More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2793 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2793  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1379  transcriptional regulator, GntR family  78.32 
 
 		 227 aa  363  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1218  GntR domain-containing protein  78.32 
 
 		 250 aa  362  2e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1158  transcriptional regulator, GntR family  76.55 
 
 		 227 aa  356  9.999999999999999e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1839  GntR family transcriptional regulator  73.04 
 
 		 230 aa  353  8.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1233  transcriptional regulator, GntR family  73.8 
 
 		 230 aa  353  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4050  GntR family transcriptional regulator  63.32 
 
 		 230 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4842  transcriptional regulator, GntR family  63.76 
 
 		 230 aa  295  5e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283505  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0485  GntR family transcriptional regulator  58.77 
 
 		 242 aa  271  5.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1244  GntR family transcriptional regulator  56.7 
 
 		 229 aa  270  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4670  GntR family transcriptional regulator  56.7 
 
 		 239 aa  259  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  56.89 
 
 		 233 aa  259  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4357  GntR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 240 aa  253  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.899298  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6033  transcriptional regulator, GntR family  56.25 
 
 		 239 aa  251  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2268  GntR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 239 aa  251  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3622  GntR family transcriptional regulator  54.91 
 
 		 239 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3619  GntR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 239 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00335274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3115  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 243 aa  224  7e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1855  GntR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 231 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2156  transcriptional regulator, GntR family  49.57 
 
 		 243 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3426  GntR family transcriptional regulator  48.25 
 
 		 243 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.100034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2028  GntR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5951  GntR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 233 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0388156 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1523  GntR family transcriptional regulator  48.36 
 
 		 236 aa  192  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  34.52 
 
 		 239 aa  102  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 235 aa  98.2  9e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  34.47 
 
 		 237 aa  96.7  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  32.32 
 
 		 226 aa  95.9  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  37.31 
 
 		 221 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 239 aa  95.1  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 211 aa  95.1  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 232 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  37.19 
 
 		 237 aa  92.8  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 222 aa  92.8  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 244 aa  92.4  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 223 aa  91.7  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  33.7 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  33.7 
 
 		 230 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  33.7 
 
 		 228 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  34.5 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 235 aa  89.7  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  33.15 
 
 		 231 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 222 aa  89.4  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  34.67 
 
 		 233 aa  89  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 242 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 231 aa  88.2  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  33.71 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  33.75 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 255 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 222 aa  87.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 211 aa  87.4  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  32.18 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 231 aa  86.7  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  86.7  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 232 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 227 aa  86.3  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 233 aa  85.5  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  35.47 
 
 		 232 aa  85.5  6e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2445  transcriptional regulator, GntR family  33.69 
 
 		 230 aa  85.5  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  33.53 
 
 		 226 aa  85.1  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  33.91 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.15 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  34.09 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0926  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  31.73 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  35.26 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  30.21 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  34.27 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  34.09 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>