More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2854 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  482  1e-135  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2628  protein of unknown function DUF81  68.65 
 
 
252 aa  282  3.0000000000000004e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78898  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  55.78 
 
 
254 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  59.07 
 
 
265 aa  205  5e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  50.81 
 
 
250 aa  194  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  44.69 
 
 
299 aa  175  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  45.22 
 
 
291 aa  168  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2679  hypothetical protein  55.56 
 
 
267 aa  165  5e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  46.55 
 
 
257 aa  156  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  45.71 
 
 
291 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  45.71 
 
 
291 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  45.71 
 
 
291 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  45.9 
 
 
291 aa  150  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  38.87 
 
 
265 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  45.08 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  44.78 
 
 
303 aa  143  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  40.23 
 
 
277 aa  142  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  44.67 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  48.03 
 
 
258 aa  139  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  37.5 
 
 
266 aa  135  7.000000000000001e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  39.09 
 
 
268 aa  134  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  40.17 
 
 
252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  41.18 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  38.49 
 
 
267 aa  125  9e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  33.96 
 
 
266 aa  122  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  44.31 
 
 
255 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  45.5 
 
 
298 aa  122  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  36.1 
 
 
268 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  37.5 
 
 
302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  41.45 
 
 
301 aa  115  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0935  hypothetical protein  41.23 
 
 
256 aa  113  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142385  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  37.34 
 
 
282 aa  112  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1213  hypothetical protein  46.94 
 
 
296 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0653878 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  42.38 
 
 
250 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  41.72 
 
 
250 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  37.14 
 
 
271 aa  91.3  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  33.62 
 
 
267 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  35.43 
 
 
277 aa  91.3  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5752  hypothetical protein  39.04 
 
 
292 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2721  protein of unknown function DUF81  42.33 
 
 
254 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  31.2 
 
 
255 aa  87  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4872  hypothetical protein  30.67 
 
 
261 aa  87.8  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0137223  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  33.99 
 
 
275 aa  86.3  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  33.47 
 
 
275 aa  85.9  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  29.63 
 
 
2798 aa  83.6  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  28.69 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  30.71 
 
 
290 aa  82  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21660  predicted permease  40.34 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  34.4 
 
 
286 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  27.31 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  30.66 
 
 
276 aa  79.7  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  31.09 
 
 
268 aa  78.6  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  26.89 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  40 
 
 
261 aa  77  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2428  protein of unknown function DUF81  38.24 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0171804  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  35.14 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  30.48 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  31.56 
 
 
273 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  31.73 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  29.96 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3363  hypothetical protein  39.82 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133866  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1204  hypothetical protein  36.32 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121226  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  32 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21290  predicted permease  34.45 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.826703  normal  0.0210962 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1573  hypothetical protein  33.48 
 
 
259 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  35.06 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1801  hypothetical membrane spanning protein  31.39 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0945  hypothetical protein  29.88 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000136612  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  27.91 
 
 
267 aa  69.3  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  28.82 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2067  hypothetical protein  32.36 
 
 
288 aa  68.6  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  33.33 
 
 
257 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  34.66 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  30.09 
 
 
251 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  30.09 
 
 
251 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0529  hypothetical protein  31.11 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276386  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0247  hypothetical protein  28.05 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4089  hypothetical protein  35.24 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4245  hypothetical protein  35.24 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468612  normal  0.0890786 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4015  hypothetical protein  35.24 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0955  hypothetical protein  31.27 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.2411 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  32.28 
 
 
273 aa  65.5  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0205  hypothetical protein  29.49 
 
 
264 aa  65.1  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  28.57 
 
 
307 aa  65.1  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  28.19 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  36 
 
 
267 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  27.96 
 
 
269 aa  64.7  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3420  hypothetical protein  28.9 
 
 
269 aa  64.7  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358832 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  26.91 
 
 
306 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  24.4 
 
 
307 aa  63.9  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  27.13 
 
 
268 aa  63.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1919  hypothetical protein  36.48 
 
 
262 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  27.65 
 
 
307 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  27.69 
 
 
300 aa  64.7  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  27.27 
 
 
254 aa  63.9  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  27.65 
 
 
307 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  35.43 
 
 
272 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1999  hypothetical protein  30.8 
 
 
261 aa  63.2  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3672  protein of unknown function DUF81  28.19 
 
 
251 aa  62.8  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  30.09 
 
 
286 aa  62.8  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>