132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1885 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  100 
 
 		 561 aa  1157    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  56.79 
 
 		 530 aa  566  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  54.81 
 
 		 540 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  53 
 
 		 545 aa  548  1e-155  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  53.02 
 
 		 542 aa  548  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  52.83 
 
 		 542 aa  545  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  52.65 
 
 		 540 aa  512  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  50.47 
 
 		 537 aa  508  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  50.28 
 
 		 537 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  50 
 
 		 535 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  47.78 
 
 		 535 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  45.74 
 
 		 510 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  35.02 
 
 		 535 aa  276  5e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  35.01 
 
 		 535 aa  270  5.9999999999999995e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  35.65 
 
 		 534 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  35.65 
 
 		 534 aa  269  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  34.86 
 
 		 521 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  34.52 
 
 		 849 aa  250  5e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  28.08 
 
 		 557 aa  213  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  27.85 
 
 		 552 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  28.52 
 
 		 564 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  28.74 
 
 		 543 aa  196  8.000000000000001e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  27.9 
 
 		 541 aa  195  2e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  28.63 
 
 		 566 aa  194  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  27.93 
 
 		 585 aa  190  7e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  28.33 
 
 		 580 aa  189  8e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  27.57 
 
 		 528 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  28.05 
 
 		 581 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  26.61 
 
 		 563 aa  178  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  26.96 
 
 		 590 aa  177  6e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  26.96 
 
 		 590 aa  177  6e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  26.96 
 
 		 590 aa  177  6e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  27.59 
 
 		 558 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  27.66 
 
 		 565 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  28.82 
 
 		 565 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  27.81 
 
 		 556 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  27.89 
 
 		 581 aa  174  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  27.84 
 
 		 581 aa  173  7.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  28.43 
 
 		 586 aa  170  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  27.17 
 
 		 602 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  26.02 
 
 		 564 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  26.88 
 
 		 569 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  27.31 
 
 		 568 aa  161  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  26.23 
 
 		 561 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  27.21 
 
 		 503 aa  158  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  39.38 
 
 		 229 aa  157  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  25.75 
 
 		 546 aa  156  8e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  25.48 
 
 		 573 aa  155  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  27.42 
 
 		 498 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  25.83 
 
 		 565 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  27.12 
 
 		 491 aa  154  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  26.18 
 
 		 550 aa  154  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  25.78 
 
 		 529 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  25.62 
 
 		 563 aa  150  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  25.62 
 
 		 563 aa  150  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  26.81 
 
 		 581 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  26.84 
 
 		 577 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  25.9 
 
 		 574 aa  146  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  26.37 
 
 		 581 aa  143  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  25.27 
 
 		 555 aa  141  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  26.9 
 
 		 556 aa  141  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  26.5 
 
 		 561 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  27.08 
 
 		 577 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  24.45 
 
 		 588 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  24.32 
 
 		 579 aa  140  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  25.89 
 
 		 583 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  23.66 
 
 		 581 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  25.2 
 
 		 553 aa  139  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  24.71 
 
 		 590 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  24.71 
 
 		 562 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  23.8 
 
 		 572 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  24.52 
 
 		 591 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  23.22 
 
 		 571 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  29.62 
 
 		 455 aa  130  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  24.49 
 
 		 574 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  24.37 
 
 		 562 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  24.37 
 
 		 562 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  24.37 
 
 		 562 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  24.27 
 
 		 562 aa  127  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  24.27 
 
 		 562 aa  127  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  26.12 
 
 		 546 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3315  phage terminase  26.63 
 
 		 569 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2070  putative Phage-related terminase  25.75 
 
 		 569 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  26.47 
 
 		 604 aa  116  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1671  phage terminase  24.2 
 
 		 593 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  23.17 
 
 		 611 aa  114  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  23.01 
 
 		 602 aa  112  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  23.62 
 
 		 606 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  23.62 
 
 		 606 aa  110  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  28.34 
 
 		 584 aa  106  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1603  Terminase  23.88 
 
 		 557 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1404  terminase large subunit  36.05 
 
 		 169 aa  103  9e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2689  Terminase  24.02 
 
 		 629 aa  101  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  21.4 
 
 		 569 aa  100  7e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3427  terminase large subunit, C-terminal region  24.73 
 
 		 356 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1750  phage terminase  25.38 
 
 		 570 aa  90.9  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0359  phage terminase  24.95 
 
 		 573 aa  88.2  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0988  phage terminase  24.52 
 
 		 573 aa  87.8  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4976  prophage LambdaBa03, terminase, large subunit  22.84 
 
 		 525 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5356  prophage LambdaBa03, terminase, large subunit  22.84 
 
 		 523 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>