202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1006 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1006  squalene/phytoene synthase  100 
 
 		 302 aa  615  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109233  normal  0.62289 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2303  putative phytoene synthase  82.48 
 
 		 284 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1883  Squalene/phytoene synthase  83.64 
 
 		 292 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0657917 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1958  squalene synthase HpnD  70.5 
 
 		 300 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0340477  normal  0.450684 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1482  phytoene synthase, putative  69.2 
 
 		 307 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.135853  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2502  phytoene synthase, putative  69.2 
 
 		 307 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6145  squalene/phytoene synthase  70.5 
 
 		 300 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1922  squalene/phytoene synthase  71.84 
 
 		 303 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.691361  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1934  squalene/phytoene synthase  70.5 
 
 		 300 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1975  putative phytoene synthase  70.04 
 
 		 278 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264351  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3330  putative phytoene synthase  70.04 
 
 		 278 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10709  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1248  putative phytoene synthase  70.04 
 
 		 278 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.245345  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1849  squalene synthase HpnD  71.01 
 
 		 277 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.775732  hitchhiker  0.00598695 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5245  squalene/phytoene synthase  70.04 
 
 		 303 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2098  phytoene synthase, putative  70.04 
 
 		 278 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.389143  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2347  putative phytoene synthase  69.18 
 
 		 280 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2389  putative phytoene synthase  69.18 
 
 		 280 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1337  squalene synthase HpnD  71.12 
 
 		 352 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058937 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  44.49 
 
 		 280 aa  239  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1565  squalene synthase HpnD  44.61 
 
 		 277 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0179833  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  42.81 
 
 		 293 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  43.49 
 
 		 279 aa  232  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1652  putative phytoene synthase protein  44.85 
 
 		 290 aa  232  6e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.665297 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1894  squalene synthase HpnD  44.24 
 
 		 277 aa  232  6e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.635436  normal  0.151415 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  43.33 
 
 		 277 aa  231  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1549  squalene/phytoene synthase  44.24 
 
 		 279 aa  230  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  43.22 
 
 		 278 aa  228  9e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  42.75 
 
 		 279 aa  226  4e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  42.75 
 
 		 279 aa  225  6e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1456  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  45.49 
 
 		 286 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  42.28 
 
 		 302 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1944  squalene/phytoene synthase  45.82 
 
 		 276 aa  222  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2572  squalene synthase HpnD  43.75 
 
 		 281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  41.3 
 
 		 280 aa  219  7e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  41.85 
 
 		 277 aa  216  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  41.48 
 
 		 280 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1287  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  44.77 
 
 		 287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.200444  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  38.35 
 
 		 278 aa  203  4e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  39.78 
 
 		 293 aa  202  6e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  40.96 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  38.91 
 
 		 285 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1042  squalene/phytoene synthase  37 
 
 		 286 aa  185  8e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0906  squalene/phytoene synthase  38.55 
 
 		 284 aa  165  8e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0306  squalene/phytoene synthase  30.43 
 
 		 288 aa  114  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  29.45 
 
 		 332 aa  109  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1745  squalene/phytoene synthase  27.62 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  29.26 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  28.62 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  29.45 
 
 		 310 aa  99.8  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  27.36 
 
 		 310 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  28 
 
 		 310 aa  97.1  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  28 
 
 		 308 aa  97.1  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  27.03 
 
 		 310 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  27.57 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  24.24 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  24.71 
 
 		 310 aa  94.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  25.37 
 
 		 311 aa  93.6  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  23.24 
 
 		 310 aa  93.2  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  28.33 
 
 		 310 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  24.1 
 
 		 268 aa  92.4  9e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  24.18 
 
 		 311 aa  91.7  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  26.18 
 
 		 302 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  27.64 
 
 		 337 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  31.07 
 
 		 331 aa  90.9  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  25.82 
 
 		 302 aa  89.7  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  25.45 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  24.91 
 
 		 312 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  24.91 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  24.62 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  28.47 
 
 		 299 aa  87  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  27.96 
 
 		 339 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  30.37 
 
 		 317 aa  85.9  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  26.33 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3404  Phytoene synthase  29.05 
 
 		 276 aa  85.5  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.295387  normal  0.128424 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  25.51 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1548  squalene/phytoene synthase  25.09 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  27.64 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3405  squalene synthase HpnC  24.73 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151553  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  24.81 
 
 		 324 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  28.51 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0305  squalene/phytoene synthase  27.1 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  25 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0577  squalene/phytoene synthase  30.5 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.576653  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2245  squalene synthase HpnC  26.32 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  23.72 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  23.47 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  26.55 
 
 		 313 aa  79  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  24.73 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  28.51 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2244  Phytoene synthase  27.7 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  28.51 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  27.27 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  27.46 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  27.08 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1486  Phytoene synthase  27.08 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000477032 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  31.07 
 
 		 505 aa  71.6  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1827  squalene synthase HpnD  26.32 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  26.59 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  24.91 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  25.59 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>