More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_0068 on replicon NC_010158
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010158  YpAngola_0068  Type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 519 aa  1078    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  26.63 
 
 		 647 aa  84.7  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  26.39 
 
 		 443 aa  81.3  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  26.42 
 
 		 652 aa  80.9  0.00000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  24.93 
 
 		 654 aa  80.9  0.00000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  22.55 
 
 		 630 aa  79.3  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  22.31 
 
 		 455 aa  72  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1537  type III restriction enzyme, res subunit  24.81 
 
 		 732 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  23.86 
 
 		 463 aa  71.2  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  24.51 
 
 		 444 aa  69.7  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  24.19 
 
 		 650 aa  69.7  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  24.23 
 
 		 462 aa  69.7  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  23.48 
 
 		 485 aa  69.3  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  23.48 
 
 		 485 aa  67.4  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0337  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  28.28 
 
 		 979 aa  67  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  25.26 
 
 		 606 aa  66.6  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  21.75 
 
 		 1348 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  22.56 
 
 		 773 aa  65.1  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  24.62 
 
 		 607 aa  64.3  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  23.46 
 
 		 1029 aa  62.4  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  21.17 
 
 		 815 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  22.88 
 
 		 1149 aa  62  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2167  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.65 
 
 		 586 aa  61.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0230616  decreased coverage  0.0000613257 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  23.15 
 
 		 1287 aa  60.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0789  type III restriction protein res subunit  20.36 
 
 		 795 aa  60.5  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.891259  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  23.76 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  24.27 
 
 		 551 aa  59.7  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  22.13 
 
 		 629 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  26.39 
 
 		 531 aa  59.7  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  22.91 
 
 		 468 aa  60.1  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  26.5 
 
 		 385 aa  59.7  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  23 
 
 		 548 aa  59.7  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  22.52 
 
 		 952 aa  59.3  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  24.87 
 
 		 449 aa  59.3  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  24.49 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  19.95 
 
 		 812 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  23.48 
 
 		 479 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  22.5 
 
 		 462 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02470  DEAD box family helicase, putative  23.46 
 
 		 706 aa  58.5  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.384709  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  22.89 
 
 		 1418 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  25 
 
 		 470 aa  58.5  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  24.32 
 
 		 531 aa  58.2  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2125  Type III restriction enzyme, res subunit  23.11 
 
 		 842 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  23.22 
 
 		 479 aa  58.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1910  type III restriction enzyme, res subunit  21.6 
 
 		 1043 aa  57.8  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  23 
 
 		 451 aa  58.2  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  21.54 
 
 		 967 aa  58.2  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8756  type III restriction enzyme, res subunit  22.67 
 
 		 1028 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  24.4 
 
 		 555 aa  57.8  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0992  type III restriction protein res subunit  22.42 
 
 		 938 aa  57  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.942343 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  22.67 
 
 		 993 aa  56.2  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  23.48 
 
 		 479 aa  56.6  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  25.07 
 
 		 444 aa  55.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  23.18 
 
 		 953 aa  56.2  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2160  excinuclease ABC subunit B  27.86 
 
 		 721 aa  55.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  23.18 
 
 		 953 aa  56.2  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2030  excinuclease ABC subunit B  24.38 
 
 		 690 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0667365  normal  0.695875 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3809  type III restriction enzyme, res subunit  23.12 
 
 		 1033 aa  55.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  20.69 
 
 		 813 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.28 
 
 		 533 aa  55.5  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11220  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.41 
 
 		 758 aa  55.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.134358  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4564  helicase-like  25.57 
 
 		 453 aa  55.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4680  excinuclease ABC subunit B  34.74 
 
 		 665 aa  54.7  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  27.73 
 
 		 1055 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2721  helicase domain-containing protein  22.88 
 
 		 590 aa  54.3  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  25.19 
 
 		 706 aa  54.3  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0824  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.38 
 
 		 609 aa  54.3  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920736  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  27.73 
 
 		 1055 aa  54.3  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  27.73 
 
 		 1055 aa  54.3  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  25 
 
 		 643 aa  53.9  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3723  excinuclease ABC subunit B  35.79 
 
 		 667 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.22049  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3669  excinuclease ABC subunit B  35.79 
 
 		 667 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  21.09 
 
 		 494 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0799  excinuclease ABC subunit B  27.27 
 
 		 661 aa  53.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1767  excinuclease ABC subunit B  29.85 
 
 		 665 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2070  excinuclease ABC, B subunit  32.58 
 
 		 686 aa  53.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.179869  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.43 
 
 		 516 aa  52.8  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0782  excinuclease ABC subunit B  27.27 
 
 		 661 aa  53.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.24339  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1516  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.7 
 
 		 720 aa  52.8  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0301  type III restriction enzyme, res subunit  25.45 
 
 		 1051 aa  53.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.177385  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  25.45 
 
 		 1061 aa  53.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  21.19 
 
 		 1077 aa  53.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1516  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.47 
 
 		 686 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2492  type III restriction protein res subunit  22.2 
 
 		 1066 aa  53.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.964  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0426  excinuclease ABC subunit B  26.45 
 
 		 661 aa  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18430  RecG-like helicase  27.87 
 
 		 739 aa  52.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761444  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  22.39 
 
 		 475 aa  52.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1244  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.43 
 
 		 850 aa  52.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.912337  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4253  excinuclease ABC subunit B  25.53 
 
 		 761 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.31724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5213  excinuclease ABC subunit B  29.1 
 
 		 665 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.100311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0006  type III restriction enzyme, res subunit  22.37 
 
 		 768 aa  52.8  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8393  hypothetical protein  30.17 
 
 		 697 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.671179 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  21.43 
 
 		 459 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1316  type III restriction enzyme, res subunit  22.34 
 
 		 796 aa  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2072  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.56 
 
 		 707 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000101062  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  25.6 
 
 		 488 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  21.23 
 
 		 998 aa  52.8  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3192  type III restriction enzyme, res subunit  21.93 
 
 		 928 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2192  excinuclease ABC subunit B  27.48 
 
 		 725 aa  52.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19237  predicted protein  28.24 
 
 		 710 aa  51.6  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.554541  normal  0.150728 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>