More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0495 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0495  beta-lactamase  100 
 
 		 471 aa  937    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  69.07 
 
 		 496 aa  610  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1692  beta-lactamase  60.99 
 
 		 531 aa  528  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1715  beta-lactamase  60.27 
 
 		 528 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102688  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1761  beta-lactamase  60.27 
 
 		 528 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  47.28 
 
 		 390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  43 
 
 		 793 aa  293  5e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  40.24 
 
 		 428 aa  242  9e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  40.24 
 
 		 452 aa  242  9e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  34.81 
 
 		 483 aa  209  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  34.39 
 
 		 391 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  37.24 
 
 		 784 aa  199  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  36.66 
 
 		 459 aa  196  9e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  34.87 
 
 		 966 aa  194  4e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  36.05 
 
 		 395 aa  192  8e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  36.95 
 
 		 790 aa  188  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  35.02 
 
 		 416 aa  187  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  31.97 
 
 		 392 aa  186  8e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  34.77 
 
 		 796 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  34.77 
 
 		 796 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  32.66 
 
 		 408 aa  177  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2687  beta-lactamase  32.75 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000287138 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  32.43 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  34.05 
 
 		 792 aa  173  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  34.62 
 
 		 582 aa  171  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  32.9 
 
 		 360 aa  169  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  33.33 
 
 		 785 aa  169  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  30.89 
 
 		 395 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  31.71 
 
 		 574 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  32.58 
 
 		 379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  34.75 
 
 		 717 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  30.83 
 
 		 430 aa  159  7e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  32.75 
 
 		 361 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  31.41 
 
 		 381 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  30.67 
 
 		 379 aa  156  8e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  26.85 
 
 		 1012 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1238  beta-lactamase  31.59 
 
 		 361 aa  153  5.9999999999999996e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0301  beta-lactamase  32.99 
 
 		 351 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1366  beta-lactamase  35.66 
 
 		 591 aa  150  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  30.22 
 
 		 381 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0479  beta-lactamase  27.23 
 
 		 603 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000533746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  30.41 
 
 		 385 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  32.32 
 
 		 566 aa  147  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2362  beta-lactamase  33.25 
 
 		 357 aa  146  8.000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2113  beta-lactamase  27.88 
 
 		 597 aa  146  8.000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.226997 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.78 
 
 		 953 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4160  hypothetical protein  30.04 
 
 		 818 aa  138  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000766166  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  29.43 
 
 		 379 aa  138  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.68 
 
 		 1018 aa  136  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  24.59 
 
 		 1007 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1251  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  29.11 
 
 		 377 aa  134  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000135632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2616  beta-lactamase  28.35 
 
 		 366 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1130  beta-lactamase  30.51 
 
 		 355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  30.1 
 
 		 354 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0439  beta-lactamase  32.35 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0784108 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2585  hypothetical protein  27.59 
 
 		 433 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4515  beta-lactamase  31.61 
 
 		 369 aa  124  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2716  hypothetical protein  27.59 
 
 		 434 aa  123  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2566  hypothetical protein  27.32 
 
 		 434 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1249  hypothetical protein  27.32 
 
 		 434 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.303061 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3660  hypothetical protein  27.44 
 
 		 434 aa  121  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1231  beta-lactamase  27.52 
 
 		 434 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2844  hypothetical protein  28.75 
 
 		 432 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2671  hypothetical protein  28.75 
 
 		 432 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2711  hypothetical protein  28.91 
 
 		 432 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.27035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2737  hypothetical protein  28.75 
 
 		 432 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  35 
 
 		 463 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  35 
 
 		 481 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  35 
 
 		 481 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  35 
 
 		 483 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  33.64 
 
 		 481 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5693  beta-lactamase  34.04 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  32.24 
 
 		 490 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  27.32 
 
 		 447 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  26.1 
 
 		 1003 aa  118  3e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2506  beta-lactamase  33.43 
 
 		 344 aa  118  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  34.5 
 
 		 481 aa  117  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  35 
 
 		 483 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2622  hypothetical protein  28.25 
 
 		 432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2095  hypothetical protein  24.87 
 
 		 484 aa  115  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.187143  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  24.88 
 
 		 990 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3459  beta-lactamase  32.05 
 
 		 394 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213623 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3659  beta-lactamase  27.46 
 
 		 374 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4212  beta-lactamase  30.21 
 
 		 343 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  24.58 
 
 		 1002 aa  114  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1664  beta-lactamase  33.24 
 
 		 348 aa  114  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  29.8 
 
 		 505 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  26.12 
 
 		 992 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  29.93 
 
 		 483 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  27.93 
 
 		 424 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1850  Beta-lactamase class C or other penicillin binding protein  27.13 
 
 		 338 aa  111  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000532294  hitchhiker  0.000116253 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3541  beta-lactamase  33.06 
 
 		 394 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437558  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0444  beta-lactamase  26.84 
 
 		 339 aa  110  6e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  22.47 
 
 		 971 aa  110  6e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1543  beta-lactamase  24.06 
 
 		 651 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  32.71 
 
 		 453 aa  109  9.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3477  beta-lactamase  33.61 
 
 		 394 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  27.42 
 
 		 395 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  28.14 
 
 		 433 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2334  hypothetical protein  26.89 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000883594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>