More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2667 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  100 
 
 		 313 aa  623  1e-177  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  63.46 
 
 		 313 aa  410  1e-113  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1796  CBS domain-containing protein  55.63 
 
 		 315 aa  360  1e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.507937  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  53.85 
 
 		 291 aa  316  3e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0750  hypothetical protein  47.67 
 
 		 291 aa  271  8.000000000000001e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  42.37 
 
 		 320 aa  256  3e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  41.46 
 
 		 331 aa  236  4e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  36.55 
 
 		 315 aa  226  6e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  39.78 
 
 		 279 aa  209  5e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  38.1 
 
 		 279 aa  205  7e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  37.36 
 
 		 279 aa  203  3e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  36.26 
 
 		 279 aa  198  9e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0630  CBS domain-containing protein  36.16 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0616  CBS domain-containing protein  29.29 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000000000848956 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  27.46 
 
 		 281 aa  109  5e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1505  CBS domain-containing protein  27.86 
 
 		 282 aa  109  5e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.206773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  27.56 
 
 		 280 aa  109  7.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  29.35 
 
 		 250 aa  106  5e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0401  signal-transduction protein  27.52 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  32.35 
 
 		 217 aa  87.8  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  32.46 
 
 		 258 aa  85.9  7e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  37.59 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  23.53 
 
 		 426 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0942  CBS domain containing membrane protein  26.27 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  28.93 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  28.57 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1479  signal-transduction protein  24.09 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.543565  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1013  CBS domain containing membrane protein  27.35 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  39.37 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  26.69 
 
 		 427 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  30.43 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  32.14 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.58 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  27.23 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  30.89 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  25.9 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  30.6 
 
 		 867 aa  72.8  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  29.55 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  29.93 
 
 		 875 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  32.41 
 
 		 863 aa  72.4  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  31.4 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  26.95 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  30.07 
 
 		 153 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  30.61 
 
 		 875 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2351  CBS domain-containing protein  29.53 
 
 		 283 aa  72  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000984272  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  32.41 
 
 		 863 aa  72  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  31.2 
 
 		 873 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2905  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  30.77 
 
 		 155 aa  70.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  29.65 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  24.9 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  28.64 
 
 		 688 aa  70.9  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  31.06 
 
 		 769 aa  70.1  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  29.95 
 
 		 380 aa  70.1  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  34.07 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  30.77 
 
 		 907 aa  70.1  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  29.71 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1797  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.966854  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1759  CBS domain-containing protein  25.09 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000639425  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  36.22 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2607  CBS domain containing membrane protein  26.4 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00560791  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  29.08 
 
 		 243 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  30.07 
 
 		 155 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  27.07 
 
 		 880 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  26.91 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0488  hypothetical protein  27.69 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  34.19 
 
 		 120 aa  68.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2095  hypothetical protein  32.28 
 
 		 164 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.040556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  27.51 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  30.2 
 
 		 150 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1899  putative signal transduction protein with CBS domains  33.86 
 
 		 149 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  33.82 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  31.3 
 
 		 216 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  30.83 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  29.37 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  30.43 
 
 		 144 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0692  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 636 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  31.88 
 
 		 165 aa  67  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  25.95 
 
 		 148 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  33.61 
 
 		 488 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  33.85 
 
 		 210 aa  67  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  29.3 
 
 		 233 aa  67  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  30.08 
 
 		 232 aa  67  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  33.06 
 
 		 148 aa  67  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  28.14 
 
 		 688 aa  67  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  32.61 
 
 		 141 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0340  signal-transduction protein  39.17 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189053  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1107  signal-transduction protein  31.97 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  26.06 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  25.87 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  25.57 
 
 		 423 aa  65.9  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  28.57 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  30.5 
 
 		 201 aa  65.1  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  30.94 
 
 		 865 aa  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3228  XRE family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 158 aa  65.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0838  signal transduction protein  27.98 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.545659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  27.36 
 
 		 225 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  36.52 
 
 		 154 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2190  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.06 
 
 		 963 aa  64.3  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>