More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1824 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1824  response regulator receiver protein  100 
 
 		 124 aa  242  9.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0653482 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3276  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 135 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2580  response regulator receiver protein  44.86 
 
 		 133 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2118  response regulator receiver protein  43.52 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1743  response regulator receiver protein  38.74 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.961506 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1362  response regulator receiver domain-containing protein  39.47 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0400  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4054  response regulator receiver domain-containing protein  33.91 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1341  response regulator receiver  39.82 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0630  response regulator FixJ  40.35 
 
 		 204 aa  77.8  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136769  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2866  response regulator receiver protein  44.55 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.216907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2829  response regulator receiver protein  44.55 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  40.91 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2343  response regulator receiver protein  37.27 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1268  two component LuxR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2460  response regulator receiver protein  39.09 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.732516  normal  0.518565 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8084  response regulator receiver protein  39.62 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2461  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6108  response regulator receiver protein  43.75 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0506844 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4219  two component LuxR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1905  response regulator receiver domain-containing protein  33.64 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.558841  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2095  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 216 aa  71.2  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.94 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3890  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 184 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.173819 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 208 aa  70.5  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7251  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 133 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4728  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  39.45 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0583  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1204  two component LuxR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1552  response regulator receiver protein  39.6 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2787  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.058704  normal  0.0692516 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3728  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5523  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1546  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0280611  normal  0.028816 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2791  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.94 
 
 		 213 aa  67.8  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1621  two component LuxR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6273  response regulator FixJ  36.36 
 
 		 204 aa  67.4  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.544702 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 208 aa  67.4  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0401  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 208 aa  67.4  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.91 
 
 		 201 aa  67  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2117  response regulator FixJ  34.82 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1027  response regulator receiver  33.33 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4282  two component LuxR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5741  response regulator receiver protein  41.12 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621186  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  35.51 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001012  putative two-component response regulator  36.36 
 
 		 408 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4101  two component LuxR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.878116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  38 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2967  response regulator receiver protein  36.45 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135716 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6982  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3007  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  34.91 
 
 		 210 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2568  response regulator protein  35.4 
 
 		 214 aa  64.3  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0467638  hitchhiker  0.0000000292578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4053  response regulator FixJ  33.64 
 
 		 205 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1699  response regulator receiver domain-containing protein  36.44 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000935694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 213 aa  63.9  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5240  response regulator  35.4 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3913  helix-turn-helix, Fis-type  38.05 
 
 		 442 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.289305  normal  0.253976 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1906  response regulator FixJ  37.38 
 
 		 205 aa  63.9  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.700153  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6494  response regulator receiver protein  40.19 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1466  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5150  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.56838 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2968  two component LuxR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 207 aa  63.5  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003036  tetrathionate reductase two-component response regulator  33.33 
 
 		 200 aa  63.5  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2681  response regulator receiver protein  35.58 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1028  response regulator FixJ  36.45 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07090  nitrogen regulation protein NtrX  34.55 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4947  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 469 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.669147  hitchhiker  0.0000241398 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0588  Fis family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 458 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.651672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  30.7 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2222  response regulator FixJ  33.33 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  34.95 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6313  putative two-component response regulator  35.45 
 
 		 447 aa  62  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.86051  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18020  sigma54-dependent response regulator of C4 dicarboxylate transport, two component; DctD  36.36 
 
 		 446 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266513  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4294  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 461 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.595978 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5502  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.020979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3506  response regulator receiver  35.24 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.32714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3813  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.24 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  31.78 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  32.76 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3199  two component LuxR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.529866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4961  two component LuxR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373586  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2912  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 455 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  33.93 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  32.2 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3793  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1955  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275329  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2669  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 439 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0245  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4410  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 444 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>