231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0906 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0906  squalene/phytoene synthase  100 
 
 		 284 aa  568  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  45.61 
 
 		 293 aa  246  3e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1042  squalene/phytoene synthase  42.03 
 
 		 286 aa  230  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  43.57 
 
 		 285 aa  229  4e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  41.82 
 
 		 278 aa  217  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  40.52 
 
 		 277 aa  208  7e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  37.87 
 
 		 280 aa  207  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  40.88 
 
 		 277 aa  205  7e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  38.55 
 
 		 293 aa  193  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  37.96 
 
 		 280 aa  192  8e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  38.66 
 
 		 279 aa  189  7e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  38.66 
 
 		 279 aa  188  8e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1549  squalene/phytoene synthase  36.86 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  38.91 
 
 		 279 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  36.92 
 
 		 278 aa  185  7e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  38.69 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  36.23 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  37.77 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1958  squalene synthase HpnD  40.22 
 
 		 300 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0340477  normal  0.450684 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1456  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  40.37 
 
 		 286 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1652  putative phytoene synthase protein  39.78 
 
 		 290 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.665297 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1565  squalene synthase HpnD  38.18 
 
 		 277 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0179833  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1894  squalene synthase HpnD  37.45 
 
 		 277 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.635436  normal  0.151415 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1248  putative phytoene synthase  39.58 
 
 		 278 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.245345  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1975  putative phytoene synthase  39.58 
 
 		 278 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264351  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3330  putative phytoene synthase  39.58 
 
 		 278 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10709  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5245  squalene/phytoene synthase  39.86 
 
 		 303 aa  165  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2389  putative phytoene synthase  39.65 
 
 		 280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1287  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  39.02 
 
 		 287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.200444  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2347  putative phytoene synthase  39.65 
 
 		 280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1482  phytoene synthase, putative  39.13 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.135853  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2502  phytoene synthase, putative  39.13 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2098  phytoene synthase, putative  39.58 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.389143  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2572  squalene synthase HpnD  36.86 
 
 		 281 aa  158  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6145  squalene/phytoene synthase  40.22 
 
 		 300 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1934  squalene/phytoene synthase  40.22 
 
 		 300 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1006  squalene/phytoene synthase  38.55 
 
 		 302 aa  156  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109233  normal  0.62289 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1922  squalene/phytoene synthase  39.86 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.691361  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1849  squalene synthase HpnD  39.64 
 
 		 277 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.775732  hitchhiker  0.00598695 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1337  squalene synthase HpnD  40.22 
 
 		 352 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058937 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2303  putative phytoene synthase  35.69 
 
 		 284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1944  squalene/phytoene synthase  33.7 
 
 		 276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1883  Squalene/phytoene synthase  36.67 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0657917 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0306  squalene/phytoene synthase  34.81 
 
 		 288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0064  squalene-phytoene synthase  34.22 
 
 		 687 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0577  squalene/phytoene synthase  37.04 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.576653  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3404  Phytoene synthase  32.21 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.295387  normal  0.128424 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3405  squalene synthase HpnC  32.13 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151553  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3241  squalene synthase HpnD  30.04 
 
 		 294 aa  102  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154532 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  26.16 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0010  putative squalene/phytoene synthase  32.21 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  22.1 
 
 		 309 aa  99.4  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1745  squalene/phytoene synthase  25.18 
 
 		 293 aa  99  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7027  squalene synthase HpnD  31.85 
 
 		 282 aa  99  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.597423  hitchhiker  0.000000555779 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2334  phytoene synthase  30.19 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  22.61 
 
 		 309 aa  98.6  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1827  squalene synthase HpnD  31.72 
 
 		 298 aa  98.2  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  23 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1833  squalene synthase HpnD  31.54 
 
 		 283 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  23.64 
 
 		 310 aa  95.9  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0893  hypothetical protein  30.65 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  21.74 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  22.15 
 
 		 310 aa  94.4  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  21.3 
 
 		 310 aa  94.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0889  hypothetical protein  30.27 
 
 		 277 aa  94  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5424  squalene synthase HpnD  30.24 
 
 		 283 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5506  squalene synthase HpnD  34.02 
 
 		 282 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0194601 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0118  squalene/phytoene synthase  32.71 
 
 		 290 aa  93.2  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  26.13 
 
 		 316 aa  93.2  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4953  squalene/phytoene synthase  34.02 
 
 		 282 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  normal  0.0913001 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  24.47 
 
 		 310 aa  92.8  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2967  putative phytoene synthase  28.95 
 
 		 279 aa  92.8  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3173  squalene synthase HpnD  32.35 
 
 		 282 aa  92.8  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0017  squalene/phytoene synthase  31.48 
 
 		 282 aa  92.4  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  25.1 
 
 		 268 aa  92.4  7e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6349  squalene synthase HpnD  33.06 
 
 		 284 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00743094  normal  0.0909411 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4554  squalene synthase HpnD  33.61 
 
 		 282 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.124742  normal  0.209496 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7144  squalene synthase HpnD  33.07 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1794  squalene/phytoene synthase  31.11 
 
 		 274 aa  91.3  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0830515  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2218  squalene synthase HpnD  31.8 
 
 		 283 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.674273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  25.71 
 
 		 302 aa  90.5  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1942  squalene synthase HpnD  31.8 
 
 		 283 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.802248 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4139  squalene synthase HpnD  29.34 
 
 		 290 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  27.02 
 
 		 312 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2361  phytoene synthase, putative  32.64 
 
 		 397 aa  89.7  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5681  squalene/phytoene synthase  33.2 
 
 		 344 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450879  hitchhiker  0.0020025 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5178  squalene/phytoene synthase  33.2 
 
 		 286 aa  89  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3277  squalene/phytoene synthase family protein  32.1 
 
 		 282 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173331  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  29.86 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1491  squalene/phytoene synthase  32.1 
 
 		 275 aa  86.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116412  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  28.24 
 
 		 337 aa  86.3  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2684  squalene/phytoene synthase  31.4 
 
 		 278 aa  86.3  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.166046  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2102  putative phytoene synthase  32.1 
 
 		 282 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3163  squalene/phytoene synthase family protein  32.1 
 
 		 282 aa  85.9  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.395921  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1131  putative phytoene synthase  32.1 
 
 		 282 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0886071  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1411  putative phytoene synthase  32.1 
 
 		 282 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590662  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  27.56 
 
 		 337 aa  85.9  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0494  phytoene synthase  29.39 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  24.19 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1176  putative phytoene synthase protein  26.42 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.691183  normal  0.0670648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>