More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0680 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0680  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 282 aa  585  1e-166  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2112  diaminopimelate epimerase  59.71 
 
 		 285 aa  320  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3160  diaminopimelate epimerase  55.23 
 
 		 310 aa  295  4e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000134357  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3880  diaminopimelate epimerase  57.39 
 
 		 286 aa  283  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.28993  normal  0.0214025 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0171  Diaminopimelate epimerase  48.57 
 
 		 286 aa  275  5e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3790  diaminopimelate epimerase  47.52 
 
 		 268 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0468247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2751  diaminopimelate epimerase  46.79 
 
 		 268 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2337  diaminopimelate epimerase  49.62 
 
 		 282 aa  241  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0778  Diaminopimelate epimerase  43.66 
 
 		 285 aa  219  3e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.961561  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  37.76 
 
 		 283 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  35.84 
 
 		 284 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  36.59 
 
 		 278 aa  183  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  37.99 
 
 		 278 aa  182  7e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  36.56 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  37.19 
 
 		 282 aa  180  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  37.28 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  35.51 
 
 		 278 aa  179  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  36.56 
 
 		 278 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  36.59 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1893  diaminopimelate epimerase  37.86 
 
 		 278 aa  176  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.593063  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  35.97 
 
 		 284 aa  176  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  33.93 
 
 		 277 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  37.14 
 
 		 278 aa  175  7e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  36.07 
 
 		 282 aa  175  9e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  34.75 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  35.74 
 
 		 277 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  36.46 
 
 		 277 aa  172  5e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  35.74 
 
 		 277 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  36.46 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  35.25 
 
 		 288 aa  170  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  35.25 
 
 		 288 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  36.2 
 
 		 278 aa  169  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5045  diaminopimelate epimerase  35.25 
 
 		 288 aa  168  8e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  34.89 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  34.89 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  34.89 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  34.89 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  34.63 
 
 		 292 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  34.27 
 
 		 288 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 		 308 aa  166  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  36.8 
 
 		 269 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  33.57 
 
 		 288 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  37.91 
 
 		 279 aa  165  6.9999999999999995e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  33.94 
 
 		 281 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  34.63 
 
 		 368 aa  165  9e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  34.89 
 
 		 288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  34.42 
 
 		 280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  36.33 
 
 		 274 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  34.53 
 
 		 288 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  35.99 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  33.58 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  35.87 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  35.87 
 
 		 279 aa  162  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  34.53 
 
 		 290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4756  diaminopimelate epimerase  34.53 
 
 		 288 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  34.25 
 
 		 292 aa  162  7e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  34.66 
 
 		 278 aa  162  8.000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  36.04 
 
 		 355 aa  161  1e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  34.78 
 
 		 272 aa  160  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  34.78 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0232  diaminopimelate epimerase  36.9 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596238  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0183  diaminopimelate epimerase  35.87 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190067  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  35.52 
 
 		 284 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  34.02 
 
 		 292 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  32.52 
 
 		 407 aa  159  5e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1610  diaminopimelate epimerase  36.11 
 
 		 274 aa  159  6e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  34.49 
 
 		 288 aa  158  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  35.31 
 
 		 286 aa  158  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4166  diaminopimelate epimerase  35.16 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3983  diaminopimelate epimerase  35.69 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.983346  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  34.31 
 
 		 281 aa  156  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4269  diaminopimelate epimerase  35.71 
 
 		 274 aa  156  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  34.66 
 
 		 280 aa  156  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  35.11 
 
 		 286 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03685  diaminopimelate epimerase  35.32 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.163573  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4170  Diaminopimelate epimerase  35.32 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.837067  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4227  diaminopimelate epimerase  34.92 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.642483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4334  diaminopimelate epimerase  34.92 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4328  diaminopimelate epimerase  35.32 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4157  diaminopimelate epimerase  34.92 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4275  diaminopimelate epimerase  34.92 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4175  diaminopimelate epimerase  34.92 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132697  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  33.81 
 
 		 280 aa  155  6e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00309  diaminopimelate epimerase  36.13 
 
 		 276 aa  155  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4198  diaminopimelate epimerase  35.32 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4175  diaminopimelate epimerase  35.32 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03634  hypothetical protein  35.32 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.191697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4034  diaminopimelate epimerase  35.32 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5248  diaminopimelate epimerase  35.32 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 277 aa  155  7e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002111  diaminopimelate epimerase  35.77 
 
 		 276 aa  155  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3444  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 291 aa  155  8e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  34.4 
 
 		 280 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  32.14 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  34.72 
 
 		 286 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  31.77 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3256  diaminopimelate epimerase  35.84 
 
 		 289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.220746  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  34.42 
 
 		 283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0266  diaminopimelate epimerase  36.86 
 
 		 276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5228  diaminopimelate epimerase  37.59 
 
 		 287 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>