More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4602 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4602  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 135 aa  265  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4224  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 135 aa  265  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300025  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4290  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 135 aa  265  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.905721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  68.89 
 
 		 136 aa  186  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  66.67 
 
 		 146 aa  182  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  62.96 
 
 		 135 aa  177  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2995  endoribonuclease L-PSP  61.48 
 
 		 135 aa  169  9e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  65.19 
 
 		 135 aa  169  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  59.26 
 
 		 135 aa  169  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0196  Endoribonuclease L-PSP  62.22 
 
 		 135 aa  152  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  53.33 
 
 		 135 aa  143  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  48.46 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34570  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  44.12 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00491284  normal  0.846357 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1769  Endoribonuclease L-PSP  47.79 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.261309 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0370  Endoribonuclease L-PSP  51.16 
 
 		 136 aa  103  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  42.54 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  40.62 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1663  endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 142 aa  83.6  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  37.21 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  37.69 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  36.43 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  36.43 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  36.43 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  36.43 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  45.04 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  42.54 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  42.54 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  42.54 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  35.66 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  35.66 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  39.52 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  36.92 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  37.78 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  41.22 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  36.09 
 
 		 402 aa  70.5  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  35.46 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0382  endoribonuclease L-PSP  37.23 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395966  normal  0.101256 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1158  endoribonuclease L-PSP  36.57 
 
 		 154 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2898  Endoribonuclease L-PSP  35.56 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1441  Endoribonuclease L-PSP  41.04 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.202349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0717  Endoribonuclease L-PSP  38.41 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4539  endoribonuclease L-PSP  38.64 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293828  normal  0.437318 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0682  Endoribonuclease L-PSP  38.35 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  39.39 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  39.39 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  37.93 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  31.34 
 
 		 394 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3954  Endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  37.88 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  38.06 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2914  Endoribonuclease L-PSP  40.37 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000821115  hitchhiker  0.0000516213 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  36.79 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  40.15 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  37.74 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  35.85 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  35.85 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  40.46 
 
 		 227 aa  62  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4515  endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  36.79 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  34.91 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  35.56 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2881  endoribonuclease L-PSP  41.35 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2595  endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  32.03 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3074  Endoribonuclease L-PSP  39.1 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1223  endoribonuclease L-PSP  43.38 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2275  endoribonuclease L-PSP  43.51 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.321934  hitchhiker  0.000000264043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 138 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 145 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  32.08 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09080  L-PSP endoribonuclease family protein (Hmf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02340)  34.92 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0836  endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.496581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4718  Endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2969  Endoribonuclease L-PSP  39.1 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2374  endoribonuclease L-PSP  39.05 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553105 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  38.4 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0668  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5909  Endoribonuclease L-PSP  43.04 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  39.39 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  34.91 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3818  endoribonuclease L-PSP  40.95 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515952  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3519  endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2495  Endoribonuclease L-PSP  34.56 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.628081  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  36.64 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>