More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4781 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4781  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 265 aa  523  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2459  IclR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.383582  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0217  transcriptional regulator, IclR family  40.77 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5059  transcriptional regulator, IclR family  39.11 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.941275 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3127  IclR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 267 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4941  putative IclR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 301 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  32.44 
 
 		 308 aa  90.9  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  30.91 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1276  regulatory protein IclR  28.32 
 
 		 271 aa  89.7  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  31.4 
 
 		 260 aa  89.4  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 255 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1583  IclR-type transcriptional regulator  31.52 
 
 		 291 aa  86.3  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  35.57 
 
 		 254 aa  86.3  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4402  regulatory proteins, IclR  33.99 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  32.94 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  31.11 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1639  IclR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0495627  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  32.6 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2981  transcriptional regulator, IclR family  31.2 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1062  IclR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.154207  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  27.45 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  32.63 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1420  transcriptional regulator, IclR family  34.17 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.956914 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  28.5 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0373  IclR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  28.06 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  30.08 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 295 aa  78.6  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4192  transcriptional regulator, IclR family  31.34 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  29.96 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4080  transcriptional regulator, IclR family  31.34 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3087  IclR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0787215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3800  putative transcriptional regulator  28.81 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3842  putative transcriptional regulator  28.81 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312233  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3903  putative transcriptional regulator  28.81 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3734  putative transcriptional regulator  28.81 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3846  transcriptional regulator, IclR family  32.58 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3598  IclR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213229  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1534  regulatory protein, IclR  27.23 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  31.55 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2809  transcriptional regulator, IclR family  28.45 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  34.21 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  32.34 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2199  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  34.55 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.745324  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  30.2 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2092  transcriptional regulator, IclR family  29.01 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321928 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  32.31 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  28.65 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  32.37 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6385  transcriptional regulator, IclR family  33.92 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.040112  normal  0.0189266 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0043  transcriptional regulator, IclR family  31.1 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  29 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3524  transcriptional regulator, IclR family  32.13 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4271  IclR family transcriptional regulator family  29.78 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3497  IclR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2788  transcriptional regulator, IclR family  27.93 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.031926 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0462  regulatory proteins, IclR  28.89 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  30.05 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4215  regulatory proteins, IclR  31.38 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  26.19 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  33.68 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  27.49 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1836  transcriptional regulator, IclR family  32.75 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0146542 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0530  IclR family transcriptional regulator  26 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3480  transcriptional regulator, IclR family  26.48 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  28.29 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  28.29 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  30.24 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2780  transcriptional regulator, IclR family  32.92 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  31.18 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0906  regulatory proteins, IclR  27.89 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 282 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1594  IclR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0349  IclR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000127041  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1621  IclR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706324  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1646  IclR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4689  transcriptional regulator, IclR family  27.47 
 
 		 254 aa  72  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1454  IclR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 253 aa  72  0.000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  26.34 
 
 		 253 aa  72  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2508  regulatory proteins, IclR  32.3 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.750932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2347  IclR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  36.04 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1587  IclR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 229 aa  72  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 260 aa  72  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  31.37 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>