More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0646 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1279  ATP-dependent DNA helicase RecG  62.47 
 
 		 733 aa  822    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09240  ATP-dependent DNA helicase RecG  63.79 
 
 		 722 aa  860    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0945523  normal  0.830238 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1169  ATP-dependent DNA helicase RecG  62.83 
 
 		 733 aa  833    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182311  hitchhiker  0.00000886556 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0646  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 		 733 aa  1444    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  68.23 
 
 		 747 aa  925    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11220  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.17 
 
 		 758 aa  703    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.134358  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.34 
 
 		 781 aa  722    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0660561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2116  ATP-dependent DNA helicase RecG  60.33 
 
 		 718 aa  824    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48597 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3607  DEAD/DEAH box helicase-like  57.16 
 
 		 739 aa  741    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2304  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.67 
 
 		 747 aa  719    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.272394  hitchhiker  0.00347344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5977  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.87 
 
 		 733 aa  816    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1874  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.79 
 
 		 760 aa  721    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00557261  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8000  ATP-dependent DNA helicase RecG  62.65 
 
 		 723 aa  847    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.552876  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2247  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.29 
 
 		 757 aa  712    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123791 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4035  DEAD/DEAH box helicase domain protein  61.81 
 
 		 726 aa  796    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2510  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.86 
 
 		 756 aa  684    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.475604  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2785  ATP-dependent DNA helicase RecG  64.99 
 
 		 725 aa  850    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.423247  normal  0.0848754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8025  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.39 
 
 		 746 aa  820    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1580  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.48 
 
 		 741 aa  729    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2279  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.05 
 
 		 749 aa  721    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.349977  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3285  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.27 
 
 		 750 aa  693    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130284  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1674  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.74 
 
 		 750 aa  701    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00000586532  normal  0.0155467 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1368  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.51 
 
 		 759 aa  649    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3438  ATP-dependent DNA helicase RecG  67.65 
 
 		 736 aa  934    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.936124  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.83 
 
 		 748 aa  682    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4212  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.41 
 
 		 753 aa  630  1e-179  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10820  RecG-like helicase  51.07 
 
 		 741 aa  629  1e-179  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0480832  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1936  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.21 
 
 		 741 aa  626  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.510188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1982  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.21 
 
 		 741 aa  626  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1916  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.08 
 
 		 741 aa  623  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.440344 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3200  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.94 
 
 		 752 aa  621  1e-176  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12988  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.48 
 
 		 737 aa  610  1e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2155  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.93 
 
 		 752 aa  605  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.649606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18430  RecG-like helicase  48.53 
 
 		 739 aa  567  1e-160  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761444  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08830  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.87 
 
 		 730 aa  564  1.0000000000000001e-159  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.633208  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.36 
 
 		 778 aa  556  1e-157  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.837627  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1516  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.11 
 
 		 720 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.48 
 
 		 704 aa  459  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.02 
 
 		 832 aa  453  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.11 
 
 		 818 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.99 
 
 		 842 aa  452  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.94 
 
 		 786 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.48 
 
 		 703 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.19 
 
 		 706 aa  444  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  37 
 
 		 702 aa  442  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.19 
 
 		 842 aa  439  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.41 
 
 		 685 aa  441  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.69 
 
 		 815 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.29 
 
 		 686 aa  439  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2072  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.7 
 
 		 707 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000101062  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10468  ATP-dependent DNA helicase recG  37.74 
 
 		 700 aa  437  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.938842  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.2 
 
 		 818 aa  436  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0328  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.69 
 
 		 706 aa  436  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171796  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.89 
 
 		 819 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.89 
 
 		 819 aa  435  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.8 
 
 		 712 aa  433  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.93 
 
 		 698 aa  429  1e-119  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055955 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.01 
 
 		 717 aa  431  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.86 
 
 		 817 aa  431  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.29 
 
 		 695 aa  430  1e-119  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.47 
 
 		 719 aa  432  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.63 
 
 		 740 aa  429  1e-118  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.42 
 
 		 779 aa  427  1e-118  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.66 
 
 		 767 aa  427  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  37.34 
 
 		 818 aa  429  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.32 
 
 		 829 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.31 
 
 		 700 aa  424  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.98 
 
 		 683 aa  424  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.18 
 
 		 846 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3682  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.77 
 
 		 696 aa  425  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.71 
 
 		 706 aa  424  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0908  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.08 
 
 		 703 aa  420  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.85 
 
 		 846 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.14 
 
 		 812 aa  419  1e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.8 
 
 		 689 aa  421  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.75 
 
 		 772 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.32 
 
 		 862 aa  418  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.84 
 
 		 772 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2153  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.28 
 
 		 690 aa  419  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4892  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.27 
 
 		 706 aa  418  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355865  normal  0.436875 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.04 
 
 		 827 aa  416  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.31 
 
 		 685 aa  419  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.42 
 
 		 714 aa  414  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.32 
 
 		 827 aa  415  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1164  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.96 
 
 		 692 aa  415  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4522  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.61 
 
 		 753 aa  415  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.95 
 
 		 765 aa  416  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2890  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.35 
 
 		 678 aa  412  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000445621  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.2 
 
 		 728 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1216  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.03 
 
 		 712 aa  411  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.999568  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1105  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.23 
 
 		 799 aa  409  1e-113  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0350  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.45 
 
 		 703 aa  409  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.044491  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.09 
 
 		 818 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0967  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.08 
 
 		 691 aa  411  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309793  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3701  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.18 
 
 		 707 aa  412  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0517469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0158  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.95 
 
 		 701 aa  409  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.72 
 
 		 704 aa  409  1e-113  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.78 
 
 		 822 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1727  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.36 
 
 		 772 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2942  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.78 
 
 		 737 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>