236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2249 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2249  beta-lactamase  100 
 
 
468 aa  957    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  36.08 
 
 
467 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  35.41 
 
 
467 aa  224  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  35.27 
 
 
466 aa  213  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  34.95 
 
 
473 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  34.95 
 
 
473 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  34.73 
 
 
473 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_004310  BR1041  hypothetical protein  33.79 
 
 
440 aa  208  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1007  hypothetical protein  33.56 
 
 
440 aa  205  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  34.61 
 
 
455 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2024  beta-lactamase  31.22 
 
 
468 aa  193  6e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770914  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.12 
 
 
468 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  31.97 
 
 
456 aa  190  5e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2612  beta-lactamase  32.65 
 
 
472 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2128  beta-lactamase  32.11 
 
 
443 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165199  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2872  beta-lactamase  31.66 
 
 
475 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  32.69 
 
 
449 aa  184  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2109  beta-lactamase  32.77 
 
 
453 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  36.84 
 
 
481 aa  178  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2913  Hydrolatse transmembrane protein  30.61 
 
 
459 aa  168  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  37.06 
 
 
378 aa  167  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  29.98 
 
 
491 aa  164  3e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3990  beta-lactamase  29.79 
 
 
522 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1816  beta-lactamase  30.18 
 
 
494 aa  143  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.403938 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  33.44 
 
 
374 aa  142  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1749  Beta-lactamase  32.56 
 
 
496 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2093  beta-lactamase  29.82 
 
 
497 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  34.01 
 
 
383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  31.81 
 
 
416 aa  130  5.0000000000000004e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  33.65 
 
 
432 aa  130  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3570  beta-lactamase  30.27 
 
 
479 aa  120  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230187  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  32.91 
 
 
371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  29.31 
 
 
359 aa  117  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2155  beta-lactamase  30.07 
 
 
459 aa  117  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  32.79 
 
 
368 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  31.49 
 
 
368 aa  114  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  31.09 
 
 
360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  32.44 
 
 
371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  30.49 
 
 
372 aa  104  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  29.94 
 
 
362 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  30.28 
 
 
524 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  31.07 
 
 
384 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  25 
 
 
383 aa  100  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.78 
 
 
425 aa  97.8  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  26.76 
 
 
384 aa  97.1  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  28.61 
 
 
378 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  27.88 
 
 
359 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  28.67 
 
 
412 aa  90.5  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  28.86 
 
 
397 aa  89.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  28.52 
 
 
401 aa  89.4  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  28.62 
 
 
414 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  27.76 
 
 
390 aa  87.8  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  26.44 
 
 
505 aa  87.4  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  29.53 
 
 
414 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0196  beta-lactamase  25.79 
 
 
399 aa  84  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  27.65 
 
 
405 aa  83.2  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  28.83 
 
 
396 aa  82  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  24.25 
 
 
363 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  24.62 
 
 
530 aa  79.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  21.16 
 
 
395 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0777  beta-lactamase  30.96 
 
 
333 aa  79  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0135628  normal  0.105331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  27.56 
 
 
504 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.21 
 
 
415 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  30.18 
 
 
328 aa  77  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  22.22 
 
 
387 aa  77  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  25 
 
 
530 aa  76.6  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.61 
 
 
395 aa  76.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  25 
 
 
413 aa  76.3  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  28.14 
 
 
462 aa  75.5  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  24.13 
 
 
640 aa  75.5  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  26.75 
 
 
380 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  26.17 
 
 
389 aa  75.1  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  26.75 
 
 
380 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.22 
 
 
405 aa  74.3  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  26.28 
 
 
447 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  26.72 
 
 
447 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  26.72 
 
 
447 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  27.08 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  26.56 
 
 
505 aa  72.8  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.49 
 
 
419 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  27.72 
 
 
400 aa  72.8  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  23.35 
 
 
382 aa  72  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2084  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.95 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113455  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  25.53 
 
 
305 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  25.53 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  28.22 
 
 
417 aa  71.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  27.76 
 
 
410 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02500  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  25.91 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  25.98 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  26.01 
 
 
404 aa  70.1  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  24.91 
 
 
305 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  26.97 
 
 
323 aa  69.7  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3014  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.23 
 
 
419 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00694763  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0635  beta-lactamase  29.75 
 
 
327 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  25.53 
 
 
309 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.5 
 
 
419 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  24.56 
 
 
305 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  25.53 
 
 
309 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.5 
 
 
419 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  26.88 
 
 
389 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>