201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1067 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1067  major facilitator transporter  100 
 
 		 396 aa  770    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1609  major facilitator transporter  44.85 
 
 		 410 aa  319  5e-86  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.655483 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2623  major facilitator superfamily MFS_1  36.81 
 
 		 398 aa  211  1e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.600696  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0952  major facilitator superfamily MFS_1  32.02 
 
 		 381 aa  162  1e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000396638  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0722  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 391 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0889  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 359 aa  100  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3986  major facilitator superfamily MFS_1  25.79 
 
 		 418 aa  93.6  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1379  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 		 438 aa  83.6  0.000000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0358  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0556  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.968297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0736  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00989309 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2910  transport protein  25.19 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464136  decreased coverage  0.0000430598 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1359  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0437  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2689  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0230105 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3090  hypothetical protein  25.5 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1635  major facilitator transporter  22.01 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.402698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20110  major facilitator superfamily MFS_1  21.76 
 
 		 447 aa  65.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1249  major facilitator transporter  22 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000314091 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3709  major facilitator transporter  23.26 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.682847  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6354  major facilitator transporter  25.72 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3766  major facilitator superfamily MFS_1  22.45 
 
 		 407 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 443 aa  56.2  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3849  major facilitator superfamily MFS_1  22.57 
 
 		 407 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5608  major facilitator transporter  22.37 
 
 		 397 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338314 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4101  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 437 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  31.1 
 
 		 443 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5304  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 445 aa  53.9  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00630409  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0669  general substrate transporter  33.33 
 
 		 438 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.543796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2489  major facilitator transporter  22.78 
 
 		 399 aa  53.1  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00111531  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  32.55 
 
 		 436 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  22.19 
 
 		 433 aa  53.1  0.000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2346  peptide permease  24.35 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0385238  hitchhiker  0.0021515 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  27.9 
 
 		 437 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  32.42 
 
 		 439 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6196  major facilitator transporter  18.89 
 
 		 413 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226919 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  27.9 
 
 		 437 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 		 406 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0899  major facilitator transporter  22.65 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1095  major facilitator transporter  31.45 
 
 		 477 aa  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0309  major facilitator transporter  20.78 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0224718  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5425  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 		 438 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.460942  normal  0.126626 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2213  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 515 aa  50.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927283  normal  0.0909458 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0558  major facilitator superfamily MFS_1  23.73 
 
 		 417 aa  50.1  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.76436  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2103  major facilitator transporter  22.87 
 
 		 422 aa  50.1  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941752  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 		 439 aa  50.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2899  peptide permease  23.91 
 
 		 404 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5174  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 441 aa  49.7  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  33.02 
 
 		 438 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  25.19 
 
 		 398 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  31.15 
 
 		 438 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 432 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  33.02 
 
 		 438 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  24.91 
 
 		 437 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 432 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4645  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 441 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3518  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 447 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0238  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 437 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 447 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 433 aa  47.8  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3400  tranporter transmembrane protein  24.16 
 
 		 421 aa  47.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2247  General substrate transporter  32.43 
 
 		 436 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.286148 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  25.76 
 
 		 398 aa  47.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4983  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 441 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  24.05 
 
 		 433 aa  47.4  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  25.52 
 
 		 429 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5758  major facilitator protein family permease  27.33 
 
 		 443 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  26.85 
 
 		 370 aa  47.4  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0514  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 		 391 aa  47.4  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 438 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 438 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5191  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 430 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3059  sugar transporter transmembrane protein  26.29 
 
 		 431 aa  47  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.45158 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2528  multidrug resistance protein  25.19 
 
 		 398 aa  47  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1882  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 393 aa  47  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.36796  normal  0.170219 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0365  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 441 aa  46.6  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5468  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 437 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350259  normal  0.0257067 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0376  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 		 420 aa  46.6  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0618  major facilitator transporter  21.86 
 
 		 423 aa  46.6  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3614  major facilitator superfamily MFS_1  23.65 
 
 		 439 aa  46.6  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 472 aa  46.2  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  28.83 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  31.45 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5228  major facilitator transporter  19.8 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  32.37 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1297  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 439 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0389845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0070  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3292  major facilitator superfamily MFS_1  23.65 
 
 		 439 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3486  General substrate transporter  24.86 
 
 		 439 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  32.37 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  26.32 
 
 		 445 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  32.37 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  32.37 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  26.32 
 
 		 445 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  26.32 
 
 		 445 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>