More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2193 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2193  multidrug resistance protein MdtN  100 
 
 		 350 aa  694    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2119  multidrug resistance protein MdtN  68.86 
 
 		 349 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4352  multidrug resistance protein MdtN  60.86 
 
 		 349 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4510  multidrug resistance protein MdtN  60.23 
 
 		 349 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.803564  normal  0.0531786 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3975  multidrug resistance protein MdtN  59.71 
 
 		 349 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.337491  normal  0.0140757 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4112  multidrug resistance protein MdtN  57.95 
 
 		 349 aa  401  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.718729  normal  0.0575764 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5580  multidrug resistance protein MdtN  58.52 
 
 		 349 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541238 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4577  multidrug resistance protein MdtN  57.95 
 
 		 349 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.603811  hitchhiker  0.0000103156 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3647  multidrug resistance protein MdtN  58.52 
 
 		 349 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00582079  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4720  multidrug resistance protein MdtN  58.52 
 
 		 349 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623543 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1056  multidrug resistance protein MdtN  58.24 
 
 		 349 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0195  multidrug resistance protein MdtN  58 
 
 		 362 aa  385  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0296812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0535  multidrug resistance protein MdtN  52.8 
 
 		 349 aa  328  7e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0596  multidrug resistance protein MdtN  52.8 
 
 		 349 aa  328  7e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789434  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1061  multidrug resistance protein MdtN  52.48 
 
 		 349 aa  327  2.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.182652 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0241  multidrug resistance protein MdtN  47.77 
 
 		 344 aa  278  7e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5590  multidrug resistance protein MdtN  39.87 
 
 		 343 aa  202  7e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03914  hypothetical protein  40.19 
 
 		 343 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03954  predicted membrane fusion protein of efflux pump  40.19 
 
 		 343 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3910  efflux pump membrane protein  40.13 
 
 		 343 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4639  multidrug resistance protein MdtN  40.19 
 
 		 343 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4327  multidrug resistance protein MdtN  40.19 
 
 		 343 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3945  multidrug resistance protein MdtN  40.19 
 
 		 343 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6554  multidrug resistance protein MdtN  39.09 
 
 		 351 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.89511 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4546  multidrug resistance protein MdtN  39.87 
 
 		 343 aa  199  5e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2191  secretion protein HlyD family protein  30.97 
 
 		 354 aa  136  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  29.85 
 
 		 331 aa  130  3e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  29.25 
 
 		 331 aa  127  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0660  secretion protein HlyD family protein  30.34 
 
 		 402 aa  126  5e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  30.18 
 
 		 347 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  27.65 
 
 		 347 aa  120  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2743  secretion protein HlyD family protein  28.78 
 
 		 364 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2821  secretion protein HlyD family protein  28.9 
 
 		 364 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0257  secretion protein, HlyD family  32.31 
 
 		 337 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.787376  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0434  secretion protein HlyD family protein  32.31 
 
 		 337 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.532566  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0234  secretion protein HlyD family protein  31.66 
 
 		 321 aa  119  9e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  29.88 
 
 		 380 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1060  HlyD family secretion protein  28.9 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.409643  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3003  secretion protein HlyD family protein  30.23 
 
 		 288 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104161  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  31.35 
 
 		 404 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2681  secretion protein HlyD  27.76 
 
 		 289 aa  116  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879116  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0758  HlyD family secretion protein  27.58 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0191383  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2322  RND family efflux transporter MFP subunit  29.88 
 
 		 315 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.140996 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  30.65 
 
 		 374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4163  HlyD family secretion protein  26.47 
 
 		 373 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  27.76 
 
 		 401 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4053  secretion protein HlyD family protein  30.7 
 
 		 349 aa  113  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.861449 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2293  secretion protein  30.89 
 
 		 365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  29.34 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  31.46 
 
 		 368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2162  secretion protein HlyD family protein  30.09 
 
 		 291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.876023  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  26.39 
 
 		 359 aa  109  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4935  RND family efflux transporter MFP subunit  29.94 
 
 		 316 aa  109  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06903  histidine kinase  29.55 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2912  secretion protein HlyD family protein  28.53 
 
 		 364 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1904  secretion protein, HlyD family  27.56 
 
 		 373 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382262  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0516  secretion protein HlyD family protein  31.61 
 
 		 389 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44200  multidrug efflux pump membrane fusion protein  30.57 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2451  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0706  HlyD family secretion protein  28.21 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  26.39 
 
 		 366 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0238  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.91 
 
 		 315 aa  106  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1855  MFP family transporter  25.15 
 
 		 285 aa  106  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284898  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  25.46 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  25.46 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  25.46 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01614  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  25.15 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.880107  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1836  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  24.85 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1554  MFP family transporter  25.46 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01604  hypothetical protein  25.15 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.787651  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4857  RND family efflux transporter MFP subunit  30.84 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  30.06 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2356  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  25.15 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000721779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  26.65 
 
 		 467 aa  104  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4580  secretion protein HlyD family protein  27.76 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0263  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  27.7 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  30.06 
 
 		 351 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7637  efflux pump protein  30.1 
 
 		 385 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001143  fusaric acid resistance protein fusE  26.81 
 
 		 296 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1266  secretion protein HlyD family protein  27.89 
 
 		 286 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  29.69 
 
 		 352 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1803  secretion protein HlyD family protein  27.6 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0487  secretion protein HlyD  30.38 
 
 		 387 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.132982 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  29.69 
 
 		 352 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  28.02 
 
 		 366 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2656  secretion protein HlyD  27.91 
 
 		 326 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6854  HlyD family secretion protein  29.32 
 
 		 304 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  29.69 
 
 		 352 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  28.74 
 
 		 366 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5245  secretion protein HlyD family protein  30.09 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  29.69 
 
 		 352 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  28.61 
 
 		 372 aa  103  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000902  multidrug resistance efflux pump  31.31 
 
 		 311 aa  103  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0203  secretion protein HlyD family protein  28.32 
 
 		 291 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0094  secretion protein HlyD family protein  29.91 
 
 		 328 aa  103  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  30.54 
 
 		 413 aa  103  7e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5668  secretion protein HlyD family protein  30.1 
 
 		 367 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1783  secretion protein HlyD family protein  29.71 
 
 		 352 aa  102  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  29.8 
 
 		 351 aa  102  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0178  secretion protein HlyD family protein  28.32 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.590801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0199  secretion protein HlyD family protein  28.32 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.232672  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>