More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1279 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_09240  ATP-dependent DNA helicase RecG  64.87 
 
 		 722 aa  880    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0945523  normal  0.830238 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1279  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 		 733 aa  1432    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8000  ATP-dependent DNA helicase RecG  60.38 
 
 		 723 aa  792    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.552876  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8025  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.82 
 
 		 746 aa  785    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.81 
 
 		 747 aa  796    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0646  ATP-dependent DNA helicase RecG  62.88 
 
 		 733 aa  849    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3438  ATP-dependent DNA helicase RecG  62.97 
 
 		 736 aa  840    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.936124  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4035  DEAD/DEAH box helicase domain protein  61.94 
 
 		 726 aa  793    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1169  ATP-dependent DNA helicase RecG  94.41 
 
 		 733 aa  1296    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182311  hitchhiker  0.00000886556 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11220  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.34 
 
 		 758 aa  715    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.134358  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2279  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.71 
 
 		 749 aa  711    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.349977  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3607  DEAD/DEAH box helicase-like  59.89 
 
 		 739 aa  785    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2247  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.27 
 
 		 757 aa  661    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.8 
 
 		 781 aa  706    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0660561 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2304  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.03 
 
 		 747 aa  678    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.272394  hitchhiker  0.00347344 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2116  ATP-dependent DNA helicase RecG  68.36 
 
 		 718 aa  969    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48597 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5977  ATP-dependent DNA helicase RecG  60.41 
 
 		 733 aa  804    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1674  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.88 
 
 		 750 aa  690    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00000586532  normal  0.0155467 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1580  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.37 
 
 		 741 aa  680    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1874  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.4 
 
 		 760 aa  791    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00557261  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3285  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.13 
 
 		 750 aa  654    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130284  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2785  ATP-dependent DNA helicase RecG  62.77 
 
 		 725 aa  793    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.423247  normal  0.0848754 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4212  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.34 
 
 		 753 aa  633  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.96 
 
 		 748 aa  632  1e-179  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3200  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.47 
 
 		 752 aa  627  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2510  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.4 
 
 		 756 aa  626  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.475604  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1916  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.53 
 
 		 741 aa  620  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.440344 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1936  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.4 
 
 		 741 aa  620  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.510188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1982  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.4 
 
 		 741 aa  620  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1368  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.66 
 
 		 759 aa  617  1e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2155  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.44 
 
 		 752 aa  592  1e-168  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.649606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12988  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.79 
 
 		 737 aa  587  1e-166  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.05 
 
 		 778 aa  578  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.837627  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10820  RecG-like helicase  47.76 
 
 		 741 aa  567  1e-160  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0480832  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08830  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.61 
 
 		 730 aa  557  1e-157  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.633208  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18430  RecG-like helicase  46.53 
 
 		 739 aa  513  1e-144  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761444  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1516  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.19 
 
 		 720 aa  489  1e-137  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.37 
 
 		 817 aa  452  1e-125  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.27 
 
 		 832 aa  447  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.29 
 
 		 819 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.29 
 
 		 819 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.4 
 
 		 765 aa  437  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.73 
 
 		 767 aa  438  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.64 
 
 		 815 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.62 
 
 		 717 aa  435  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.11 
 
 		 706 aa  434  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.71 
 
 		 818 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.28 
 
 		 786 aa  433  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10468  ATP-dependent DNA helicase recG  36.59 
 
 		 700 aa  433  1e-120  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.938842  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.34 
 
 		 714 aa  431  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.31 
 
 		 842 aa  431  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.39 
 
 		 829 aa  430  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  36.81 
 
 		 818 aa  432  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.87 
 
 		 704 aa  432  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.04 
 
 		 827 aa  430  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.34 
 
 		 702 aa  430  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.9 
 
 		 740 aa  426  1e-118  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1727  ATP-dependent DNA helicase RecG  43 
 
 		 772 aa  429  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.55 
 
 		 818 aa  428  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.4 
 
 		 685 aa  429  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.36 
 
 		 772 aa  429  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.06 
 
 		 712 aa  422  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.47 
 
 		 689 aa  424  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2210  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.04 
 
 		 904 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.08 
 
 		 772 aa  424  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.19 
 
 		 818 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.07 
 
 		 683 aa  426  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.22 
 
 		 842 aa  424  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08161  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.71 
 
 		 818 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.22 
 
 		 703 aa  425  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.58 
 
 		 685 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.03 
 
 		 719 aa  419  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08171  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.42 
 
 		 815 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0579135  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0350  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.32 
 
 		 703 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.044491  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.97 
 
 		 862 aa  417  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4522  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.44 
 
 		 753 aa  418  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.58 
 
 		 779 aa  417  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.63 
 
 		 698 aa  414  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055955 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.54 
 
 		 812 aa  415  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0764  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.71 
 
 		 818 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0316  putative ATP-dependent DNA helicase RecG  34.98 
 
 		 792 aa  415  1e-114  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.151323 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.23 
 
 		 822 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2120  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.13 
 
 		 904 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.460593  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0328  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.47 
 
 		 706 aa  410  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171796  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.54 
 
 		 827 aa  412  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.16 
 
 		 778 aa  411  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2072  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.57 
 
 		 707 aa  410  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000101062  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.06 
 
 		 695 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.54 
 
 		 846 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1224  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.06 
 
 		 679 aa  404  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.54 
 
 		 846 aa  405  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.69 
 
 		 686 aa  402  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.17 
 
 		 706 aa  405  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.83 
 
 		 683 aa  400  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000133204 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.14 
 
 		 728 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0860  helicase domain protein  40.31 
 
 		 730 aa  400  9.999999999999999e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.313479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2058  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.79 
 
 		 822 aa  402  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0511004  normal  0.682636 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2942  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.55 
 
 		 737 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2890  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.09 
 
 		 678 aa  396  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000445621  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0593  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.58 
 
 		 708 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>