More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_18430 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_18430  RecG-like helicase  100 
 
 
739 aa  1458    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761444  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0646  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.67 
 
 
733 aa  567  1e-160  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11220  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.42 
 
 
758 aa  556  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.134358  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2279  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.73 
 
 
749 aa  545  1e-154  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.349977  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1674  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.87 
 
 
750 aa  535  1e-151  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00000586532  normal  0.0155467 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3438  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.08 
 
 
736 aa  537  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.936124  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09240  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.21 
 
 
722 aa  533  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0945523  normal  0.830238 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3200  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.2 
 
 
752 aa  526  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.74 
 
 
747 aa  526  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1580  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.16 
 
 
741 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.79 
 
 
748 aa  513  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205601  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2304  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.79 
 
 
747 aa  513  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.272394  hitchhiker  0.00347344 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4035  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.03 
 
 
726 aa  509  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2116  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.19 
 
 
718 aa  502  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.48597 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1169  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.19 
 
 
733 aa  504  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182311  hitchhiker  0.00000886556 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2785  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.3 
 
 
725 aa  503  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.423247  normal  0.0848754 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1279  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.46 
 
 
733 aa  504  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32853  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5977  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.02 
 
 
733 aa  498  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1368  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.88 
 
 
759 aa  489  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8000  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.6 
 
 
723 aa  491  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.552876  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1874  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.04 
 
 
760 aa  489  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00557261  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2247  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.72 
 
 
757 aa  486  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123791 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2510  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.95 
 
 
756 aa  484  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.475604  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3607  DEAD/DEAH box helicase-like  43.57 
 
 
739 aa  480  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10820  RecG-like helicase  43.43 
 
 
741 aa  472  1e-132  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0480832  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8025  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.31 
 
 
746 aa  469  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3285  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.54 
 
 
750 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130284  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4212  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.38 
 
 
753 aa  465  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192326  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1936  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.86 
 
 
741 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.510188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1982  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.86 
 
 
741 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.39 
 
 
778 aa  455  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.837627  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1916  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.86 
 
 
741 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.440344 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2155  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.92 
 
 
752 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.649606  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.29 
 
 
781 aa  445  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0660561 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12988  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.62 
 
 
737 aa  445  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08830  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.66 
 
 
730 aa  423  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.633208  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0316  putative ATP-dependent DNA helicase RecG  33.93 
 
 
792 aa  387  1e-106  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.151323 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1516  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.14 
 
 
720 aa  370  1e-101  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.03 
 
 
818 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.24 
 
 
704 aa  367  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.46 
 
 
818 aa  365  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.75 
 
 
819 aa  364  3e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.87 
 
 
712 aa  363  4e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.75 
 
 
819 aa  364  4e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0764  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.54 
 
 
818 aa  363  5.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.41 
 
 
706 aa  362  1e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08161  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.56 
 
 
818 aa  359  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0743  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.89 
 
 
763 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1117  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.65 
 
 
689 aa  358  2.9999999999999997e-97  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0719  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.74 
 
 
779 aa  355  1e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.45 
 
 
719 aa  355  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08171  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.56 
 
 
815 aa  354  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0579135  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.1 
 
 
685 aa  354  4e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  33 
 
 
815 aa  353  5.9999999999999994e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.93 
 
 
846 aa  353  7e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  31 
 
 
689 aa  353  8.999999999999999e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1164  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.49 
 
 
692 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.69 
 
 
706 aa  352  2e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.07 
 
 
846 aa  351  3e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.14 
 
 
779 aa  350  5e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1105  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.93 
 
 
799 aa  349  8e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  36 
 
 
717 aa  349  9e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.97 
 
 
704 aa  347  3e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.48 
 
 
685 aa  347  4e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  33.29 
 
 
818 aa  346  8.999999999999999e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.83 
 
 
704 aa  345  1e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.9 
 
 
702 aa  345  2e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.77 
 
 
842 aa  345  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3545  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.59 
 
 
688 aa  344  2.9999999999999997e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020177  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.09 
 
 
817 aa  344  2.9999999999999997e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.97 
 
 
832 aa  344  2.9999999999999997e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.6 
 
 
827 aa  344  4e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.04 
 
 
700 aa  343  7e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.46 
 
 
681 aa  343  8e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2072  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.27 
 
 
707 aa  343  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000101062  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0322  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.83 
 
 
715 aa  342  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.732592  normal  0.0359852 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3614  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.48 
 
 
682 aa  341  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135491  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3903  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.48 
 
 
682 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000501886  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3869  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.48 
 
 
682 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.12234e-39 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3706  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.48 
 
 
682 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3993  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.48 
 
 
682 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000184974  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3596  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.45 
 
 
657 aa  340  4e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1077  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.38 
 
 
682 aa  341  4e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.012078  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.69 
 
 
740 aa  340  5.9999999999999996e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3954  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.29 
 
 
682 aa  340  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0156287  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.41 
 
 
818 aa  340  5.9999999999999996e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10468  ATP-dependent DNA helicase recG  32.37 
 
 
700 aa  340  5.9999999999999996e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.938842  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0923  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.24 
 
 
680 aa  340  7e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.452189  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.63 
 
 
842 aa  340  7e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1289  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.29 
 
 
682 aa  340  7e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00448212  hitchhiker  0.00000000161574 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3897  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.48 
 
 
682 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00158642  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.37 
 
 
772 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2210  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.47 
 
 
904 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.54 
 
 
812 aa  338  1.9999999999999998e-91  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3678  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.34 
 
 
685 aa  338  2.9999999999999997e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0468  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.27 
 
 
731 aa  338  2.9999999999999997e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.96 
 
 
822 aa  337  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0196  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.85 
 
 
781 aa  337  7e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.639349  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.38 
 
 
701 aa  336  9e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2074  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.85 
 
 
908 aa  336  9e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.14532 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>