91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0577 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0577  squalene/phytoene synthase  100 
 
 		 283 aa  538  9.999999999999999e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.576653  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  32.98 
 
 		 280 aa  126  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  33.69 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0906  squalene/phytoene synthase  37.04 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  30.14 
 
 		 278 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  32.62 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  28.67 
 
 		 277 aa  106  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30.07 
 
 		 280 aa  102  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  29.97 
 
 		 278 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  29.82 
 
 		 293 aa  99  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  31.34 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1944  squalene/phytoene synthase  31.32 
 
 		 276 aa  97.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1042  squalene/phytoene synthase  29.93 
 
 		 286 aa  95.9  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  30.18 
 
 		 279 aa  95.9  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1549  squalene/phytoene synthase  30.43 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  28.98 
 
 		 279 aa  93.2  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2303  putative phytoene synthase  30.85 
 
 		 284 aa  93.2  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  28.98 
 
 		 279 aa  92.8  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1456  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  31.12 
 
 		 286 aa  90.5  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  30.11 
 
 		 302 aa  89.7  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30.77 
 
 		 281 aa  88.2  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1958  squalene synthase HpnD  31.47 
 
 		 300 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0340477  normal  0.450684 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1883  Squalene/phytoene synthase  32.16 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0657917 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2502  phytoene synthase, putative  31.67 
 
 		 307 aa  86.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1482  phytoene synthase, putative  31.67 
 
 		 307 aa  86.3  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.135853  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1975  putative phytoene synthase  32.47 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264351  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1248  putative phytoene synthase  32.47 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.245345  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1934  squalene/phytoene synthase  30.88 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  28.57 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3330  putative phytoene synthase  32.47 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10709  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6145  squalene/phytoene synthase  30.88 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2347  putative phytoene synthase  32.6 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2389  putative phytoene synthase  32.6 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2098  phytoene synthase, putative  31.37 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.389143  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1006  squalene/phytoene synthase  29.79 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109233  normal  0.62289 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1922  squalene/phytoene synthase  30.74 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.691361  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1894  squalene synthase HpnD  28.42 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.635436  normal  0.151415 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1849  squalene synthase HpnD  31.5 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.775732  hitchhiker  0.00598695 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1287  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  28.93 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.200444  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2572  squalene synthase HpnD  26.5 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1337  squalene synthase HpnD  29.82 
 
 		 352 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058937 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1565  squalene synthase HpnD  28.72 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0179833  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1652  putative phytoene synthase protein  30.2 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.665297 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5245  squalene/phytoene synthase  32.11 
 
 		 303 aa  72  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0306  squalene/phytoene synthase  30.23 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1176  putative phytoene synthase protein  31.25 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.691183  normal  0.0670648 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0010  putative squalene/phytoene synthase  27.17 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1766  squalene/phytoene synthase  30.1 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0567631  normal  0.0104629 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3241  squalene synthase HpnD  30.69 
 
 		 294 aa  55.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154532 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7027  squalene synthase HpnD  26.81 
 
 		 282 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.597423  hitchhiker  0.000000555779 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3575  squalene/phytoene synthase  29.65 
 
 		 279 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0912672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0526  hypothetical protein  24.87 
 
 		 286 aa  53.1  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2334  phytoene synthase  26.05 
 
 		 277 aa  53.1  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5681  squalene/phytoene synthase  29.44 
 
 		 344 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450879  hitchhiker  0.0020025 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4263  squalene synthase HpnD  28.15 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5178  squalene/phytoene synthase  29.44 
 
 		 286 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1759  putative phytoene synthase protein  32.94 
 
 		 282 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7144  squalene synthase HpnD  31.51 
 
 		 283 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0889  hypothetical protein  26.54 
 
 		 277 aa  50.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4554  squalene synthase HpnD  28.26 
 
 		 282 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.124742  normal  0.209496 
 
 
-
 
NC_004310  BR0893  hypothetical protein  26.54 
 
 		 277 aa  49.7  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1491  squalene/phytoene synthase  27.27 
 
 		 275 aa  48.9  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116412  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1131  putative phytoene synthase  27.27 
 
 		 282 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0886071  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2102  putative phytoene synthase  27.27 
 
 		 282 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1411  putative phytoene synthase  27.27 
 
 		 282 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590662  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3163  squalene/phytoene synthase family protein  27.27 
 
 		 282 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.395921  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1833  squalene synthase HpnD  26.87 
 
 		 283 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3277  squalene/phytoene synthase family protein  27.27 
 
 		 282 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173331  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6349  squalene synthase HpnD  30.22 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00743094  normal  0.0909411 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3404  Phytoene synthase  31.34 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.295387  normal  0.128424 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2967  putative phytoene synthase  26.83 
 
 		 279 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2218  squalene synthase HpnD  29.32 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.674273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4149  phytoene synthase  31.72 
 
 		 282 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.165993  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1942  squalene synthase HpnD  28.8 
 
 		 283 aa  47  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.802248 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2361  phytoene synthase, putative  26.94 
 
 		 397 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2476  Squalene/phytoene synthase  25.42 
 
 		 321 aa  47.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3173  squalene synthase HpnD  27.27 
 
 		 282 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1724  squalene/phytoene synthase  28.14 
 
 		 279 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949729  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0064  squalene-phytoene synthase  26.67 
 
 		 687 aa  45.8  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4953  squalene/phytoene synthase  27.88 
 
 		 282 aa  45.8  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  normal  0.0913001 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1498  phytoene synthase protein  28.43 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.587215 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  21.13 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5506  squalene synthase HpnD  27.88 
 
 		 282 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0194601 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3169  putative phytoene synthase  38.03 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1155  hypothetical protein  40.98 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0425779 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  29.33 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3040  putative phytoene synthase  32.34 
 
 		 281 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2858  Squalene/phytoene synthase  26.96 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0793384 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0017  squalene/phytoene synthase  27.27 
 
 		 282 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4139  squalene synthase HpnD  25.91 
 
 		 290 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1802  squalene/phytoene synthase  28.57 
 
 		 287 aa  42.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.283074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>