More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3308 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2164  ABC transporter transmembrane region  62.16 
 
 		 585 aa  712    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1095  ABC transporter related protein  60.68 
 
 		 587 aa  714    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850281  normal  0.198173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3308  ABC transporter related  100 
 
 		 586 aa  1202    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682367  hitchhiker  0.0000512121 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2232  ABC transporter related  62.8 
 
 		 586 aa  738    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  34.66 
 
 		 597 aa  351  2e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  34.66 
 
 		 597 aa  350  3e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.57 
 
 		 598 aa  335  1e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.57 
 
 		 598 aa  333  4e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  33.28 
 
 		 605 aa  333  6e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  33.39 
 
 		 598 aa  330  6e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.69 
 
 		 598 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.03 
 
 		 598 aa  326  6e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  32.89 
 
 		 614 aa  326  6e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  32.44 
 
 		 597 aa  325  1e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  32.74 
 
 		 620 aa  323  4e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  33.63 
 
 		 594 aa  323  5e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  32.75 
 
 		 607 aa  322  8e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  33.81 
 
 		 598 aa  321  3e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  32.35 
 
 		 598 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.35 
 
 		 598 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.35 
 
 		 598 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.52 
 
 		 598 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.35 
 
 		 598 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  32.5 
 
 		 600 aa  319  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  32.97 
 
 		 617 aa  316  8e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  32.11 
 
 		 608 aa  315  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  34.59 
 
 		 620 aa  313  4.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  32 
 
 		 617 aa  308  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  31.69 
 
 		 607 aa  306  9.000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  30.43 
 
 		 622 aa  301  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  32.09 
 
 		 609 aa  300  4e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  31.09 
 
 		 597 aa  299  1e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  30.95 
 
 		 582 aa  298  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  32.34 
 
 		 594 aa  296  5e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  30.27 
 
 		 618 aa  295  2e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  30.91 
 
 		 637 aa  293  8e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  29.38 
 
 		 625 aa  292  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0545  ABC transporter related  30.69 
 
 		 602 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  29.58 
 
 		 635 aa  291  2e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7144  ABC transporter related  31.52 
 
 		 632 aa  291  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3227  ABC transporter-related protein  31.73 
 
 		 675 aa  289  8e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1379  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.86 
 
 		 615 aa  289  9e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1690  ABC transporter related  29.36 
 
 		 607 aa  288  2e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  31.51 
 
 		 632 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  30.59 
 
 		 602 aa  287  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  29.37 
 
 		 590 aa  287  4e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  31.1 
 
 		 634 aa  287  4e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  31.22 
 
 		 594 aa  287  5e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  28.47 
 
 		 588 aa  285  1.0000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1071  ABC transporter related protein  30.29 
 
 		 733 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3955  ABC transporter, transmembrane region  30.49 
 
 		 631 aa  286  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375009  decreased coverage  0.0046772 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  29.98 
 
 		 600 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.78 
 
 		 589 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  30.09 
 
 		 592 aa  284  3.0000000000000004e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3941  ABC transporter, transmembrane region  30.49 
 
 		 631 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4015  ABC transporter, transmembrane region  30.49 
 
 		 631 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2690  multidrug resistance ABC transporter  31.1 
 
 		 615 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0586583  normal  0.13127 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  30.62 
 
 		 611 aa  283  6.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  33.01 
 
 		 618 aa  283  7.000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  30.49 
 
 		 611 aa  283  8.000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0148  ABC transporter related  31.11 
 
 		 628 aa  283  9e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  29.59 
 
 		 614 aa  282  1e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  29.97 
 
 		 611 aa  282  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  30.43 
 
 		 609 aa  282  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1770  ABC transporter related  30.82 
 
 		 610 aa  281  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.686344  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  32.13 
 
 		 598 aa  281  2e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.36 
 
 		 618 aa  281  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1823  ABC transporter related  32.81 
 
 		 586 aa  281  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3822  ABC transporter transmembrane region  29.73 
 
 		 605 aa  281  3e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568746  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.69 
 
 		 702 aa  281  3e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1961  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.35 
 
 		 586 aa  281  3e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  30.45 
 
 		 666 aa  280  4e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.35 
 
 		 586 aa  280  4e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.487064  hitchhiker  1.72644e-17 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  31.75 
 
 		 608 aa  280  4e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  29.84 
 
 		 640 aa  280  5e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0266  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.14 
 
 		 632 aa  280  6e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.358191  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  34.69 
 
 		 636 aa  280  7e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.39 
 
 		 721 aa  278  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.08 
 
 		 609 aa  278  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  29.08 
 
 		 610 aa  278  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2040  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.54 
 
 		 586 aa  278  3e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  29.39 
 
 		 613 aa  278  3e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  33.4 
 
 		 556 aa  277  4e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  30.73 
 
 		 598 aa  277  4e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2061  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.35 
 
 		 586 aa  277  4e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000211326  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  29.55 
 
 		 589 aa  277  4e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  31.69 
 
 		 672 aa  277  5e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  29.23 
 
 		 631 aa  276  6e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  31.53 
 
 		 610 aa  276  9e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  28.71 
 
 		 669 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  29.86 
 
 		 587 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1990  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.51 
 
 		 586 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.43486e-48 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  32.16 
 
 		 594 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1789  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.51 
 
 		 586 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11697  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1771  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  30.34 
 
 		 586 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  28.03 
 
 		 604 aa  275  2.0000000000000002e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  33.2 
 
 		 649 aa  275  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3379  ABC transporter transmembrane region  29.5 
 
 		 646 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0207  ABC transporter related  29.88 
 
 		 602 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.361271  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  28.99 
 
 		 626 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>