71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1889 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1889  hypothetical protein  100 
 
 
462 aa  928    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  30.33 
 
 
391 aa  118  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  36.9 
 
 
206 aa  62  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2999  TonB family protein  36.76 
 
 
396 aa  58.9  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  38.04 
 
 
207 aa  58.2  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  40.62 
 
 
207 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  34.78 
 
 
206 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  40.62 
 
 
207 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  41.27 
 
 
207 aa  57.8  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  40.62 
 
 
207 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  34.78 
 
 
206 aa  57.4  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  34.78 
 
 
206 aa  57.4  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  34.78 
 
 
206 aa  57.4  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  40.62 
 
 
206 aa  57  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3481  TonB family protein  42.19 
 
 
363 aa  56.2  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00509083  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  39.68 
 
 
403 aa  55.8  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  40.62 
 
 
217 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  32.17 
 
 
205 aa  55.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3429  TonB family protein  38.1 
 
 
371 aa  53.9  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0523  TonB family protein  38.1 
 
 
371 aa  53.9  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  33.85 
 
 
367 aa  53.9  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2444  TonB domain-containing protein  35.94 
 
 
361 aa  53.5  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0960107  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0571  TonB family protein  34.92 
 
 
370 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.480586 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  38.1 
 
 
206 aa  52.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3763  TonB family protein  34.92 
 
 
373 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  39.68 
 
 
417 aa  53.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0547  TonB family protein  34.92 
 
 
369 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  38.1 
 
 
206 aa  53.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  33.7 
 
 
206 aa  52.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  38.1 
 
 
206 aa  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  31.25 
 
 
203 aa  51.6  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3332  TonB family protein  38.96 
 
 
362 aa  51.6  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00224785  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3603  TonB family protein  36.51 
 
 
371 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2270  TonB family protein  39.06 
 
 
368 aa  51.2  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00628561  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  36.51 
 
 
369 aa  51.2  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0576  TonB family protein  33.33 
 
 
370 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  37.5 
 
 
206 aa  51.2  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0632  TonB family protein  34.92 
 
 
370 aa  51.2  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  32.22 
 
 
203 aa  50.8  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03563  TonB domain protein  40.28 
 
 
392 aa  50.1  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  34.38 
 
 
405 aa  48.5  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  34.38 
 
 
203 aa  49.3  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  39.68 
 
 
204 aa  48.5  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1891  hypothetical protein  44.25 
 
 
391 aa  48.5  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.559503 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  39.66 
 
 
349 aa  48.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0079  TonB family protein  40.26 
 
 
148 aa  47.8  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.416956 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2774  TonB family protein  39.68 
 
 
354 aa  47.4  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0960618  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  39.68 
 
 
131 aa  47.4  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  39.06 
 
 
203 aa  47.4  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  39.06 
 
 
203 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  32.81 
 
 
202 aa  45.8  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  34.38 
 
 
206 aa  46.6  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  35.48 
 
 
206 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  37.5 
 
 
203 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3888  TonB family protein  29.17 
 
 
147 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  37.5 
 
 
203 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  35.9 
 
 
115 aa  45.8  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0873  TonB family protein  41.18 
 
 
205 aa  45.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3544  TonB family protein  31.88 
 
 
145 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.788669  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  37.5 
 
 
203 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00633  periplasmic protein TonB  34.33 
 
 
209 aa  44.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  37.5 
 
 
203 aa  45.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  32.81 
 
 
202 aa  44.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  33.67 
 
 
219 aa  45.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  32.81 
 
 
223 aa  44.3  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  32.79 
 
 
404 aa  44.3  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  40 
 
 
277 aa  44.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1642  TonB family protein  26.67 
 
 
145 aa  44.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  40.35 
 
 
237 aa  44.3  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  31.15 
 
 
397 aa  43.5  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0839  TonB family protein  37.93 
 
 
302 aa  43.1  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0400765 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>