More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0860 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0860  helicase domain protein  100 
 
 		 730 aa  1493    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.313479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05590  RecG-like helicase  45.09 
 
 		 741 aa  610  1e-173  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.37968  normal  0.810679 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10000  RecG-like helicase  45.3 
 
 		 723 aa  558  1e-157  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000812963  hitchhiker  0.000000704574 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1354  helicase domain protein  44.86 
 
 		 734 aa  546  1e-154  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0209884  normal  0.12194 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.37 
 
 		 685 aa  463  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.65 
 
 		 815 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.15 
 
 		 862 aa  444  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.43 
 
 		 681 aa  442  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.65 
 
 		 689 aa  444  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0196  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.77 
 
 		 781 aa  439  9.999999999999999e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.639349  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.94 
 
 		 786 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0923  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.74 
 
 		 680 aa  441  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.32 
 
 		 842 aa  442  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.54 
 
 		 685 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.69 
 
 		 683 aa  441  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.69 
 
 		 817 aa  434  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.07 
 
 		 819 aa  435  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.6 
 
 		 701 aa  436  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.07 
 
 		 819 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3642  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.77 
 
 		 706 aa  430  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1912  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.66 
 
 		 701 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.04 
 
 		 842 aa  431  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1077  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.42 
 
 		 682 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.012078  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09240  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.2 
 
 		 722 aa  428  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0945523  normal  0.830238 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.8 
 
 		 832 aa  427  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.06 
 
 		 827 aa  428  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08171  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.7 
 
 		 815 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0579135  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0581  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.75 
 
 		 706 aa  423  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165207  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.57 
 
 		 846 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0546  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.75 
 
 		 706 aa  423  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196683  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0743  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.64 
 
 		 763 aa  423  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  37.08 
 
 		 818 aa  425  1e-117  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2553  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.32 
 
 		 681 aa  424  1e-117  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.89 
 
 		 818 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.52 
 
 		 740 aa  419  1e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.13 
 
 		 827 aa  422  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0719  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.49 
 
 		 779 aa  422  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1278  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.99 
 
 		 694 aa  420  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177254  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.04 
 
 		 717 aa  420  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.43 
 
 		 846 aa  422  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08161  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.84 
 
 		 818 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.06 
 
 		 776 aa  421  1e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1401  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.92 
 
 		 701 aa  420  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413204  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3897  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.8 
 
 		 682 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00158642  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.14 
 
 		 818 aa  419  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.94 
 
 		 818 aa  419  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3903  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.65 
 
 		 682 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000501886  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0536  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.36 
 
 		 676 aa  418  9.999999999999999e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.81 
 
 		 779 aa  415  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3706  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.65 
 
 		 682 aa  415  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152385  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3614  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.51 
 
 		 682 aa  414  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135491  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.46 
 
 		 772 aa  415  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.1 
 
 		 812 aa  415  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3993  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.65 
 
 		 682 aa  415  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000184974  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1727  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.82 
 
 		 772 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3869  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.65 
 
 		 682 aa  415  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.12234e-39 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.32 
 
 		 712 aa  414  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.17 
 
 		 772 aa  413  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0034  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.97 
 
 		 773 aa  414  1e-114  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189216  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.11 
 
 		 829 aa  412  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0449  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.46 
 
 		 676 aa  414  1e-114  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0217624  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0771  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.14 
 
 		 679 aa  414  1e-114  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000386747 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2507  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.13 
 
 		 682 aa  412  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0246082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3596  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.96 
 
 		 657 aa  409  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3954  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.51 
 
 		 682 aa  412  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0156287  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0764  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.26 
 
 		 818 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1289  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.51 
 
 		 682 aa  409  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00448212  hitchhiker  0.00000000161574 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3678  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.8 
 
 		 685 aa  412  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2192  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.35 
 
 		 787 aa  411  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1164  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.34 
 
 		 692 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.41 
 
 		 767 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1279  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.09 
 
 		 733 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1169  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.26 
 
 		 733 aa  404  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182311  hitchhiker  0.00000886556 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.93 
 
 		 719 aa  403  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7183  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.82 
 
 		 704 aa  402  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.387604  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1459  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.28 
 
 		 903 aa  403  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.107258 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3438  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.29 
 
 		 736 aa  403  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.936124  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.09 
 
 		 706 aa  405  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.02 
 
 		 704 aa  404  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.93 
 
 		 747 aa  404  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2363  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.8 
 
 		 790 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.91 
 
 		 714 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2279  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.88 
 
 		 749 aa  402  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.349977  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4415  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.43 
 
 		 697 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0646  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.08 
 
 		 733 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2116  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.22 
 
 		 718 aa  401  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48597 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.64 
 
 		 702 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.91 
 
 		 700 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1516  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.95 
 
 		 720 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2210  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.06 
 
 		 904 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0756  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.73 
 
 		 702 aa  399  9.999999999999999e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.622738  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1874  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.9 
 
 		 760 aa  396  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00557261  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.26 
 
 		 822 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8000  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.82 
 
 		 723 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.552876  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0793  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.56 
 
 		 682 aa  395  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1515  DEAD/DEAH box helicase  39.79 
 
 		 699 aa  393  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.031293 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1105  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.08 
 
 		 799 aa  394  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3607  DEAD/DEAH box helicase-like  39.39 
 
 		 739 aa  393  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.03 
 
 		 686 aa  395  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1311  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.07 
 
 		 686 aa  395  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>