87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6696 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6696  cell wall hydrolase SleB  100 
 
 		 235 aa  471  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6175  cell wall hydrolase SleB  75.76 
 
 		 226 aa  341  7e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2922  cell wall hydrolase SleB  63.19 
 
 		 245 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.818359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2798  cell wall hydrolase SleB  68.12 
 
 		 245 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3026  cell wall hydrolase SleB  68.12 
 
 		 245 aa  194  9e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0983766  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1671  cell wall hydrolase SleB  56.52 
 
 		 208 aa  185  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.535782  decreased coverage  0.0020174 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0765  cell wall hydrolase SleB  49.01 
 
 		 315 aa  178  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.769298  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1223  cell wall hydrolase family protein  52.66 
 
 		 284 aa  174  8e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0182396  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2145  putative lipoprotein  57.45 
 
 		 326 aa  171  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2059  putative lipoprotein  57.45 
 
 		 326 aa  169  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.332093  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5847  cell wall hydrolase SleB  59.23 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6759  cell wall hydrolase SleB  57.58 
 
 		 278 aa  158  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.582595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0543  cell wall hydrolase, SleB  57.63 
 
 		 169 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2496  hypothetical protein  54.03 
 
 		 166 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1928  cell wall hydrolase, SleB  53.33 
 
 		 169 aa  146  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.397103  normal  0.0105522 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0934  cell wall hydrolase, SleB  54.62 
 
 		 169 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0249675  normal  0.838276 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1894  hypothetical protein  58.72 
 
 		 129 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0498  cell wall hydrolase SleB  35.11 
 
 		 429 aa  72  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1860  hypothetical protein  35 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34417  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0646  cell wall hydrolase, SleB  35 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.221426 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0509  cell wall hydrolase, SleB  35 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2889  cell wall hydrolase SleB  35.38 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3115  cell wall hydrolase SleB  35.38 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0386161  normal  0.400578 
 
 
-
 
NC_004310  BR0378  hypothetical protein  34.35 
 
 		 429 aa  69.3  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3012  cell wall hydrolase SleB  36.72 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0542  cell wall hydrolase, SleB  30 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1185  cell wall hydrolase, SleB  34.56 
 
 		 409 aa  67.4  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0856  cell wall hydrolase SleB  32.56 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1044  cell wall hydrolase, SleB  34.96 
 
 		 380 aa  67  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0607  cell wall hydrolase, SleB  29.71 
 
 		 376 aa  65.5  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.356113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4323  cell wall hydrolase SleB  36.89 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2709  cell wall hydrolase SleB  31.69 
 
 		 446 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.883037  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3837  cell wall hydrolase SleB  31.01 
 
 		 365 aa  62  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1113  cell wall hydrolase SleB  51.92 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1116  cell wall hydrolase SleB  30.47 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0730  cell wall hydrolase SleB  36.51 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2483  cell wall hydrolase SleB  30.56 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.539309  normal  0.112371 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2834  cell wall hydrolase, SleB  42.71 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2848  cell wall hydrolase SleB  31.75 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0241878  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0510  cell wall hydrolase SleB  31.2 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0445  cell wall hydrolase SleB  31.2 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2361  hypothetical protein  31.54 
 
 		 496 aa  59.7  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36307  normal  0.167398 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0694  cell wall hydrolase, SleB  30.4 
 
 		 377 aa  58.9  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0552  cell wall hydrolase SleB  31.2 
 
 		 409 aa  59.3  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1244  cell wall hydrolase SleB  31.25 
 
 		 476 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.445074  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3562  hypothetical protein  30.56 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2176  cell wall hydrolase, SleB  32.33 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2212  cell wall hydrolase, SleB  30.56 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0485  cell wall hydrolase SleB  44.07 
 
 		 186 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2359  cell wall hydrolase SleB  34.38 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02539  cell Wall Hydrolase superfamily  28.36 
 
 		 153 aa  57.8  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2593  cell wall hydrolase SleB  30.53 
 
 		 432 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4342  cell wall hydrolase, SleB  30.71 
 
 		 476 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1225  cell wall hydrolase, SleB  31.5 
 
 		 474 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.31402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1104  cell wall hydrolase, SleB  31.75 
 
 		 472 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1158  cell wall hydrolase SleB  29.51 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2308  cell wall hydrolase, SleB  28.93 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2400  hypothetical protein  29.84 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.693933 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2729  cell wall hydrolase, SleB  49.09 
 
 		 229 aa  55.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4305  cell wall hydrolase SleB  36.07 
 
 		 412 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3463  cell wall hydrolase, SleB  28.68 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100975 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4104  cell wall hydrolase, SleB  40.35 
 
 		 383 aa  52.4  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.878501  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  45.28 
 
 		 197 aa  52.4  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2708  cell wall hydrolase, SleB  29.13 
 
 		 460 aa  52  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3504  cell wall hydrolase, SleB  29.13 
 
 		 466 aa  52  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0796  cell wall hydrolase SleB  28.15 
 
 		 152 aa  51.2  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.138978 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0108  cell wall hydrolase, SleB  35.79 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  32.46 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3383  cell wall hydrolase, SleB  30.21 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1776  cell wall hydrolase SleB  32.04 
 
 		 194 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  35.21 
 
 		 270 aa  46.2  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  42.11 
 
 		 546 aa  45.8  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2190  cell wall hydrolase, SleB  37.74 
 
 		 231 aa  45.8  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1881  cell wall hydrolase SleB  31.25 
 
 		 242 aa  45.1  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.131836  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1195  cell wall hydrolase, SleB  39.39 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723464  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3357  cell wall hydrolase SleB  33.87 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.17779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  45.28 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1701  cell wall hydrolase SleB  38.33 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2415  cell wall hydrolase, SleB  40 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.528951  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  32.32 
 
 		 253 aa  43.5  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  40.74 
 
 		 282 aa  43.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  39.62 
 
 		 267 aa  42.7  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  33.8 
 
 		 229 aa  42.7  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  28.81 
 
 		 247 aa  42.4  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  30.97 
 
 		 259 aa  42.4  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0899  cell wall hydrolase SleB  25.58 
 
 		 197 aa  42  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5334  hypothetical protein  26.26 
 
 		 300 aa  42  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.632965  normal  0.811239 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>