More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1004 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1004  ABC transporter related  100 
 
 		 237 aa  488  1e-137  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00470286 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1289  ABC transporter related  67.23 
 
 		 242 aa  351  7e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.077287  hitchhiker  0.00948798 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1457  ABC transporter related  67.37 
 
 		 241 aa  338  2.9999999999999998e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0710  ABC transporter related  66.1 
 
 		 239 aa  334  5.999999999999999e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2482  ABC transporter-related protein  60.94 
 
 		 238 aa  308  2.9999999999999997e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.988214  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2857  ABC transporter, ATP-binding protein  55.17 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00741343  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0352  ABC transporter related  48.05 
 
 		 260 aa  236  3e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2701  ABC transporter related  46.32 
 
 		 241 aa  225  4e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128649  normal  0.0320572 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3071  ABC transporter related protein  48.34 
 
 		 252 aa  221  6e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.710485  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5208  ABC transporter related protein  49.29 
 
 		 259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0830  ABC transporter related protein  47 
 
 		 226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  41.1 
 
 		 247 aa  190  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  39.75 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  40.51 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  36.96 
 
 		 245 aa  176  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  37.76 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07170  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.13 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  37.29 
 
 		 246 aa  168  6e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  35.44 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  37.66 
 
 		 250 aa  166  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  37.66 
 
 		 250 aa  166  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  34.19 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3072  ABC transporter related protein  34.78 
 
 		 254 aa  162  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0146986  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  35.65 
 
 		 282 aa  162  6e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1137  ABC transporter, ATP-binding protein  34.33 
 
 		 301 aa  160  1e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  32.77 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  37.7 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1956  ABC transporter related protein  37.73 
 
 		 240 aa  159  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00584741  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.7 
 
 		 328 aa  158  9e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  34.71 
 
 		 249 aa  156  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  34.02 
 
 		 274 aa  156  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.88 
 
 		 328 aa  156  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2692  ABC transporter related  35.34 
 
 		 252 aa  155  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.733393  normal  0.0930337 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.78 
 
 		 329 aa  155  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5012  ABC transporter related  36.52 
 
 		 254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281366 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  38.1 
 
 		 510 aa  155  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1123  ABC transporter related protein  35.32 
 
 		 257 aa  155  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768218  normal  0.140519 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  34.31 
 
 		 252 aa  154  8e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1526  ABC transporter related protein  39.73 
 
 		 305 aa  155  8e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  36.02 
 
 		 287 aa  154  8e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  34.58 
 
 		 251 aa  155  8e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2072  ABC transporter-related protein  35.9 
 
 		 255 aa  154  9e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.743004  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08250  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.91 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.905308  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2864  ABC transporter related  34.78 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  34.53 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  35.22 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1768  ABC transporter, ATPase subunit  35.9 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  32.08 
 
 		 250 aa  152  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  33.33 
 
 		 328 aa  152  4e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3070  ABC transporter related protein  36.11 
 
 		 307 aa  152  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127936  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  35.71 
 
 		 301 aa  152  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  34.33 
 
 		 300 aa  152  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  36.71 
 
 		 293 aa  152  5e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  34.47 
 
 		 247 aa  152  5.9999999999999996e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  32.6 
 
 		 319 aa  152  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0439  ABC transporter related  37.09 
 
 		 283 aa  151  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2589  ATP-binding transport protein NatA  36.4 
 
 		 266 aa  150  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.408024  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.53 
 
 		 325 aa  150  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  37.62 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1843  multidrug ABC transporter ATPase  33.48 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  34.09 
 
 		 327 aa  150  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  37.27 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  34.55 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.8 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0089  ABC transporter related  33.89 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.842138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  35.84 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1044  ABC transporter related  35.29 
 
 		 331 aa  150  2e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  34.55 
 
 		 300 aa  149  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 308 aa  149  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  33.62 
 
 		 249 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  32.43 
 
 		 328 aa  149  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2043  ABC transporter related  35.71 
 
 		 311 aa  149  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.289791  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5049  ABC transporter related  33.48 
 
 		 309 aa  149  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  33.78 
 
 		 242 aa  149  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1021  ABC transporter related  33.89 
 
 		 237 aa  149  4e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00128788 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36090  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.77 
 
 		 295 aa  149  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  34.07 
 
 		 311 aa  149  5e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1575  ABC-type transport system, ATPase component  34.08 
 
 		 314 aa  149  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2324  ABC transporter related  35.04 
 
 		 272 aa  149  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107108 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  34.07 
 
 		 317 aa  149  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  34.96 
 
 		 330 aa  148  7e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  38.21 
 
 		 307 aa  148  7e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4500  ABC transporter related  36.09 
 
 		 254 aa  148  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0737614  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1419  ABC transporter related  30.86 
 
 		 246 aa  148  8e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.441429  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  36.45 
 
 		 324 aa  148  9e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  34.84 
 
 		 316 aa  148  9e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0303  ABC transporter related protein  36.25 
 
 		 244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.56 
 
 		 279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  33.19 
 
 		 512 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0090  ABC transporter-like protein  34.23 
 
 		 312 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.101268 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0614  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.67 
 
 		 374 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.668059 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  34.35 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1671  ABC transporter related  33.04 
 
 		 316 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  32.29 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  34.53 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  34.53 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0943  ABC transporter related protein  33.61 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1462  ABC transporter related  32.77 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.936224  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  36.16 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  36.2 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>