More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0229 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0229  twitching motility protein  100 
 
 		 374 aa  765    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.126048 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0117  twitching motility protein  75.35 
 
 		 370 aa  554  1e-156  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.229082 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  52.75 
 
 		 366 aa  354  2e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0669  twitching motility protein  51.56 
 
 		 358 aa  346  4e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.278448 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  51.3 
 
 		 366 aa  341  1e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0256  twitching motility protein  52.14 
 
 		 359 aa  339  4e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  45.56 
 
 		 388 aa  312  6.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  46.42 
 
 		 383 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  46.13 
 
 		 383 aa  308  8e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1167  twitching motility protein  46.8 
 
 		 375 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.69165  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  43.27 
 
 		 387 aa  305  7e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  45.43 
 
 		 387 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  44.35 
 
 		 437 aa  302  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  45.22 
 
 		 427 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  44.99 
 
 		 386 aa  300  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  45.61 
 
 		 351 aa  300  3e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  44.94 
 
 		 427 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  44.94 
 
 		 427 aa  299  4e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  43.87 
 
 		 383 aa  294  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  45.58 
 
 		 383 aa  294  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  43.06 
 
 		 344 aa  290  3e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  42.98 
 
 		 368 aa  290  4e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  42.98 
 
 		 344 aa  288  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  43.39 
 
 		 351 aa  285  8e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  41.35 
 
 		 351 aa  285  9e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  42.13 
 
 		 388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  44 
 
 		 344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  45.01 
 
 		 344 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1214  twitching motility protein  45.27 
 
 		 396 aa  282  6.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  41.55 
 
 		 344 aa  282  9e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  41.55 
 
 		 344 aa  281  1e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  42.35 
 
 		 397 aa  281  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  43.41 
 
 		 346 aa  281  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  43.41 
 
 		 346 aa  281  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  42.73 
 
 		 350 aa  280  3e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  42.73 
 
 		 350 aa  279  5e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  39.88 
 
 		 372 aa  279  6e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  42.53 
 
 		 347 aa  279  7e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  42.86 
 
 		 344 aa  279  7e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  42.86 
 
 		 344 aa  279  7e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  41.96 
 
 		 348 aa  278  8e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  40.99 
 
 		 374 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  46.46 
 
 		 347 aa  278  1e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1211  twitching motility protein  44.48 
 
 		 362 aa  278  1e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  43.39 
 
 		 360 aa  278  1e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  42.2 
 
 		 566 aa  277  2e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  40.17 
 
 		 374 aa  276  3e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  42.86 
 
 		 360 aa  276  3e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  43.07 
 
 		 378 aa  276  4e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  42.69 
 
 		 344 aa  276  4e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1609  twitching motility protein  42.94 
 
 		 345 aa  276  4e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409997 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  41.74 
 
 		 345 aa  276  5e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  42.74 
 
 		 347 aa  276  5e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1808  twitching motility protein  45.64 
 
 		 432 aa  276  5e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.96744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  46.79 
 
 		 339 aa  276  5e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  42.86 
 
 		 370 aa  275  6e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  42.12 
 
 		 344 aa  276  6e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  42.49 
 
 		 372 aa  276  6e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  42.49 
 
 		 344 aa  276  6e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1126  twitching motility protein  43.55 
 
 		 430 aa  275  7e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  41.45 
 
 		 345 aa  275  7e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  42.24 
 
 		 347 aa  275  8e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  41.74 
 
 		 345 aa  275  8e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  45 
 
 		 367 aa  275  9e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  41.45 
 
 		 345 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  40.35 
 
 		 345 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2918  twitching motility protein PilT  42.26 
 
 		 344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.683879  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1130  twitching motility protein  45.51 
 
 		 366 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.3933  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0267  pilus retraction protein PilT  41.91 
 
 		 350 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  41.16 
 
 		 345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  43.43 
 
 		 344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  41.16 
 
 		 345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09510  pilus retraction protein PilT  44.19 
 
 		 362 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.477048  normal  0.984681 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  41.16 
 
 		 345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0293  twitching motility protein  40.75 
 
 		 350 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  43.67 
 
 		 345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  41.45 
 
 		 345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  41.45 
 
 		 345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  41.74 
 
 		 345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  42.82 
 
 		 349 aa  273  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  43.02 
 
 		 347 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1253  twitching motility protein  41.31 
 
 		 344 aa  273  3e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1221  twitching motility protein  41.31 
 
 		 344 aa  273  3e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.475571  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  42.82 
 
 		 349 aa  273  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  41.45 
 
 		 349 aa  273  3e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  43.02 
 
 		 347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  42.61 
 
 		 347 aa  272  6e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  41.92 
 
 		 345 aa  272  6e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  42.61 
 
 		 347 aa  272  6e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  41.16 
 
 		 345 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0637  twitching motility protein  42.9 
 
 		 347 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  42.17 
 
 		 345 aa  271  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  42.05 
 
 		 347 aa  271  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  40.58 
 
 		 345 aa  271  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  44.62 
 
 		 344 aa  271  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  40.87 
 
 		 345 aa  271  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03090  Pilus retraction protein  43.43 
 
 		 344 aa  271  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.166876  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0436  twitching motility protein PilT  42.44 
 
 		 356 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  42.61 
 
 		 347 aa  271  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  38.6 
 
 		 362 aa  270  2e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>