More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2418 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2418  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  318  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0214034  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4424  AsnC family transcriptional regulator  69.74 
 
 		 155 aa  234  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  hitchhiker  0.00000834706 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7513  transcriptional regulator AsnC family  66.45 
 
 		 158 aa  220  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  49.03 
 
 		 165 aa  167  5e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04927  transcriptional regulator  50.66 
 
 		 161 aa  166  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2708  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 155 aa  160  7e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.72891  normal  0.803716 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 160 aa  156  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 160 aa  156  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  46.67 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 192 aa  140  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  40.13 
 
 		 173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  40.13 
 
 		 173 aa  138  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5457  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 158 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223576 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4909  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 158 aa  137  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725114  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 180 aa  134  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 161 aa  134  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2443  transcriptional regulator, AsnC family  49.19 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000317014  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2574  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132421  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  43.42 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  43.05 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  42.38 
 
 		 153 aa  131  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  42.38 
 
 		 153 aa  131  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  42.38 
 
 		 153 aa  131  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  41.72 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0726  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 162 aa  128  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.782638  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4298  transcriptional regulator, AsnC family  44.67 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4408  transcriptional regulator, AsnC family  44.67 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2839  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 192 aa  124  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.787421  normal  0.151915 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2801  transcription regulator protein  40.26 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.031775  normal  0.480036 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 150 aa  120  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3180  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 158 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5010  transcriptional regulator AsnC family  39.22 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4529  transcriptional regulator, AsnC family  40.91 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0784834  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6397  transcriptional regulator, AsnC family  40.26 
 
 		 154 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340876  normal  0.176747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1344  AsnC family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 160 aa  117  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.832275  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0948  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6796  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0983  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0590  transcriptional regulator, AsnC family  34.64 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 164 aa  112  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4845  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0710224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4290  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 165 aa  111  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1394  putative leucine-responsive regulatory protein  39.87 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3532  AsnC family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 160 aa  107  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  37.25 
 
 		 154 aa  107  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 157 aa  107  9.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  36.6 
 
 		 169 aa  105  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  34.67 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0948  AsnC family transcriptional regulator  49.53 
 
 		 121 aa  105  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3408  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 		 160 aa  103  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  43.33 
 
 		 158 aa  102  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  34.67 
 
 		 229 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  34 
 
 		 175 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  34 
 
 		 175 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  34 
 
 		 175 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1897  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 163 aa  101  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.129627 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  34 
 
 		 175 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  34 
 
 		 229 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 202 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1045  AsnC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 155 aa  100  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596576  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 202 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2025  leucine-responsive transcriptional regulator  34.93 
 
 		 167 aa  100  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  unclonable  0.00000134482 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  34.39 
 
 		 157 aa  100  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  35.33 
 
 		 152 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  33.12 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5387  transcriptional regulator, AsnC family  34.44 
 
 		 155 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.138805  normal  0.471727 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3359  transcriptional regulator, AsnC family  32.68 
 
 		 168 aa  99  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0096  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 168 aa  99.4  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00293139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 154 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  32.47 
 
 		 167 aa  99  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  34.25 
 
 		 167 aa  99.4  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4009  AsnC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 168 aa  99  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 188 aa  99.4  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5900  AsnC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 171 aa  99  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1432  transcriptional regulator, AsnC family  35.95 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605264  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0521  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 161 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0209927 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1900  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 156 aa  99  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 175 aa  99  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0537  transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 		 161 aa  98.6  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.863753  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2305  leucine-responsive transcriptional regulator  32.9 
 
 		 168 aa  98.2  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0783  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  98.2  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2012  leucine-responsive transcriptional regulator  32.9 
 
 		 168 aa  98.2  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000455922  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4160  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 153 aa  98.2  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 152 aa  98.2  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 157 aa  98.2  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1962  leucine-responsive transcriptional regulator  32.9 
 
 		 168 aa  98.2  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000351105  normal  0.663498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2014  leucine-responsive transcriptional regulator  32.9 
 
 		 168 aa  98.2  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2049  leucine-responsive transcriptional regulator  32.9 
 
 		 168 aa  98.2  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202075  hitchhiker  0.00142974 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  33.56 
 
 		 167 aa  97.8  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>