More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1477 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1477  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 237 aa  454  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.958166  normal  0.570733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6007  transcriptional regulator, IclR family  72.56 
 
 		 233 aa  288  5.0000000000000004e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.325748  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09050  transcriptional regulator  70 
 
 		 220 aa  286  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.976325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3216  Transcriptional regulator IclR  67.76 
 
 		 244 aa  283  1.0000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  68.37 
 
 		 233 aa  278  6e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  68.37 
 
 		 233 aa  278  6e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  68.37 
 
 		 233 aa  278  6e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  66.97 
 
 		 233 aa  275  5e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2849  transcriptional regulator, IclR family  68 
 
 		 241 aa  271  7e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4228  regulatory protein, IclR  65.6 
 
 		 233 aa  269  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13004  transcriptional regulator  67.43 
 
 		 233 aa  268  8e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 241 aa  239  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3299  regulatory proteins, IclR  57.56 
 
 		 240 aa  237  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395884  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1148  IclR family transcriptional regulator  58.41 
 
 		 228 aa  235  5.0000000000000005e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.554824  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1257  regulatory protein, IclR  58.85 
 
 		 228 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411018  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8050  transcriptional regulator, IclR family  57.98 
 
 		 238 aa  232  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  61.29 
 
 		 238 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5000  transcriptional regulator, IclR family  57.08 
 
 		 232 aa  231  7.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272233  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1686  transcriptional regulator, IclR family  57.14 
 
 		 246 aa  231  1e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.698509  normal  0.0109367 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3464  transcriptional regulator, IclR family  57.14 
 
 		 239 aa  228  5e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108588  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8019  putative transcriptional regulator, IclR  54.2 
 
 		 238 aa  228  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11090  transcriptional regulator, IclR family  56.84 
 
 		 239 aa  228  8e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2358  transcriptional regulator, IclR family  56.96 
 
 		 239 aa  226  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0625  regulatory proteins, IclR  55.22 
 
 		 240 aa  226  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916177  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2317  transcriptional regulator, IclR family  56.84 
 
 		 239 aa  226  3e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1572  transcriptional regulator, IclR family  56.84 
 
 		 240 aa  225  6e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0184  transcriptional regulator, IclR family  55.31 
 
 		 244 aa  223  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1595  IclR-type transcriptional regulator  53.25 
 
 		 266 aa  222  3e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18570  transcriptional regulator, IclR family  55.36 
 
 		 244 aa  221  6e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.424296  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4054  transcriptional regulator, IclR family  59.81 
 
 		 233 aa  218  7.999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1357  Transcriptional regulator IclR  58.72 
 
 		 238 aa  216  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.775388 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2520  IclR family transcriptional regulator  54.2 
 
 		 239 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463274  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2257  transcriptional regulator, IclR family  53.78 
 
 		 239 aa  215  5e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000173115 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08730  transcriptional regulator  55.95 
 
 		 258 aa  210  1e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00649547  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1112  IclR family transcriptional regulator  54.81 
 
 		 307 aa  210  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.794209 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3622  IclR family transcriptional regulator  58.11 
 
 		 235 aa  207  8e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.464151 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0276  IclR family transcriptional regulator  49.79 
 
 		 237 aa  171  6.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0195  transcriptional regulator, IclR family  33.19 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 255 aa  99  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 255 aa  99.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 255 aa  99  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 255 aa  99  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 255 aa  99  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 255 aa  99.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  32.14 
 
 		 252 aa  95.5  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  29.54 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  30.97 
 
 		 251 aa  89.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0652  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 246 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2384  IclR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 246 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  35.75 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0811  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 246 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1774  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 246 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.227269  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 257 aa  86.3  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1095  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 246 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470095  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1171  transcriptional regulator  29.58 
 
 		 246 aa  85.1  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 272 aa  85.1  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  32.55 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  32.55 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  28.39 
 
 		 254 aa  81.6  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  29.32 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4689  transcriptional regulator, IclR family  30.54 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3835  transcriptional regulator, IclR family  31.7 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.790714  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4142  putative IclR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000218071  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 259 aa  78.6  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  31 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  32.57 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0364  IclR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2718  transcriptional regulator, IclR family  29.88 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0454  transcriptional regulator, IclR family  32.91 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  31.6 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2360  regulatory proteins, IclR  31.42 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4891  IclR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3296  IclR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5543  regulatory protein, IclR  28.11 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452687  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3341  IclR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  34.21 
 
 		 257 aa  72  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  24.66 
 
 		 263 aa  72  0.000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  31.06 
 
 		 249 aa  72  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 260 aa  72  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  32.23 
 
 		 290 aa  72  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  30.43 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>