More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0506 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  100 
 
 
2816 aa  5375    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  32.99 
 
 
5745 aa  782    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  47.82 
 
 
1597 aa  382  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  39.22 
 
 
4978 aa  339  5.999999999999999e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  36.98 
 
 
3191 aa  331  1.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  39.44 
 
 
1269 aa  319  5e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  40.31 
 
 
1269 aa  319  6e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  39.36 
 
 
1268 aa  315  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  33.52 
 
 
2074 aa  304  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.84 
 
 
2114 aa  273  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  40.62 
 
 
3474 aa  272  5.9999999999999995e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  33.91 
 
 
1367 aa  272  7e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.53 
 
 
1884 aa  268  1e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.91 
 
 
994 aa  267  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  34.09 
 
 
1363 aa  254  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  38.38 
 
 
4848 aa  251  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  37.16 
 
 
2839 aa  243  2.9999999999999997e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  37.32 
 
 
3927 aa  222  8.999999999999998e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.87 
 
 
4220 aa  213  5e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  36.88 
 
 
3477 aa  208  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  43.79 
 
 
2807 aa  204  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.95 
 
 
850 aa  201  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  34.21 
 
 
892 aa  198  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  32.17 
 
 
2767 aa  197  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.13 
 
 
4122 aa  194  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.56 
 
 
3816 aa  192  9e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.82 
 
 
3363 aa  189  8e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  36.34 
 
 
721 aa  189  9e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  29.54 
 
 
2555 aa  179  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  35.44 
 
 
1512 aa  175  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.57 
 
 
4836 aa  174  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  37.47 
 
 
814 aa  174  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  28.87 
 
 
16322 aa  172  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  31.78 
 
 
1706 aa  164  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  41.55 
 
 
624 aa  164  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.53 
 
 
761 aa  164  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  35.37 
 
 
1867 aa  161  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.38 
 
 
2812 aa  158  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  31.55 
 
 
2377 aa  157  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  39.25 
 
 
1416 aa  156  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  40 
 
 
1222 aa  155  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  27.78 
 
 
9867 aa  153  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  34.29 
 
 
1428 aa  151  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.41 
 
 
5787 aa  150  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  32.65 
 
 
4854 aa  148  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  37.71 
 
 
4791 aa  142  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  38.53 
 
 
5442 aa  140  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  32.53 
 
 
2153 aa  139  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.69 
 
 
5839 aa  135  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.05 
 
 
369 aa  133  6e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  36.88 
 
 
1215 aa  129  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  36.88 
 
 
1215 aa  129  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  42.07 
 
 
2768 aa  128  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  36.76 
 
 
1215 aa  128  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  31.69 
 
 
2353 aa  127  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.36 
 
 
2507 aa  127  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.25 
 
 
1215 aa  127  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  36.25 
 
 
1215 aa  127  5e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  37.25 
 
 
4285 aa  125  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3497  beta-lactamase inhibitory protein II  34.51 
 
 
295 aa  124  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1846  beta-lactamase inhibitory protein II  35.29 
 
 
295 aa  124  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1330  Fibronectin type III domain protein  28.59 
 
 
2056 aa  124  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000696723 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.39 
 
 
1919 aa  123  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1701  beta-lactamase inhibitory protein II  36.15 
 
 
298 aa  123  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  33.07 
 
 
3089 aa  122  9e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  35.42 
 
 
546 aa  120  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  33.1 
 
 
5769 aa  119  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05390  hypothetical protein  35.38 
 
 
297 aa  119  7.999999999999999e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  38.25 
 
 
553 aa  119  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.12 
 
 
3699 aa  119  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  42.18 
 
 
1066 aa  117  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0484  Fibronectin type III domain protein  28.04 
 
 
2027 aa  118  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1928  hypothetical protein  35.27 
 
 
260 aa  116  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0196407  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2599  hypothetical protein  29.74 
 
 
1061 aa  116  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0018117  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  33.63 
 
 
558 aa  115  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.26 
 
 
556 aa  114  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  29.25 
 
 
3699 aa  113  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1287  fibronectin, type III domain-containing protein  27.1 
 
 
2011 aa  111  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111865  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  42.33 
 
 
715 aa  110  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  32.45 
 
 
579 aa  110  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  34.65 
 
 
569 aa  108  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  27.71 
 
 
3714 aa  108  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  28.46 
 
 
778 aa  108  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  32 
 
 
714 aa  107  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  33.33 
 
 
7284 aa  107  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.99 
 
 
567 aa  107  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1331  Fibronectin type III domain protein  27.44 
 
 
2040 aa  106  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211706 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  39.93 
 
 
560 aa  105  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.76 
 
 
6683 aa  105  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  33.64 
 
 
566 aa  105  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  33.76 
 
 
6779 aa  105  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  35.58 
 
 
6662 aa  104  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  24.72 
 
 
16311 aa  104  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.71 
 
 
921 aa  104  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  30.23 
 
 
2082 aa  103  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  29.36 
 
 
5094 aa  103  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  37.07 
 
 
1502 aa  103  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  34.8 
 
 
477 aa  103  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.16 
 
 
563 aa  102  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1759  Fibronectin type III domain protein  26.93 
 
 
2067 aa  102  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.77836  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>