213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4067 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4067  hydratase/decarboxylase  100 
 
 		 285 aa  556  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1050  hydratase/decarboxylase  63.67 
 
 		 284 aa  297  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0408  putative decarboxylase  50.93 
 
 		 276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1513  hydratase/decarboxylase  44.28 
 
 		 280 aa  178  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0537  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.14 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4537  4-oxalocrotonate decarboxylase  32 
 
 		 262 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.9 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  33.73 
 
 		 267 aa  96.3  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  30.4 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.49 
 
 		 260 aa  94.7  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  30.95 
 
 		 259 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  31.25 
 
 		 264 aa  94  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.24 
 
 		 261 aa  94  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  33.33 
 
 		 263 aa  93.2  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1354  hydratase/decarboxylase  33.33 
 
 		 262 aa  93.2  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000612409  decreased coverage  0.00000118865 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0272  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.71 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4745  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.27 
 
 		 270 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0794  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.28 
 
 		 261 aa  89.7  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  31.76 
 
 		 266 aa  89.4  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2118  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.29 
 
 		 271 aa  89  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.609149  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3342  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.16 
 
 		 262 aa  89  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2055  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.07 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0304181  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  30.08 
 
 		 265 aa  87.8  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.2 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.54 
 
 		 262 aa  87  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.94 
 
 		 263 aa  86.7  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2890  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.07 
 
 		 262 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2958  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.23 
 
 		 262 aa  86.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4208  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.78 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  28.29 
 
 		 260 aa  85.9  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3781  hydratase/decarboxylase  28.85 
 
 		 262 aa  85.5  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303669  decreased coverage  0.000202677 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5692  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.96 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2578  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.69 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  28.96 
 
 		 269 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08670  4-oxo-4-pentenoate hydratase, XylJ  30.83 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08680  4-oxalocrotonate decarboxylase.XylI  28.4 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  27.6 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0224  2-oxopent-4-enoate hydratase  31.7 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.68 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.02 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2272  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.66 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.866391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3524  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.13 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.98 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1318  hydratase/decarboxylase  28.46 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288999  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.86 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4209  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.25 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.46 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1406  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.87 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3548  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (CmtF)  30.31 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.107167 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3325  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.8 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2039  4-oxalocrotonate decarboxylase  30 
 
 		 273 aa  82  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  24.12 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0425  2-keto-4-pentenoate hydratase  28.8 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1150  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.65 
 
 		 254 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.454229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  28.86 
 
 		 260 aa  82  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.48 
 
 		 268 aa  82  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  28.57 
 
 		 260 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  28.57 
 
 		 260 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  28.8 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  28.8 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  28.8 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  27.35 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2151  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.8 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  28.8 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  28.4 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.59 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  28.4 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5436  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.85 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.635895 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5833  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.85 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4393  hydratase/decarboxylase  30.47 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.7 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.4 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3324  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.8 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  30.8 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2779  hydratase/decarboxylase  35.95 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.963348  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2784  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.78 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965988  normal  0.191345 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7646  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.33 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.573554 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00080  conserved hypothetical protein  27.31 
 
 		 387 aa  79  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3543  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.79 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0271382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0911  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.8 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.625128 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  25.9 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4619  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.79 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.118774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  29.83 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.58 
 
 		 269 aa  78.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00468493  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2961  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.72 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.81 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  30.4 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30600  4-oxalocrotonate decarboxylase; LapH  28.69 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000150281  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  26.44 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5137  hydratase/decarboxylase  32.53 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.838757  normal  0.0331511 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.93 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5500  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.76 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4569  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.67 
 
 		 264 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1651  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.38 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.452701  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01662  putative hydratase protein  30 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3512  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.58 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2327  putative 2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase(MhpD)  29.89 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2037  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  29.67 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4832  2-oxopent-4-enoate hydratase  29.96 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0838304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2125  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.66 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.740862  normal  0.868744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>