More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2247 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2290  general substrate transporter  96.32 
 
 		 436 aa  796    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.931887  normal  0.162976 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2247  General substrate transporter  100 
 
 		 436 aa  844    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.286148 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0669  general substrate transporter  84.63 
 
 		 438 aa  699    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.543796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2565  General substrate transporter  96.32 
 
 		 436 aa  796    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0129523 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5758  major facilitator protein family permease  49.16 
 
 		 443 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1033  major facilitator family transporter  46.39 
 
 		 473 aa  319  7e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  42.66 
 
 		 432 aa  308  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4506  MFS family substrate transporter  45.52 
 
 		 434 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0158803 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1100  major facilitator family transporter  45.91 
 
 		 438 aa  300  5e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.513292  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0383  major facilitator family transporter  45.91 
 
 		 438 aa  300  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0766  major facilitator family transporter  45.91 
 
 		 438 aa  300  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1862  major facilitator family transporter  45.91 
 
 		 426 aa  299  6e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760818  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1404  major facilitator family transporter  45.66 
 
 		 482 aa  299  7e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1266  major facilitator family transporter  45.91 
 
 		 429 aa  299  7e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1258  major facilitator family transporter  45.66 
 
 		 485 aa  298  9e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1409  major facilitator superfamily MFS_1  45.12 
 
 		 434 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0554976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  41.26 
 
 		 439 aa  296  4e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1451  major facilitator superfamily MFS_1  44.88 
 
 		 434 aa  296  5e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384828  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  42.72 
 
 		 443 aa  295  9e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  42.48 
 
 		 443 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  41.26 
 
 		 439 aa  293  5e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  44.08 
 
 		 445 aa  292  9e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  43.84 
 
 		 445 aa  292  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  43.84 
 
 		 445 aa  292  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  43.84 
 
 		 445 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  43.84 
 
 		 445 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2097  general substrate transporter  42.03 
 
 		 424 aa  291  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00320357  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  43.8 
 
 		 420 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  41.47 
 
 		 443 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  41.47 
 
 		 443 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  41.47 
 
 		 443 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  41.37 
 
 		 443 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  41.83 
 
 		 440 aa  286  7e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5468  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 437 aa  285  8e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350259  normal  0.0257067 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55220  MFS family transporter  47.51 
 
 		 438 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.872465  hitchhiker  0.00000012197 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  41.29 
 
 		 433 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6354  major facilitator transporter  39.53 
 
 		 442 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  41.98 
 
 		 425 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3059  sugar transporter transmembrane protein  36.99 
 
 		 431 aa  276  6e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.45158 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  41.36 
 
 		 425 aa  275  9e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  41.36 
 
 		 425 aa  275  9e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  41.36 
 
 		 425 aa  275  9e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  39.01 
 
 		 431 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  41.75 
 
 		 425 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2710  major facilitator transporter  42.42 
 
 		 438 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  41.56 
 
 		 437 aa  273  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  41.37 
 
 		 425 aa  274  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2996  major facilitator transporter  41.57 
 
 		 433 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271761 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  40.55 
 
 		 448 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  39.12 
 
 		 443 aa  272  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  39.11 
 
 		 440 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 425 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4140  major facilitator transporter  37.27 
 
 		 431 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  39.73 
 
 		 453 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 435 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3049  major facilitator transporter  41.69 
 
 		 433 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  39.66 
 
 		 430 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2703  major facilitator transporter  42.15 
 
 		 535 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.318275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  39.66 
 
 		 430 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  39.66 
 
 		 430 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  39.66 
 
 		 430 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  39.66 
 
 		 417 aa  269  7e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  39.66 
 
 		 430 aa  269  7e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  41.9 
 
 		 437 aa  269  7e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  39.66 
 
 		 430 aa  269  7e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5418  major facilitator protein family permease  42.86 
 
 		 434 aa  269  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.540224  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  39.81 
 
 		 435 aa  269  8e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  39.95 
 
 		 435 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  39.95 
 
 		 435 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2584  major facilitator transporter  42.42 
 
 		 438 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.801174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2169  major facilitator superfamily MFS_1  41.01 
 
 		 440 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  39.95 
 
 		 435 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  39.42 
 
 		 466 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  39.86 
 
 		 435 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  41.65 
 
 		 437 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.58 
 
 		 430 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2992  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  36.74 
 
 		 433 aa  267  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  39.86 
 
 		 435 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  39.05 
 
 		 443 aa  266  7e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  39.29 
 
 		 427 aa  265  8e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3084  major facilitator transporter  42.21 
 
 		 433 aa  266  8e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3339  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  36.51 
 
 		 437 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0903  general substrate transporter  36.81 
 
 		 431 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.289816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0891  general substrate transporter  37 
 
 		 431 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5813  major facilitator transporter  41.41 
 
 		 440 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0625628  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4806  MFS family transporter  47.42 
 
 		 438 aa  263  6e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.163599  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0204  major facilitator family transporter  41.21 
 
 		 437 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289201  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  41.22 
 
 		 499 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2370  general substrate transporter  36.34 
 
 		 477 aa  262  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4101  major facilitator transporter  38.75 
 
 		 437 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  38.61 
 
 		 430 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1949  general substrate transporter  37.05 
 
 		 429 aa  261  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0986  general substrate transporter  38.21 
 
 		 431 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535486  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 436 aa  259  6e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1618  citrate-proten symporter  36.34 
 
 		 431 aa  259  7e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1027  general substrate transporter  38.21 
 
 		 431 aa  259  8e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3029  General substrate transporter  35.5 
 
 		 433 aa  259  8e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.07969  normal  0.0112235 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2600  citrate-proton symporter  36.83 
 
 		 431 aa  259  9e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.356599  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2968  citrate-proton symporter  36.83 
 
 		 431 aa  259  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0175  citrate-proton symporter  36.83 
 
 		 431 aa  259  9e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>