120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0885 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0885  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 83 aa  167  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3268  XRE family transcriptional regulator  73.17 
 
 		 104 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5594  XRE family transcriptional regulator  56.1 
 
 		 92 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5414  XRE family transcriptional regulator  56.1 
 
 		 92 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207419  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0622  transcriptional regulator, putative  42.62 
 
 		 303 aa  50.4  0.000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.436499  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0255  transcriptional regulator, putative  40.98 
 
 		 308 aa  49.7  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0623  transcriptional regulator, putative  35 
 
 		 302 aa  48.9  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0864444  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0626  transcriptional regulator, putative  37.5 
 
 		 303 aa  48.1  0.00004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0882771  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2349  hypothetical protein  38.71 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0127  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  36.67 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3308  transcriptional regulator  40 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.38656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0766  helix-turn-helix domain protein  37.88 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0508  transcriptional regulator, putative  39.34 
 
 		 312 aa  46.2  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 175 aa  45.4  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1555  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 208 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602269  normal  0.341998 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl455  Cro/CI family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.33845e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0791  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 528 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4907  helix-turn-helix domain protein  40.32 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0998227 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3860  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3469  DNA-binding protein  38.33 
 
 		 189 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.162788  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0422  transcriptional regulator  36.07 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1529  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.17746 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1806  XRE family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 86 aa  44.3  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3325  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 229 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.610712  normal  0.167348 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0082  DNA-binding protein  37.31 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.815457  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3250  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.67 
 
 		 189 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.653673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4980  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  42.37 
 
 		 476 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2958  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.526804  normal  0.873082 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6923  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5795  putative transcription regulator  38.1 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.372775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5234  DNA-binding protein  37.31 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302998 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 171 aa  43.5  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3590  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 79 aa  43.5  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0073  DNA-binding protein  37.31 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0074  DNA-binding protein  37.31 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0070  transcriptional regulator  37.31 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0070  transcriptional regulator  37.31 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2116  hypothetical protein  36.07 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0074  DNA-binding protein  37.31 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0685  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0634  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0504  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1021  DNA-binding protein  39.62 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000053147  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 76 aa  42.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 76 aa  42.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0077  phage repressor like transcriptional regulator  43.33 
 
 		 207 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2007  DNA-binding protein  31.58 
 
 		 205 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1855  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 177 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21785 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0086  DNA-binding protein  37.31 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0083  DNA-binding protein  37.31 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440854 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2245  Cro/CI family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492638  normal  0.683994 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4158  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 403 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0178123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1345  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 209 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1921  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.339052  normal  0.010603 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4610  XRE family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 252 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.985679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3493  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.499359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0608  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 227 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0070  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1876  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3441  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.404086 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0107  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.396345 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 79 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl067  Cro/CI family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 78 aa  42  0.003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0229  DNA-binding protein  37.68 
 
 		 222 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0893  DNA-binding protein  37.68 
 
 		 222 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6209  hypothetical protein  38.81 
 
 		 120 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.280043  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0684  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 101 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0300399  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2997  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 477 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.940113  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2314  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 208 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.059917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1469  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.978322 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2717  DNA-binding protein  37.68 
 
 		 222 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2361  DNA-binding protein  37.68 
 
 		 222 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0714  DNA-binding protein  37.68 
 
 		 222 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0728  DNA-binding protein  37.68 
 
 		 222 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2441  DNA-binding protein  37.68 
 
 		 222 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 75 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1419  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 64 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4217  helix-turn-helix domain-containing protein  36.07 
 
 		 69 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.538571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0995  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 72 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.651052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2792  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 72 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0340  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 93 aa  41.6  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 85 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2232  Cro/CI family transcriptional regulator  40 
 
 		 177 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 230 aa  41.2  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  45.9 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3508  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 187 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0510026 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 83 aa  41.2  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  36.84 
 
 		 180 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0371  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340091  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3096  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 477 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>