88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2403 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2403  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  100 
 
 		 268 aa  517  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0523  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  44.87 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300278  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5773  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  47.73 
 
 		 265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14713  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  40.68 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  42.97 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5997  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  45.45 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2857  formylmethanofurane dehydrogenase subunit, putative  43.49 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000000505673  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0022  formylmethanofuran dehydrogenase  37.92 
 
 		 272 aa  176  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1824  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  42.8 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2159  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  43.18 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0901303 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2626  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  42.26 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5932  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  40.74 
 
 		 274 aa  169  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0388185  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6507  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  38.38 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0305137 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2464  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  37.73 
 
 		 281 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3064  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  37.83 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3133  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  37.23 
 
 		 281 aa  149  7e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1421  glutamate synthase alpha subunit domain protein  34 
 
 		 291 aa  121  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  33.19 
 
 		 415 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0201  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  33.03 
 
 		 307 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0127762  normal  0.0655916 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0875  formylmethanofuran dehydrogenase  30.38 
 
 		 266 aa  113  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.118005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  31.37 
 
 		 415 aa  113  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.52 
 
 		 415 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1793  glutamate synthase alpha subunit  38.26 
 
 		 267 aa  108  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607708  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1442  formylmethanofuran dehydrogenase  37.14 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  27.24 
 
 		 425 aa  105  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0618  formylmethanofuran dehydrogenase  29.64 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.031501  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2233  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.22 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.0399291 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  27.2 
 
 		 272 aa  102  7e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  30.74 
 
 		 257 aa  102  9e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  28.21 
 
 		 424 aa  102  9e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1990  formylmethanofuran dehydrogenase  34.11 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114316  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  27.92 
 
 		 289 aa  99.4  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1290  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  30.4 
 
 		 301 aa  99.4  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1473  formylmethanofuran dehydrogenase  29.41 
 
 		 275 aa  99.4  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.143119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  27.24 
 
 		 272 aa  97.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  26.87 
 
 		 272 aa  96.7  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0246  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  28.27 
 
 		 266 aa  92.8  5e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.314224 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2112  formylmethanofuran dehydrogenase  30.09 
 
 		 254 aa  92.8  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0370  formylmethanofuran dehydrogenase  28.03 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1981  formylmethanofuran dehydrogenase  25.21 
 
 		 332 aa  85.5  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1189  glutamate synthase alpha subunit  29.49 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0283  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  27.59 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.363907  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0575  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  26.2 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00575915  decreased coverage  0.000443842 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  30.67 
 
 		 568 aa  62.8  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  31.88 
 
 		 572 aa  62.4  0.000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  30.96 
 
 		 568 aa  62.4  0.000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1198  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C (tungsten)  39.52 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  32.5 
 
 		 553 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1069  glutamate synthase alpha subunit  35.35 
 
 		 312 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1607  tungsten containing formylmethanofruran dehydrogenase subunit C-related protein  34.34 
 
 		 313 aa  52  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6007  glutamate synthase alpha subunit  30.86 
 
 		 228 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.607641  decreased coverage  0.00322278 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1083  glutamate synthase alpha subunit  34.38 
 
 		 320 aa  51.6  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.386486  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0458  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  31.18 
 
 		 230 aa  51.2  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951315  normal  0.387952 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1869  putative glutamate synthase  27.71 
 
 		 225 aa  50.4  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310557  normal  0.791624 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0562  glutamate synthase alpha subunit  25.73 
 
 		 242 aa  50.4  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  28.48 
 
 		 252 aa  50.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5750  formyl-methanofuran dehydrogenase  28.57 
 
 		 228 aa  48.9  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87428  glutamate synthase  27.27 
 
 		 2126 aa  48.5  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1503  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.61 
 
 		 1530 aa  48.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0878  glutamate synthase alpha subunit  29.6 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.225814  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3292  glutamate synthase alpha subunit  33.33 
 
 		 228 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  31.36 
 
 		 670 aa  47.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  29.27 
 
 		 240 aa  47.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6576  glutamate synthase alpha subunit domain protein  28.03 
 
 		 228 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.026671 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5639  glutamate synthase alpha subunit domain protein  29.09 
 
 		 228 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4809  glutamate synthase alpha subunit  29.73 
 
 		 229 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453145  hitchhiker  0.00411559 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0956  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  33.33 
 
 		 256 aa  45.8  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1657  glutamate synthase alpha subunit  29.09 
 
 		 229 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1574  glutamate synthase alpha subunit domain protein  29.09 
 
 		 229 aa  45.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1127  hypothetical protein  32.43 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000223973  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1939  glutamate synthase alpha subunit domain protein  29.09 
 
 		 229 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0525  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C-like  32.56 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.618523  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3523  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.21 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0202692 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5920  glutamate synthase alpha subunit  29.6 
 
 		 232 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.413716 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2024  glutamate synthase alpha subunit  28.93 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_945  glutamate synthase-like protein protein, alpha subunit-like protein  32.43 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4805  glutamate synthase alpha subunit domain protein  31.58 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  29.03 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  29.03 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1943  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  31.3 
 
 		 227 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513232 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  32.14 
 
 		 281 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0168  glutamate synthase alpha subunit  38.67 
 
 		 229 aa  43.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16290  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  23.42 
 
 		 245 aa  43.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.518041  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0890  glutamate synthase (ferredoxin)  31.62 
 
 		 1536 aa  43.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00390315  decreased coverage  0.000127994 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1176  glutamate synthase (NADPH) large subunit  31.58 
 
 		 1479 aa  42.7  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1345  glutamate synthase, alpha subunit-like  26.03 
 
 		 227 aa  42.4  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00926  glutamate synthase subunit alpha  36.94 
 
 		 1487 aa  42.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1982  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.3 
 
 		 1521 aa  42.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349695  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>