More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5900 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5900  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 482 aa  902    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4471  major facilitator superfamily MFS_1  71.73 
 
 		 487 aa  510  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5926  major facilitator superfamily MFS_1  47.37 
 
 		 480 aa  310  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 494 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6826  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 523 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0629  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 499 aa  112  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4178  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 		 503 aa  108  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0115  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 		 554 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.434385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 678 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4203  major facilitator transporter  33.22 
 
 		 506 aa  105  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318181  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1507  major facilitator transporter  32.71 
 
 		 457 aa  100  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000169816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3651  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 517 aa  100  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4127  major facilitator superfamily MFS_1  28.2 
 
 		 485 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.773525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 		 491 aa  99  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.839802 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2831  putative membrane transport protein  27.4 
 
 		 485 aa  97.8  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.017692  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1811  major facilitator superfamily MFS_1  31.45 
 
 		 492 aa  97.8  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  32.67 
 
 		 474 aa  94.4  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7243  putative transmembrane efflux protein  29.6 
 
 		 476 aa  93.6  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.279533 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  23.97 
 
 		 477 aa  93.2  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5274  hypothetical protein  29.56 
 
 		 477 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355684  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1004  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 473 aa  91.7  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1011  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 473 aa  89.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4123  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 488 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.625658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1765  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 471 aa  87.8  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.719018  decreased coverage  0.000452829 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0898  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 464 aa  87.8  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3397  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 504 aa  87.4  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3936  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 650 aa  87  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7073  Arabinose efflux permease-like protein  33.05 
 
 		 492 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0186  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 475 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2262  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 484 aa  83.2  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000865567  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00710  arabinose efflux permease family protein  30.86 
 
 		 487 aa  82.8  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.909323  normal  0.190181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4068  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 		 484 aa  82.4  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1789  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 512 aa  82  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 		 474 aa  82.4  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6965  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 548 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.69368  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3828  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 643 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  0.17414 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3842  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 643 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3916  major facilitator superfamily transporter  28.61 
 
 		 643 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2888  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 482 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.293011  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2255  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 480 aa  77  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1968  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 491 aa  76.6  0.0000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.632276 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0082  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 474 aa  75.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.91 
 
 		 520 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4677  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 482 aa  75.1  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0312  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 473 aa  74.7  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  27.07 
 
 		 683 aa  73.9  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0887  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 494 aa  73.6  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3811  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 		 512 aa  73.6  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4687  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 479 aa  73.2  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  29.4 
 
 		 561 aa  72.8  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.4 
 
 		 511 aa  73.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.31 
 
 		 514 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4140  major facilitator superfamily MFS_1  24.83 
 
 		 512 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347022  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5903  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 		 487 aa  71.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.53 
 
 		 510 aa  70.9  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.79 
 
 		 592 aa  70.5  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.53 
 
 		 503 aa  70.9  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2070  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 502 aa  70.1  0.00000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0320  transporter, major facilitator family protein  26.29 
 
 		 474 aa  70.1  0.00000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.196123 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.18 
 
 		 537 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5354  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.87 
 
 		 449 aa  69.3  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759907  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1011  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.04 
 
 		 522 aa  69.3  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0869  major facilitator superfamily MFS_1  23.73 
 
 		 487 aa  68.2  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.03 
 
 		 537 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  22.31 
 
 		 472 aa  67.8  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0339  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.64 
 
 		 554 aa  67.8  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.64 
 
 		 515 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.6 
 
 		 526 aa  67.8  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10798  multi-drug resistance integral membrane efflux protein emrB  28.62 
 
 		 540 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.79 
 
 		 521 aa  66.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.18 
 
 		 515 aa  65.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 		 448 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1295  putative membrane transport protein  27.45 
 
 		 500 aa  65.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1001  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 470 aa  65.1  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.141392  normal  0.0130853 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.79 
 
 		 539 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3140  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 479 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4784  major facilitator superfamily MFS_1  29.77 
 
 		 498 aa  65.1  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122812  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2569  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 487 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1177  MFS permease  24.23 
 
 		 520 aa  64.7  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2614  major facilitator superfamily transporter  29.61 
 
 		 487 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.4 
 
 		 641 aa  64.3  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.56 
 
 		 607 aa  64.7  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 500 aa  64.7  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.48 
 
 		 534 aa  64.3  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.32 
 
 		 480 aa  63.9  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2149  drug resistance transporter  25.32 
 
 		 480 aa  63.9  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2392  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.32 
 
 		 480 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.32 
 
 		 480 aa  63.9  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0773  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 518 aa  63.5  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2608  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 487 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.21 
 
 		 475 aa  63.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.25 
 
 		 570 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.08 
 
 		 685 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0888  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.24 
 
 		 486 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2133  drug resistance transporter  24.89 
 
 		 480 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.24 
 
 		 486 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2320  putative membrane transport protein  33.65 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3385  major facilitator superfamily transporter  27.18 
 
 		 489 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318101 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  33.51 
 
 		 457 aa  61.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.57 
 
 		 534 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>