295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3674 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3674  NUDIX hydrolase  100 
 
 
175 aa  348  3e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3476  NUDIX hydrolase  83.43 
 
 
175 aa  293  6e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3784  NUDIX hydrolase  85.44 
 
 
158 aa  277  6e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3051  NUDIX hydrolase  66.88 
 
 
154 aa  193  9e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  69.78 
 
 
156 aa  191  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  65.79 
 
 
156 aa  189  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3259  NUDIX hydrolase  50.99 
 
 
168 aa  144  9e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  47.7 
 
 
193 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4195  NUDIX hydrolase  48.34 
 
 
162 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.566986 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4874  NUDIX hydrolase  47.02 
 
 
162 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2258  putative NUDIX hydrolase  51.08 
 
 
173 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2186  NUDIX hydrolase  54.14 
 
 
165 aa  136  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2633  NUDIX hydrolase  49.64 
 
 
162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.748492  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3063  NUDIX hydrolase  43.95 
 
 
158 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2799  NUDIX hydrolase  43.83 
 
 
159 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1602  NUDIX hydrolase  48.94 
 
 
151 aa  127  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973125  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  48.51 
 
 
158 aa  125  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1563  MutT/nudix family protein  47.52 
 
 
151 aa  124  6e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.752749  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1511  MutT/nudix family protein  47.52 
 
 
151 aa  124  6e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2282  NUDIX hydrolase  46.71 
 
 
163 aa  124  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3242  hypothetical protein  49.26 
 
 
132 aa  123  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4049  NUDIX hydrolase  45.32 
 
 
169 aa  121  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  48.92 
 
 
146 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0779  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 
156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0032986  normal  0.0903569 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  46.92 
 
 
156 aa  101  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  40.3 
 
 
160 aa  98.6  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3444  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.578568 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2655  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 
161 aa  67  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 
155 aa  61.6  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  40.4 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2394  NUDIX hydrolase  35.67 
 
 
191 aa  59.3  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.772855 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
166 aa  58.5  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 
150 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  34.27 
 
 
170 aa  56.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  32.46 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0784  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 
155 aa  54.7  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 
174 aa  54.7  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  36.03 
 
 
188 aa  54.7  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  32.35 
 
 
212 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  31.19 
 
 
229 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8438  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
157 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.370098 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  37.82 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  27.78 
 
 
153 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  27.78 
 
 
153 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  27.78 
 
 
153 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  27.78 
 
 
153 aa  51.6  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  27.78 
 
 
153 aa  52  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 
160 aa  51.6  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 
155 aa  52  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  27.78 
 
 
153 aa  52  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  27.78 
 
 
153 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  27.78 
 
 
153 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  43.33 
 
 
255 aa  51.2  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2547  NUDIX hydrolase  31.73 
 
 
143 aa  51.2  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0508  NUDIX hydrolase  28.12 
 
 
157 aa  50.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  hitchhiker  0.00145151 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2195  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 
156 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
194 aa  50.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 
142 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0900  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
145 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0515  ADP-ribose pyrophosphatase  28.23 
 
 
168 aa  50.1  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  35.09 
 
 
473 aa  50.1  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1249  NUDIX hydrolase  29.36 
 
 
156 aa  49.3  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000159356 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 
164 aa  49.3  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0149  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 
171 aa  49.3  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  30.25 
 
 
163 aa  48.9  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  56.52 
 
 
218 aa  48.5  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
137 aa  48.5  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1319  NUDIX hydrolase  32.29 
 
 
143 aa  48.9  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3063  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 
165 aa  48.5  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.253855  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  37.37 
 
 
150 aa  48.1  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  42.42 
 
 
136 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  29.68 
 
 
184 aa  48.1  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  24.79 
 
 
153 aa  48.1  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3701  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
144 aa  47.8  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.899383  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  38.68 
 
 
154 aa  48.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 
154 aa  47.8  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0673  NUDIX hydrolase  29.85 
 
 
158 aa  47.8  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.612507  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  38.32 
 
 
136 aa  47.4  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  37.86 
 
 
183 aa  47.8  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  32.23 
 
 
172 aa  47.8  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  41.43 
 
 
167 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1287  NUDIX hydrolase  26.79 
 
 
154 aa  47  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0960276  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  36.36 
 
 
160 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 
167 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  32.38 
 
 
144 aa  47  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 
133 aa  47  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  36.36 
 
 
160 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  48.98 
 
 
132 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2270  NUDIX hydrolase  28.78 
 
 
174 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.792713 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  38.1 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  32 
 
 
151 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0685  NUDIX hydrolase  29.86 
 
 
218 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0988  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 
150 aa  46.6  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000252657  hitchhiker  0.00430366 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  32 
 
 
151 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 
130 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 
185 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  31.11 
 
 
161 aa  46.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  50 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 
185 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  39.42 
 
 
153 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>