 		 594 aa  99.4  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  20.66 
 
 		 738 aa  99.4  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0117  ABC transporter related  21 
 
 		 573 aa  98.6  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00018995  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.6 
 
 		 593 aa  98.6  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  22.91 
 
 		 468 aa  97.8  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  25.9 
 
 		 579 aa  97.8  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1722  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27 
 
 		 594 aa  97.8  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.031974 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2313  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  27.98 
 
 		 622 aa  97.8  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0680321 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4432  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.81 
 
 		 548 aa  97.4  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000325117  normal  0.0473884 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1055  ABC transporter related protein  20.23 
 
 		 571 aa  97.1  8e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  21.23 
 
 		 727 aa  97.1  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1889  ABC transporter related  24.82 
 
 		 590 aa  97.1  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.19709  normal  0.932579 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  24.57 
 
 		 601 aa  96.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4572  ABC transporter, transmembrane region  23.4 
 
 		 546 aa  96.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0246  ABC lipid efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  24.65 
 
 		 590 aa  96.3  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  26.95 
 
 		 580 aa  96.7  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10431  ABC transporter  23.19 
 
 		 548 aa  96.3  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0117  ABC transporter related  22.18 
 
 		 582 aa  95.9  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0973  multidrug ABC transporter  23.17 
 
 		 568 aa  95.9  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  25.81 
 
 		 588 aa  95.5  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  23.65 
 
 		 578 aa  95.9  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0460  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.06 
 
 		 581 aa  95.5  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  22.27 
 
 		 601 aa  95.5  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.27279 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2950  ATP-binding protein  28.88 
 
 		 1218 aa  95.1  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.03128e-16 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  20.54 
 
 		 581 aa  95.5  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  21.8 
 
 		 566 aa  95.1  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  28.52 
 
 		 1284 aa  94.7  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0500  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  25.32 
 
 		 590 aa  94.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.863518  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  23.94 
 
 		 980 aa  94  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  20 
 
 		 581 aa  94  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2969  ATP binding cassette  27.98 
 
 		 1218 aa  94  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365409 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2916  ATP binding cassette  29.16 
 
 		 1218 aa  93.6  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.352142  normal  0.12308 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2886  ATP binding cassette  29.16 
 
 		 1218 aa  93.6  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  23.33 
 
 		 575 aa  93.6  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0971  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.03 
 
 		 594 aa  93.2  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.82 
 
 		 579 aa  93.2  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3072  ATP binding cassette  29.16 
 
 		 1218 aa  93.6  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003564  ATP-binding component of a transport system  23.36 
 
 		 579 aa  93.2  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0008  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  26.76 
 
 		 590 aa  93.2  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  26.12 
 
 		 726 aa  93.2  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0591  ABC transporter-related protein  22.71 
 
 		 566 aa  92.4  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>