More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0049 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  63.22 
 
 		 712 aa  911    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 703 aa  1449    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  46.87 
 
 		 710 aa  655    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  56.27 
 
 		 731 aa  790    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  48.3 
 
 		 711 aa  661    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  46.88 
 
 		 688 aa  613  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  43.7 
 
 		 690 aa  590  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  42.21 
 
 		 704 aa  583  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  40.95 
 
 		 713 aa  535  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  40.52 
 
 		 675 aa  519  1e-146  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  39.6 
 
 		 696 aa  511  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  33.9 
 
 		 687 aa  351  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  32.75 
 
 		 774 aa  317  3e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  32.75 
 
 		 774 aa  317  3e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  32.75 
 
 		 774 aa  317  6e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  32.6 
 
 		 774 aa  316  7e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  32.6 
 
 		 774 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  32.24 
 
 		 731 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  32.09 
 
 		 717 aa  310  5.9999999999999995e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  32.67 
 
 		 782 aa  310  8e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  32.43 
 
 		 782 aa  308  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  31.76 
 
 		 774 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  32.17 
 
 		 721 aa  303  9e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  31.75 
 
 		 774 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 		 721 aa  300  5e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  30.96 
 
 		 693 aa  295  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  31.73 
 
 		 784 aa  292  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  31.27 
 
 		 777 aa  289  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  31.08 
 
 		 809 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  31.9 
 
 		 784 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  30.94 
 
 		 809 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  31.07 
 
 		 809 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  29.82 
 
 		 708 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  30.94 
 
 		 809 aa  283  9e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  29.37 
 
 		 807 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  30.87 
 
 		 720 aa  272  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  30.89 
 
 		 784 aa  271  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  31.44 
 
 		 723 aa  270  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 782 aa  196  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  26.98 
 
 		 705 aa  158  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 700 aa  155  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0445  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 734 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000342866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0590  putative TonB-dependent receptor protein  25.61 
 
 		 737 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000188689  decreased coverage  0.000190482 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 727 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3109  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 738 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0242785  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0312  iron(III) dicitrate transport protein, outer membrane receptor  21.64 
 
 		 807 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.670307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0023  TonB-dependent receptor  23.16 
 
 		 747 aa  112  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  23.3 
 
 		 701 aa  112  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 821 aa  112  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1760  TonB-dependent heme receptor  23.23 
 
 		 664 aa  110  7.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3037  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 736 aa  110  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117014 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  25.71 
 
 		 721 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  24.13 
 
 		 695 aa  109  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0818  TonB-dependent receptor, plug  30.32 
 
 		 518 aa  108  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000136965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4532  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 813 aa  108  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.885203  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 675 aa  106  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 714 aa  104  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  24.21 
 
 		 653 aa  103  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 702 aa  102  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6744  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 731 aa  103  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.468719 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 688 aa  102  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  23.64 
 
 		 696 aa  100  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08506  outer membrane receptor protein  22.65 
 
 		 846 aa  99.8  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 698 aa  99.4  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 698 aa  99.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  23.72 
 
 		 696 aa  99.8  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 698 aa  99.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 694 aa  99  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  23.72 
 
 		 653 aa  98.2  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0485  TonB-dependent receptor  23.07 
 
 		 702 aa  97.4  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517963  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4681  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 704 aa  96.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0656736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  21.99 
 
 		 697 aa  96.7  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  24.1 
 
 		 724 aa  95.9  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  23.57 
 
 		 653 aa  95.9  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 652 aa  94.7  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  24.09 
 
 		 653 aa  95.1  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 698 aa  95.1  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  24.08 
 
 		 746 aa  94.4  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  24.11 
 
 		 744 aa  94.4  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  30.1 
 
 		 706 aa  94.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  29.77 
 
 		 706 aa  94  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  29.77 
 
 		 706 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  25.85 
 
 		 681 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  29.77 
 
 		 706 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 713 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2724  TonB-dependent receptor  22.12 
 
 		 709 aa  93.2  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424768 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  29.93 
 
 		 728 aa  92.8  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 653 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  24.46 
 
 		 653 aa  92.8  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  21.69 
 
 		 730 aa  92.8  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  24.42 
 
 		 744 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  24.63 
 
 		 744 aa  92  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  23.92 
 
 		 708 aa  91.7  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  21.88 
 
 		 656 aa  91.7  5e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  22.89 
 
 		 713 aa  91.3  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 653 aa  91.3  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  24.26 
 
 		 653 aa  90.9  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  23.47 
 
 		 746 aa  90.5  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 665 aa  89  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  21.98 
 
 		 704 aa  89.4  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>