292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4548 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4548  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
554 aa  1099    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3538  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.49 
 
 
563 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.274644  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0861  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.2 
 
 
536 aa  157  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3533  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.01 
 
 
320 aa  117  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  34.88 
 
 
790 aa  107  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3133  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.95 
 
 
588 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.84 
 
 
779 aa  94.7  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3405  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 
588 aa  93.2  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  31.43 
 
 
756 aa  91.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  29.87 
 
 
524 aa  90.5  6e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.63 
 
 
748 aa  89.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4573  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.82 
 
 
662 aa  89.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  29.37 
 
 
711 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  26.72 
 
 
753 aa  86.3  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.4 
 
 
739 aa  84.3  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  30.7 
 
 
758 aa  83.6  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2715  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  29.21 
 
 
726 aa  83.2  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.088822  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.14 
 
 
745 aa  81.3  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  28.24 
 
 
758 aa  80.1  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0649  putative lipopolysaccharide biosynthesis tyrosine kinase  24.92 
 
 
753 aa  78.2  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5360  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.82 
 
 
701 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445526  normal  0.0162612 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5390  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.59 
 
 
491 aa  77.8  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.300037 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  27.65 
 
 
736 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2463  lipopolysaccharide biosynthesis  28.37 
 
 
713 aa  77  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.718819  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2561  putative succinoglycan biosynthesis transport protein ExoP  29.63 
 
 
771 aa  76.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1220  lipopolysaccharide biosynthesis  29.63 
 
 
789 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261863  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  29.96 
 
 
756 aa  76.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  27.19 
 
 
782 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  27.5 
 
 
770 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.44 
 
 
726 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  27.67 
 
 
750 aa  75.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  25.86 
 
 
521 aa  75.1  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.87 
 
 
750 aa  74.3  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  28.33 
 
 
739 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  25.81 
 
 
756 aa  74.3  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  28.71 
 
 
745 aa  73.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1225  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.07 
 
 
724 aa  73.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0867598  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.51 
 
 
720 aa  73.2  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.3 
 
 
785 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.389826  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  28 
 
 
739 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  28 
 
 
739 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.19 
 
 
764 aa  72.4  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  24.68 
 
 
772 aa  72.4  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1122  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.45 
 
 
780 aa  72  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  26.39 
 
 
779 aa  72  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  27.67 
 
 
739 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2684  lipopolysaccharide biosynthesis  29.55 
 
 
742 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0586325  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1810  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.04 
 
 
766 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.952814 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  24.44 
 
 
492 aa  71.6  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4408  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.16 
 
 
761 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.989897  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  27.68 
 
 
736 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1859  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.55 
 
 
804 aa  70.5  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708627  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2194  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.07 
 
 
804 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.69 
 
 
726 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  26.69 
 
 
726 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  23.46 
 
 
778 aa  68.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.69 
 
 
726 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.69 
 
 
726 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1415  lipopolysaccharide biosynthesis  26.98 
 
 
715 aa  69.3  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.836118 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  26.69 
 
 
726 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.69 
 
 
726 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  25.41 
 
 
755 aa  69.3  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.69 
 
 
726 aa  69.3  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.69 
 
 
726 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  24.34 
 
 
764 aa  68.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1157  exopolysaccharide transport protein family  30.29 
 
 
720 aa  68.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.238721  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  27.19 
 
 
710 aa  68.2  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  26.73 
 
 
741 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  25.32 
 
 
748 aa  67.8  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  25 
 
 
756 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  25.42 
 
 
735 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  24.26 
 
 
746 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0854  exopolysaccharide transport protein family  29 
 
 
709 aa  67.4  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.298615 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6487  hypothetical protein  25.15 
 
 
781 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.907329 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.28 
 
 
751 aa  67.4  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  24.92 
 
 
738 aa  67  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  26.47 
 
 
736 aa  67  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  26.49 
 
 
741 aa  67  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.49 
 
 
741 aa  67  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  26.49 
 
 
741 aa  67  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4578  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.93 
 
 
491 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290602  normal  0.0783 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  26.92 
 
 
738 aa  66.6  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4703  exopolysaccharide transport protein family  25.32 
 
 
747 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5214  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.05 
 
 
774 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.49 
 
 
741 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  24.84 
 
 
720 aa  66.6  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2505  exopolysaccharide transport protein family  28.12 
 
 
735 aa  66.6  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  23.21 
 
 
529 aa  66.6  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1073  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.54 
 
 
728 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649181  normal  0.290523 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  25.25 
 
 
757 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  25.49 
 
 
741 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  24.27 
 
 
753 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  25.08 
 
 
721 aa  65.5  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0251  non-specific protein-tyrosine kinase  23.25 
 
 
751 aa  65.1  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1666  exopolysaccharide polymerization/transport protein  27.52 
 
 
747 aa  65.1  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1457  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.18 
 
 
576 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  27.75 
 
 
733 aa  64.7  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.4 
 
 
741 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2917  non-specific protein-tyrosine kinase  30.18 
 
 
268 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.513725 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2661  lipopolysaccharide biosynthesis  28.3 
 
 
773 aa  63.9  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.305468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>