More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1368 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1368  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 759 aa  1489    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.12 
 
 		 748 aa  662    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11220  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.83 
 
 		 758 aa  681    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.134358  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1674  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.14 
 
 		 750 aa  639    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00000586532  normal  0.0155467 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.39 
 
 		 747 aa  636    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3438  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.18 
 
 		 736 aa  725    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.936124  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2304  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.07 
 
 		 747 aa  666    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.272394  hitchhiker  0.00347344 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0646  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.51 
 
 		 733 aa  696    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09240  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.93 
 
 		 722 aa  671    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0945523  normal  0.830238 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5977  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.8 
 
 		 733 aa  639    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4035  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.17 
 
 		 726 aa  657    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3607  DEAD/DEAH box helicase-like  52.56 
 
 		 739 aa  652    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2116  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.41 
 
 		 718 aa  655    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48597 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2279  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.04 
 
 		 749 aa  705    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.349977  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2247  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.46 
 
 		 757 aa  640    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8000  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.61 
 
 		 723 aa  674    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.552876  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2785  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.06 
 
 		 725 aa  655    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.423247  normal  0.0848754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8025  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.27 
 
 		 746 aa  630  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3285  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.47 
 
 		 750 aa  627  1e-178  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130284  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1169  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.41 
 
 		 733 aa  625  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182311  hitchhiker  0.00000886556 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1279  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.66 
 
 		 733 aa  621  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2510  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.48 
 
 		 756 aa  613  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.475604  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1874  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.96 
 
 		 760 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00557261  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10820  RecG-like helicase  51.04 
 
 		 741 aa  602  1.0000000000000001e-171  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0480832  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1580  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.54 
 
 		 741 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.83 
 
 		 781 aa  581  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0660561 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3200  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.84 
 
 		 752 aa  575  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1936  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.23 
 
 		 741 aa  548  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.510188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1982  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.23 
 
 		 741 aa  548  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1916  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.97 
 
 		 741 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.440344 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2155  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.43 
 
 		 752 aa  545  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.649606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12988  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.28 
 
 		 737 aa  536  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4212  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.22 
 
 		 753 aa  535  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08830  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.52 
 
 		 730 aa  527  1e-148  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.633208  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.49 
 
 		 778 aa  524  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.837627  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18430  RecG-like helicase  44.75 
 
 		 739 aa  515  1e-144  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761444  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.07 
 
 		 704 aa  431  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1516  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.44 
 
 		 720 aa  428  1e-118  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.23 
 
 		 786 aa  422  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.91 
 
 		 703 aa  419  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.91 
 
 		 685 aa  413  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.93 
 
 		 686 aa  415  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.69 
 
 		 829 aa  409  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0316  putative ATP-dependent DNA helicase RecG  35.52 
 
 		 792 aa  412  1e-113  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.151323 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2942  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.42 
 
 		 737 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  37 
 
 		 818 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.63 
 
 		 702 aa  404  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.03 
 
 		 842 aa  404  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.22 
 
 		 700 aa  405  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.95 
 
 		 842 aa  405  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.9 
 
 		 712 aa  402  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.87 
 
 		 728 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.74 
 
 		 767 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0329  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.52 
 
 		 691 aa  397  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0231565 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.24 
 
 		 706 aa  399  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0328  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.76 
 
 		 706 aa  397  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171796  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0923  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.48 
 
 		 680 aa  396  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0353  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.01 
 
 		 691 aa  397  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2955  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.7 
 
 		 715 aa  399  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.12 
 
 		 818 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.33 
 
 		 685 aa  398  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.57 
 
 		 778 aa  398  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.42 
 
 		 683 aa  399  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.2 
 
 		 740 aa  394  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.47 
 
 		 765 aa  395  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.51 
 
 		 817 aa  394  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1087  RecG-like helicase  42.42 
 
 		 943 aa  395  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1727  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.19 
 
 		 772 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  34.92 
 
 		 818 aa  395  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.48 
 
 		 706 aa  393  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.15 
 
 		 695 aa  395  1e-108  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.08 
 
 		 827 aa  393  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.71 
 
 		 772 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.89 
 
 		 772 aa  393  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.58 
 
 		 714 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.86 
 
 		 719 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08161  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.82 
 
 		 818 aa  392  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.98 
 
 		 819 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1105  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.41 
 
 		 799 aa  391  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10468  ATP-dependent DNA helicase recG  35.12 
 
 		 700 aa  390  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.938842  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1164  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.22 
 
 		 692 aa  392  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08171  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.68 
 
 		 815 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0579135  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.4 
 
 		 689 aa  389  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.98 
 
 		 819 aa  389  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2711  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.78 
 
 		 671 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4976  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.06 
 
 		 697 aa  387  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.96 
 
 		 818 aa  389  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0158  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.29 
 
 		 701 aa  389  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2910  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.36 
 
 		 693 aa  387  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4522  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.1 
 
 		 753 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2545  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.51 
 
 		 715 aa  389  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419698  normal  0.139865 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1224  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.77 
 
 		 679 aa  389  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.01 
 
 		 698 aa  383  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055955 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2015  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.78 
 
 		 690 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.02 
 
 		 776 aa  385  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.11 
 
 		 812 aa  386  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0764  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.35 
 
 		 818 aa  385  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.31 
 
 		 832 aa  383  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.09 
 
 		 815 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.38 
 
 		 693 aa  381  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>