More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1537 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1537  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 732 aa  1513    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  34.12 
 
 		 698 aa  367  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  34.35 
 
 		 696 aa  363  7.0000000000000005e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1374  type III restriction protein res subunit  32.5 
 
 		 707 aa  343  1e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.304908  normal  0.550958 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  30.1 
 
 		 706 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2087  type III restriction enzyme, res subunit  31.42 
 
 		 715 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.167702  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2313  type III restriction protein res subunit  31.06 
 
 		 706 aa  275  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00119  Type III restriction enzyme, res subunit  26.92 
 
 		 744 aa  224  4e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.431054  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  35.15 
 
 		 469 aa  223  8e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  32.32 
 
 		 492 aa  212  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  31.93 
 
 		 493 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  32.33 
 
 		 489 aa  198  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  32.33 
 
 		 489 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4050  type III restriction protein res subunit  27.27 
 
 		 453 aa  144  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0396258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  32.86 
 
 		 1065 aa  144  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  32.86 
 
 		 1065 aa  144  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  29.95 
 
 		 464 aa  139  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  27.29 
 
 		 449 aa  127  7e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  28.85 
 
 		 456 aa  120  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  26.73 
 
 		 451 aa  117  5e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  25.24 
 
 		 451 aa  117  6e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  26.18 
 
 		 440 aa  117  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  26.72 
 
 		 470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4564  helicase-like  25.1 
 
 		 453 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  25.99 
 
 		 551 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  25.74 
 
 		 444 aa  112  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  27.79 
 
 		 443 aa  110  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  27.07 
 
 		 451 aa  108  3e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  23.46 
 
 		 466 aa  108  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  25.69 
 
 		 385 aa  107  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  26.27 
 
 		 451 aa  106  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  26.21 
 
 		 531 aa  106  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  24.19 
 
 		 494 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  25.8 
 
 		 444 aa  98.6  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  25.37 
 
 		 531 aa  98.6  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  26.82 
 
 		 491 aa  96.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  25.63 
 
 		 652 aa  96.3  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  24.75 
 
 		 509 aa  95.5  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  25 
 
 		 509 aa  95.5  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  25.37 
 
 		 499 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  24.09 
 
 		 479 aa  93.6  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  24.94 
 
 		 488 aa  92.8  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  24.19 
 
 		 590 aa  93.2  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  23.45 
 
 		 517 aa  90.1  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3178  type III restriction protein res subunit  25.1 
 
 		 249 aa  89.7  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  23.64 
 
 		 654 aa  89.4  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  22.92 
 
 		 479 aa  88.6  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  23.94 
 
 		 468 aa  88.2  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  24.69 
 
 		 462 aa  87  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  23.63 
 
 		 479 aa  85.5  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  23.28 
 
 		 479 aa  85.1  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  22.89 
 
 		 479 aa  84.3  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  23.92 
 
 		 647 aa  84  0.000000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  23.23 
 
 		 650 aa  84  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  24.8 
 
 		 949 aa  83.2  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0358  type III restriction protein res subunit  20.8 
 
 		 843 aa  83.2  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.421793  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  22.64 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20230  EcoEI R domain protein  25.72 
 
 		 770 aa  80.1  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.601124  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  21.85 
 
 		 463 aa  79.7  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  21.91 
 
 		 951 aa  79.3  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  22.57 
 
 		 485 aa  77.4  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  22.88 
 
 		 905 aa  77  0.000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8756  type III restriction enzyme, res subunit  22.39 
 
 		 1028 aa  75.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  22.33 
 
 		 485 aa  75.5  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0291  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.93 
 
 		 577 aa  74.7  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.279788 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1910  type III restriction enzyme, res subunit  25.09 
 
 		 1043 aa  74.3  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1987  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.75 
 
 		 507 aa  73.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.173393  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  26.32 
 
 		 1061 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1875  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.1 
 
 		 633 aa  73.9  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1258  type III restriction protein res subunit  23.53 
 
 		 787 aa  73.2  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.377183  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  23.81 
 
 		 952 aa  73.2  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  23.41 
 
 		 967 aa  73.2  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0301  type III restriction enzyme, res subunit  25.94 
 
 		 1051 aa  72  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.177385  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1599  helicase domain protein  25.88 
 
 		 889 aa  71.6  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0244124  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0824  EcoEI R domain-containing protein  25.58 
 
 		 783 aa  72  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1255  DEAD/DEAH box helicase  23.46 
 
 		 811 aa  71.6  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0068  Type III restriction enzyme, res subunit  24.81 
 
 		 519 aa  71.6  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2536  ATP-dependent helicase, DEAD-box  28.93 
 
 		 518 aa  71.2  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314913  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1195  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.93 
 
 		 516 aa  71.2  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  24.74 
 
 		 1017 aa  71.2  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0821  type III restriction protein res subunit  23.13 
 
 		 1042 aa  71.2  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0473136 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  22.92 
 
 		 1149 aa  71.2  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17070  DNA/RNA helicase, superfamily II  22.77 
 
 		 1031 aa  70.9  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  23.75 
 
 		 993 aa  70.9  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  21.91 
 
 		 953 aa  70.9  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  21.91 
 
 		 953 aa  70.9  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1809  DEAD/DEAH box helicase-like  26.27 
 
 		 493 aa  70.9  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1359  helicase, putative  23.76 
 
 		 1041 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04062  type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit  21.88 
 
 		 796 aa  70.1  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0938  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.58 
 
 		 482 aa  70.1  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.556655  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  21.22 
 
 		 949 aa  70.5  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  21.8 
 
 		 629 aa  70.5  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1976  EcoEI R domain-containing protein  23.94 
 
 		 825 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.411939  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0933  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.58 
 
 		 482 aa  70.1  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3022  type III restriction protein res subunit  23.08 
 
 		 1597 aa  69.3  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  21.96 
 
 		 464 aa  70.1  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.536242  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  22.24 
 
 		 848 aa  69.7  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  24.81 
 
 		 1055 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0909  type III restriction protein res subunit  23.88 
 
 		 1042 aa  68.9  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252212  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  24.81 
 
 		 1055 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>