More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3969 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3969  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 280 aa  566  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1255  hypothetical protein  34.19 
 
 		 273 aa  155  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0214745 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0792  extracellular solute-binding protein  33.87 
 
 		 294 aa  145  9e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.256903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3631  extracellular solute-binding protein  31.88 
 
 		 282 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867063  normal  0.017598 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4078  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 277 aa  135  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2694  extracellular solute-binding protein family 3  28.26 
 
 		 277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5590  extracellular solute-binding protein family 3  26.47 
 
 		 277 aa  116  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5243  extracellular solute-binding protein family 3  31.4 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.517304  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6259  extracellular solute-binding protein family 3  29.59 
 
 		 270 aa  99  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000314466  normal  0.29457 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4588  extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0319028  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4837  extracellular solute-binding protein family 3  31.58 
 
 		 276 aa  89  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.630065  normal  0.0224847 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5260  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 277 aa  86.7  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3696  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589095  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3233  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.638648 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00417  prephrenate dehydratase  26.72 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002034  cyclohexadienyl dehydratase  26.72 
 
 		 258 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0782  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0690  extracellular solute-binding protein  30.18 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370968  normal  0.982005 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1455  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.37 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000239011  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0477  extracellular solute-binding protein family 3  25.27 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.225572 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2490  extracellular solute-binding protein family 3  26.27 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5170  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  33.13 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2237  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0917749  hitchhiker  0.00000401987 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2257  amino-acid-binding periplasmic ABC transporter protein  29.71 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.780862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2685  extracellular solute-binding protein family 3  27.09 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0288477 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3891  Arogenate dehydratase  30 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0109  arogenate dehydratase  29.38 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1534  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 		 253 aa  67  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.195786  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2597  extracellular solute-binding protein family 3  23.93 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189611  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  29.64 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0043  cyclohexadienyl dehydratase  28.81 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  30.36 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1872  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 		 306 aa  65.5  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  30.34 
 
 		 264 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3481  extracellular solute-binding protein  33.73 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.742913  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0736  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.580874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0100  prephenate dehydratase  28.25 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688966  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2375  Arogenate dehydratase  26.38 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.380609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0891  extracellular solute-binding protein family 3  29.65 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1344  extracellular solute-binding protein family 3  25 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.752805 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.56 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2462  extracellular solute-binding protein family 3  29.41 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2069  extracellular solute-binding protein family 3  29.41 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0404874  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4123  cyclohexadienyl dehydratase  30.69 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0829887  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2779  Arogenate dehydratase  26.38 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0125  arogenate dehydratase  28.25 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0111  prephenate dehydratase  30.34 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.669855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2945  prephenate dehydratase  28.25 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0273907  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0110  prephenate dehydratase  28.25 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3814  cyclohexadienyl dehydratase  27.98 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.607683  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3291  cyclohexadienyl dehydratase  25.45 
 
 		 266 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.87694  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2512  putative cyclohexadienyl dehydratase precursor signal peptide protein  26.21 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.204589  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2961  cyclohexadienyl dehydratase  26.87 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  24.22 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3627  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  36.9 
 
 		 178 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3024  arogenate dehydratase  26.05 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3021  cyclohexadienyl dehydratase  26.87 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329674  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3958  hypothetical protein  53.97 
 
 		 70 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3350  cyclohexadienyl dehydratase  26.87 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1581  cyclohexadienyl dehydratase  26.87 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0614  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  29.69 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0124  extracellular solute-binding protein family 3  24.47 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7227  extracellular solute-binding protein  29.45 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1254  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.91 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1808  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.91 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.655664  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0395  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.91 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364587  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3305  cyclohexadienyl dehydratase  26.57 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1824  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.91 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0726824  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0767  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.91 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0133342  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  29.52 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1737  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.91 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.084035  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0172  cyclohexadienyl dehydratase  26.87 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1977  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.91 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3964  cyclohexadienyl dehydratase  26.87 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4037  cyclohexadienyl dehydratase  26.87 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  32.83 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4388  extracellular solute-binding protein family 3  30.57 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2022  extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.167722  normal  0.899953 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3070  extracellular solute-binding protein  23.11 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.966648  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  26.96 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  28.93 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  27.64 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3585  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1946  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  24 
 
 		 485 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000538211  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3959  extracellular solute-binding protein  22.03 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0691  extracellular solute-binding protein  28.5 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1548  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.05 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159181  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0127  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.06 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1912  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  24 
 
 		 485 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000291813  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.71 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  28.65 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.25 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3228  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 		 609 aa  56.6  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>