228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0339 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  100 
 
 
423 aa  818    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  48.2 
 
 
448 aa  326  5e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  47.79 
 
 
418 aa  295  1e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  42.82 
 
 
415 aa  234  3e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  41.01 
 
 
407 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  40.53 
 
 
451 aa  217  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  35.31 
 
 
426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  38.89 
 
 
394 aa  180  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  34.8 
 
 
438 aa  176  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  32.02 
 
 
468 aa  176  9e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1724  amine oxidase  33.03 
 
 
470 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3795  amine oxidase  39.42 
 
 
413 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4664  amine oxidase  37.8 
 
 
418 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.636911  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3418  amine oxidase  38.66 
 
 
413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3364  amine oxidase  38.86 
 
 
414 aa  161  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.154637  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5169  amine oxidase  35.47 
 
 
433 aa  156  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  36.98 
 
 
420 aa  152  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2885  amine oxidase  35.59 
 
 
418 aa  149  9e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.748132  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  34.05 
 
 
410 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  31.85 
 
 
425 aa  146  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1137  amine oxidase  34.72 
 
 
436 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.858264  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  33.41 
 
 
455 aa  139  7e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1312  amine oxidase  35.31 
 
 
446 aa  139  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  31.74 
 
 
428 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  33.48 
 
 
437 aa  134  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  32.8 
 
 
433 aa  129  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  33.1 
 
 
431 aa  129  8.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2442  amine oxidase  32.85 
 
 
427 aa  121  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23220  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  30.97 
 
 
464 aa  110  5e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0581  amine oxidase  33.21 
 
 
413 aa  74.7  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  22.61 
 
 
447 aa  65.1  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  25.75 
 
 
419 aa  64.7  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1068  amine oxidase  26.53 
 
 
415 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  25.17 
 
 
454 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3173  amine oxidase  26.71 
 
 
415 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0714711  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2098  amine oxidase  27.05 
 
 
415 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1118  amine oxidase, flavin-containing protein  23.27 
 
 
415 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4952  amine oxidase  28.44 
 
 
417 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15769  normal  0.0932773 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  28.71 
 
 
552 aa  57.4  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  25.98 
 
 
491 aa  57  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3174  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.89 
 
 
417 aa  57  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.724661  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0018  amine oxidase  27.25 
 
 
417 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  41.18 
 
 
354 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  41.01 
 
 
456 aa  56.2  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  44.93 
 
 
359 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01433  putative dehydrogenase  23.55 
 
 
421 aa  55.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.923495  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4555  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.6 
 
 
417 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.160695 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3208  amine oxidase  21.98 
 
 
416 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.884279 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  29.53 
 
 
476 aa  55.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5505  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.44 
 
 
417 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342763  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3065  amine oxidase  21.98 
 
 
416 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3051  amine oxidase  21.98 
 
 
416 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.44 
 
 
441 aa  54.3  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5179  amine oxidase  28.6 
 
 
417 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5680  amine oxidase  28.6 
 
 
417 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799558  hitchhiker  0.00195148 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2736  amine oxidase  27.43 
 
 
415 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142464  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0958  amine oxidase, flavin-containing  22.58 
 
 
415 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3017  amine oxidase  27.05 
 
 
415 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  42.31 
 
 
245 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1995  All-trans-retinol 13,14-reductase  45.28 
 
 
499 aa  51.6  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  33.51 
 
 
430 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  27 
 
 
438 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  23.11 
 
 
484 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1312  amine oxidase  21.7 
 
 
416 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  33.51 
 
 
430 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  26.3 
 
 
449 aa  51.2  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  28.96 
 
 
451 aa  50.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  45.31 
 
 
501 aa  51.2  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  52.83 
 
 
537 aa  50.4  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  22.51 
 
 
484 aa  50.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  26.32 
 
 
484 aa  50.1  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  50.85 
 
 
462 aa  50.1  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  40.91 
 
 
344 aa  50.4  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  49.02 
 
 
657 aa  49.7  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  30.77 
 
 
430 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  24.06 
 
 
499 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  42 
 
 
488 aa  49.7  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  54.9 
 
 
598 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4537  hypothetical protein  26.95 
 
 
667 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.229647  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  52.73 
 
 
504 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  25 
 
 
469 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  23.75 
 
 
484 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2711  amine oxidase  22.44 
 
 
416 aa  49.3  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  28.42 
 
 
399 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  38.71 
 
 
421 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  41.18 
 
 
468 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1146  hypothetical protein  43.14 
 
 
468 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1414  amine oxidase  38.75 
 
 
565 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  47.37 
 
 
554 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  43.14 
 
 
468 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  46 
 
 
502 aa  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4739  amine oxidase  26.41 
 
 
415 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  45.31 
 
 
522 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  28.52 
 
 
476 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  25.52 
 
 
463 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  46 
 
 
502 aa  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  52 
 
 
445 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2915  cyclohexanone monooxygenase  39.73 
 
 
546 aa  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.245138  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  30.77 
 
 
430 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  30.77 
 
 
430 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>