More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2194 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2194  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 
176 aa  358  3e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6891  putative transcriptional regulatory protein  70.73 
 
 
191 aa  244  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238381  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2572  HxlR family transcriptional regulator  69.01 
 
 
169 aa  232  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0464372 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0141  HxlR family transcriptional regulator  67.46 
 
 
187 aa  231  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.360575 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2522  transcriptional regulator, HxlR family  67.88 
 
 
173 aa  226  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.477902  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2223  transcriptional regulator, HxlR family  66.26 
 
 
173 aa  222  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0202  transcriptional regulator, HxlR family  64.63 
 
 
169 aa  218  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.537132 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6044  hypothetical protein  54.6 
 
 
174 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4087  transcriptional regulator, HxlR family  54.19 
 
 
173 aa  174  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1397  putative transcriptional regulator  44.66 
 
 
137 aa  107  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000300955  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2067  transcriptional regulator, HxlR family  43.56 
 
 
141 aa  102  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3099  HxlR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
147 aa  100  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5760  transcriptional regulator, HxlR family  43.43 
 
 
148 aa  98.2  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.740827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6743  transcriptional regulator, HxlR family  37.91 
 
 
156 aa  95.5  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436877  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2058  transcriptional regulator, HxlR family  42.16 
 
 
136 aa  95.9  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1101  putative transcriptional regulator  41.41 
 
 
150 aa  94.4  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0283435 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  41.46 
 
 
140 aa  91.7  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0382  transcriptional regulator, HxlR family  44.12 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.230955 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2675  HxlR family transcriptional regulator  39.82 
 
 
172 aa  80.9  0.000000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  41.41 
 
 
148 aa  80.1  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  44.33 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  35.33 
 
 
153 aa  79  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  33.1 
 
 
157 aa  78.6  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  37.7 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  41.24 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  34.95 
 
 
162 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  35.92 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  35.92 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  35.92 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  35.92 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  35.92 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  35.92 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  35.92 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  37.5 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  40.83 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3325  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
162 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
162 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
162 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
162 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  43.86 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  30.18 
 
 
170 aa  74.3  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  40.91 
 
 
268 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  30.41 
 
 
170 aa  74.3  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  40.35 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  40.91 
 
 
154 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  38 
 
 
226 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  41.44 
 
 
156 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  40.91 
 
 
154 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
147 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  39.39 
 
 
107 aa  73.9  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
152 aa  73.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  38.61 
 
 
160 aa  73.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  40.91 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  40.91 
 
 
154 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  40.91 
 
 
154 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  41.18 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  42.34 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  37.86 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  42.34 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  37.86 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  41.18 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  39.18 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
160 aa  72  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  41 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4945  HxlR family transcriptional regulator  34.5 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  41.05 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  38.54 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0547  HxlR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660753  normal  0.959277 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  42.27 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  41.94 
 
 
213 aa  71.2  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  41 
 
 
172 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  41 
 
 
172 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  41 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4220  HxlR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
116 aa  70.5  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  43.01 
 
 
147 aa  70.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  40.82 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  36.46 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  37.25 
 
 
130 aa  70.1  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  38.14 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  32.88 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  37.5 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6863  HxlR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
230 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1663  transcriptional regulator, HxlR family  41.24 
 
 
280 aa  69.3  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  30.93 
 
 
106 aa  69.3  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1269  HxlR family transcriptional regulator  40.22 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.178567  decreased coverage  0.00270462 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  45.26 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3692  transcriptional regulator protein-like protein  36.54 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal  0.226755 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  44.09 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  39.8 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  35.45 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11742  hypothetical protein  41.24 
 
 
236 aa  67.8  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021692  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  37.76 
 
 
239 aa  67.8  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.856766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>