More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2399 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  100 
 
 		 322 aa  651    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  67.7 
 
 		 321 aa  457  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  59.5 
 
 		 327 aa  397  1e-109  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  49.26 
 
 		 348 aa  321  9.999999999999999e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0443  Dimethylallyltranstransferase  48.97 
 
 		 349 aa  301  1e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.843643  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2538  Dimethylallyltranstransferase  47.79 
 
 		 349 aa  297  1e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2049  Polyprenyl synthetase  46.45 
 
 		 346 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.000493992  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  47.34 
 
 		 321 aa  279  5e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2608  Polyprenyl synthetase  47.16 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  0.754762 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  47.46 
 
 		 325 aa  271  1e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  44.17 
 
 		 320 aa  259  3e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  43.88 
 
 		 320 aa  249  4e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0685  GCN5-related N-acetyltransferase  46.78 
 
 		 322 aa  242  6e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  44.78 
 
 		 317 aa  241  2e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  41.41 
 
 		 317 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  41.28 
 
 		 317 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  41.28 
 
 		 317 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  49.32 
 
 		 327 aa  216  5e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  43.54 
 
 		 332 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  39.07 
 
 		 320 aa  206  4e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  38.85 
 
 		 324 aa  203  3e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  34.45 
 
 		 326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  35.99 
 
 		 332 aa  199  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  37.13 
 
 		 324 aa  199  6e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  33.44 
 
 		 337 aa  194  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  33.02 
 
 		 332 aa  192  6e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  37.13 
 
 		 324 aa  192  7e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  33.89 
 
 		 332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  41.13 
 
 		 325 aa  188  1e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  35.37 
 
 		 323 aa  188  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  33.02 
 
 		 331 aa  186  3e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  34.32 
 
 		 337 aa  186  4e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  31.6 
 
 		 330 aa  186  5e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  37.41 
 
 		 322 aa  186  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  41.67 
 
 		 321 aa  185  8e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  43.87 
 
 		 322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  35.99 
 
 		 338 aa  182  7e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  34.68 
 
 		 322 aa  179  4.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  36.18 
 
 		 337 aa  179  5.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  36.11 
 
 		 338 aa  179  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  34.12 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  33.12 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  34.88 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33 
 
 		 320 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1235  Polyprenyl synthetase  38.33 
 
 		 330 aa  176  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  33.55 
 
 		 331 aa  176  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.4 
 
 		 320 aa  176  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  35.22 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  34.56 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.88 
 
 		 320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  41.88 
 
 		 306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  38 
 
 		 294 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  31.69 
 
 		 320 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  31.85 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.59 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0340  trans-hexaprenyltranstransferase  36.3 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104163  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13433  multi-functional geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA1: dimethylallyltransferase + geranyltranstransferase + farnesyltranstransferase  36.9 
 
 		 359 aa  170  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0524  octaprenyl-diphosphate synthase  32.28 
 
 		 331 aa  170  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  35.25 
 
 		 322 aa  169  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  39.13 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  32.88 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  33.56 
 
 		 331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2362  trans-hexaprenyltranstransferase  33.56 
 
 		 323 aa  166  4e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  40.65 
 
 		 320 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.78 
 
 		 323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  34.35 
 
 		 345 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  33.56 
 
 		 322 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  35.96 
 
 		 364 aa  166  6.9999999999999995e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  32.99 
 
 		 332 aa  165  8e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  38.06 
 
 		 300 aa  165  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5075  Polyprenyl synthetase  35.4 
 
 		 326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  33.56 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  33.79 
 
 		 322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  39.68 
 
 		 299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  33.56 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  33.56 
 
 		 348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.27 
 
 		 325 aa  163  3e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  31.96 
 
 		 331 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  31.96 
 
 		 331 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  33.22 
 
 		 322 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  31.96 
 
 		 331 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  38.49 
 
 		 295 aa  164  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  33.22 
 
 		 332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  32.65 
 
 		 331 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  37.4 
 
 		 307 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  37.11 
 
 		 294 aa  162  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  36.82 
 
 		 301 aa  162  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  33.56 
 
 		 326 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2899  octaprenyl-diphosphate synthase  36.68 
 
 		 322 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  33.9 
 
 		 322 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2517  Polyprenyl synthetase  36.68 
 
 		 322 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  36.4 
 
 		 296 aa  161  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  38.87 
 
 		 299 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1469  polyprenyl synthetase  33.22 
 
 		 323 aa  159  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793711  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  32.65 
 
 		 320 aa  160  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  37.76 
 
 		 300 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2996  octaprenyl-diphosphate synthase  32.99 
 
 		 340 aa  159  6e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  36.14 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  31.13 
 
 		 322 aa  159  6e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5018  Polyprenyl synthetase  36.36 
 
 		 346 aa  159  9e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>