More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1383 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
378 aa  774    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  68.18 
 
 
378 aa  513  1e-144  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  46.88 
 
 
385 aa  314  1.9999999999999998e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  46.88 
 
 
385 aa  311  7.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  47.14 
 
 
385 aa  309  5e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  45.57 
 
 
385 aa  308  6.999999999999999e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  36.99 
 
 
392 aa  194  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  35.48 
 
 
386 aa  182  9.000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  35.68 
 
 
385 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 
390 aa  166  5.9999999999999996e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  32.44 
 
 
378 aa  166  6.9999999999999995e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  33.06 
 
 
388 aa  161  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 
382 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2577  putative FAD dependent oxidoreductase  32.72 
 
 
390 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.119285 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  30.16 
 
 
382 aa  146  7.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 
373 aa  144  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 
391 aa  144  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6595  FAD dependent oxidoreductase  31.94 
 
 
390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.0778916 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  31.7 
 
 
395 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  28.15 
 
 
381 aa  138  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4757  FAD dependent oxidoreductase  32.92 
 
 
390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_003296  RS02147  hypothetical protein  32.73 
 
 
398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2808  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.73 
 
 
390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2867  oxidoreductase, FAD-binding family protein  33.25 
 
 
418 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 
385 aa  134  3e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  31.77 
 
 
394 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 
383 aa  133  5e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1760  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.12 
 
 
390 aa  133  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 
496 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  31.53 
 
 
394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0571  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.9 
 
 
418 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2845  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.9 
 
 
433 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2748  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.38 
 
 
390 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.252588  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2435  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.38 
 
 
390 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0467125  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1757  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.38 
 
 
390 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283784  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3884  FAD dependent oxidoreductase  31.17 
 
 
390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2994  FAD dependent oxidoreductase  32.82 
 
 
390 aa  130  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 
500 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  31.78 
 
 
500 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 
387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  32.12 
 
 
492 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  30.63 
 
 
394 aa  126  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  27.85 
 
 
806 aa  124  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2070  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 
392 aa  123  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 
395 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 
394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5151  FAD dependent oxidoreductase  29.87 
 
 
390 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.836539  normal  0.719535 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3417  FAD dependent oxidoreductase  30.13 
 
 
390 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5250  FAD dependent oxidoreductase  30.13 
 
 
390 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2677  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 
390 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3475  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  26.5 
 
 
805 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  29.74 
 
 
392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3496  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 
405 aa  113  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0177627 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  29.77 
 
 
394 aa  113  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4046  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 
390 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 
399 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 
388 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 
376 aa  107  3e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  29.26 
 
 
393 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1461  FAD dependent oxidoreductase  30.28 
 
 
416 aa  107  5e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.719786  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1481  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 
801 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0939  FAD dependent oxidoreductase  29.92 
 
 
797 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3567  FAD dependent oxidoreductase  30.36 
 
 
381 aa  105  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.397516 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 
815 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 
383 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 
383 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 
376 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 
385 aa  103  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1527  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 
416 aa  99.8  6e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.246642  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 
806 aa  100  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  26.28 
 
 
417 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1024  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 
403 aa  99.4  8e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000324501  unclonable  1.04901e-22 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2246  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 
378 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.721245 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 
816 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  27.04 
 
 
823 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 
398 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3492  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 
378 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 
398 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 
419 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 
816 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  26.78 
 
 
816 aa  96.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1485  FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 
804 aa  97.1  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542815  normal  0.236172 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 
383 aa  96.7  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1429  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 
383 aa  96.3  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00860523 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  27.18 
 
 
417 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 
398 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2315  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 
390 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5513  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 
398 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.225549 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1242  hypothetical protein  28.69 
 
 
375 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1468  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 
375 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1877  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 
378 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 
983 aa  94  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1655  FAD dependent oxidoreductase  28.15 
 
 
415 aa  94  4e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.347417 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5112  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 
806 aa  94  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0323529 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 
388 aa  93.6  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2727  dimethylglycine dehydrogenase  26.61 
 
 
879 aa  93.2  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0222  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 
365 aa  92.8  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000376254  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  29.68 
 
 
825 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  25.26 
 
 
376 aa  92  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.957412 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>