More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3825 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3825  ABC transporter transmembrane region  100 
 
 		 514 aa  967    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0381949  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3025  ABC transporter transmembrane region  51.18 
 
 		 619 aa  340  4e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.946814  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1593  ABC transporter related protein  42.38 
 
 		 587 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.317799  normal  0.0625099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3472  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  40.41 
 
 		 564 aa  213  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00244165  hitchhiker  0.00122928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2406  ABC transporter related  36.02 
 
 		 570 aa  199  7.999999999999999e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3727  ABC transporter related  33.57 
 
 		 578 aa  192  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202459  normal  0.0336359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8453  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  32.92 
 
 		 564 aa  189  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00619084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0856  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  31.94 
 
 		 566 aa  186  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5067  ABC transporter related  38.91 
 
 		 549 aa  181  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3689  ABC transporter related protein  33.98 
 
 		 560 aa  160  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3041  ABC transporter transmembrane region  30.84 
 
 		 615 aa  158  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327338 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3048  ABC transporter related  32.03 
 
 		 584 aa  153  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.522258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.67 
 
 		 588 aa  149  9e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0419  ABC transporter related protein  29.07 
 
 		 574 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.937876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4060  ABC transporter related protein  31.26 
 
 		 570 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.282527  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28420  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.57 
 
 		 607 aa  143  8e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.520014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2082  ABC transporter transmembrane region  31 
 
 		 575 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0698  ABC transporter transmembrane region  30.6 
 
 		 612 aa  137  7.000000000000001e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5182  ABC transporter related  30.85 
 
 		 578 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.459442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0647  ABC transporter transmembrane region  28.23 
 
 		 589 aa  133  9e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.415337 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4196  ABC transporter transmembrane region  31.8 
 
 		 580 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00643785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2573  ABC transporter related protein  31.11 
 
 		 619 aa  127  7e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0847371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1127  ABC transporter transmembrane region  33.77 
 
 		 580 aa  118  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.23 
 
 		 597 aa  118  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0748  ABC transporter transmembrane region  33.6 
 
 		 593 aa  117  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  23.48 
 
 		 586 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  21.73 
 
 		 581 aa  104  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  24.87 
 
 		 588 aa  104  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  24.34 
 
 		 586 aa  103  8e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1515  ABC transporter related  21.18 
 
 		 577 aa  102  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37360  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.62 
 
 		 619 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.41 
 
 		 572 aa  101  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1258  hypothetical protein  21.06 
 
 		 578 aa  100  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4572  ABC transporter, transmembrane region  25 
 
 		 546 aa  99.8  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  24.89 
 
 		 598 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1274  ABC transporter related protein  23.5 
 
 		 572 aa  99  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11299  drug ABC transporter ATP-binding protein  27.6 
 
 		 582 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  23.96 
 
 		 572 aa  96.7  8e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  21.66 
 
 		 606 aa  95.5  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  22.35 
 
 		 580 aa  94.7  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1548  ABC transporter related  28.63 
 
 		 593 aa  94.7  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.985805  normal  0.0736759 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  22.18 
 
 		 593 aa  94.7  4e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  20.93 
 
 		 588 aa  94  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1371  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  23.32 
 
 		 587 aa  94  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680862  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0647  ABC transporter related  24.71 
 
 		 641 aa  94  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3343  ABC transporter related  30.87 
 
 		 591 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  25.41 
 
 		 614 aa  93.2  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  22.24 
 
 		 586 aa  92  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1564  ABC transporter related  22.01 
 
 		 577 aa  92  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  22.2 
 
 		 575 aa  92  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  24.21 
 
 		 585 aa  91.7  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  24.9 
 
 		 578 aa  91.7  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  22.07 
 
 		 586 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0807  ABC transporter related  26.29 
 
 		 577 aa  91.3  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  21.24 
 
 		 597 aa  90.9  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8741  carbohydrate ABC transporter  25.39 
 
 		 577 aa  90.5  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  21.24 
 
 		 597 aa  90.5  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  22.96 
 
 		 577 aa  90.1  9e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  21.45 
 
 		 583 aa  89.4  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  21.9 
 
 		 586 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  21.33 
 
 		 566 aa  89.7  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  21.9 
 
 		 586 aa  89  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  21.9 
 
 		 586 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  25.33 
 
 		 579 aa  89  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  21.38 
 
 		 586 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09021  ABC transporter  21.19 
 
 		 548 aa  88.2  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3756  ABC transporter related  26.38 
 
 		 581 aa  87.8  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0241948  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1316  ABC transporter related  24.15 
 
 		 784 aa  87.8  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512065  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.47 
 
 		 577 aa  88.2  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  21.9 
 
 		 586 aa  87.8  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1823  ATPase  27.45 
 
 		 581 aa  87.4  5e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  23.25 
 
 		 644 aa  87.4  6e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4037  ABC transporter related protein  25.11 
 
 		 764 aa  87.4  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.238544  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  26.16 
 
 		 598 aa  87.4  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1895  ABC transporter related  22.59 
 
 		 581 aa  87  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0786  ABC transporter related  28.41 
 
 		 577 aa  87  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757117  hitchhiker  0.00608544 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  19.43 
 
 		 581 aa  86.7  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  24.94 
 
 		 579 aa  86.7  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10431  ABC transporter  21.46 
 
 		 547 aa  87  8e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503648  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  22.68 
 
 		 577 aa  87  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0809  ABC transporter ATP-binding/permease  21.51 
 
 		 586 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00766142  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6064  ABC transporter related protein  59.77 
 
 		 575 aa  86.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0852  ABC transporter permease/ATP-binding protein  21.51 
 
 		 586 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3308  ABC transporter related  21.83 
 
 		 586 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682367  hitchhiker  0.0000512121 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  22.5 
 
 		 604 aa  86.3  0.000000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  24.35 
 
 		 577 aa  86.7  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.22 
 
 		 590 aa  86.3  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0830  ABC transporter related  27.61 
 
 		 612 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000934514 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1118  ABC transporter, transmembrane region  22.59 
 
 		 606 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.7 
 
 		 613 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  21.58 
 
 		 587 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  24.36 
 
 		 717 aa  85.9  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  25.58 
 
 		 1016 aa  85.9  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  25.64 
 
 		 726 aa  85.5  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  27.02 
 
 		 613 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  27.66 
 
 		 614 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  25.41 
 
 		 601 aa  85.1  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2765  ABC transporter related protein  26.67 
 
 		 695 aa  84.7  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  20.35 
 
 		 582 aa  85.1  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  21.37 
 
 		 584 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>