More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_05590 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_10000  RecG-like helicase  56.21 
 
 		 723 aa  759    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000812963  hitchhiker  0.000000704574 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05590  RecG-like helicase  100 
 
 		 741 aa  1499    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.37968  normal  0.810679 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1354  helicase domain protein  60.03 
 
 		 734 aa  785    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0209884  normal  0.12194 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0860  helicase domain protein  45.09 
 
 		 730 aa  600  1e-170  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.313479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0923  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.7 
 
 		 680 aa  452  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0771  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.65 
 
 		 679 aa  442  9.999999999999999e-123  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000386747 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.24 
 
 		 815 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.38 
 
 		 683 aa  438  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1077  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.59 
 
 		 682 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.012078  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.31 
 
 		 689 aa  432  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  36.41 
 
 		 818 aa  429  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.97 
 
 		 740 aa  426  1e-118  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.86 
 
 		 685 aa  426  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.35 
 
 		 818 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.59 
 
 		 681 aa  422  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2192  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.15 
 
 		 787 aa  423  1e-117  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1727  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.37 
 
 		 772 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.44 
 
 		 842 aa  420  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.47 
 
 		 818 aa  417  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1278  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.74 
 
 		 694 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177254  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1967  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.52 
 
 		 682 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08161  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.96 
 
 		 818 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.28 
 
 		 846 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.89 
 
 		 685 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.71 
 
 		 819 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.17 
 
 		 842 aa  414  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2210  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.66 
 
 		 904 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.69 
 
 		 776 aa  412  1e-114  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.99 
 
 		 700 aa  412  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.71 
 
 		 819 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.05 
 
 		 846 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08171  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.87 
 
 		 815 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0579135  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.58 
 
 		 812 aa  410  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2507  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.47 
 
 		 682 aa  410  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0246082  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.49 
 
 		 827 aa  409  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0536  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.46 
 
 		 676 aa  407  1.0000000000000001e-112  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2120  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.37 
 
 		 904 aa  405  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.460593  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3897  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.92 
 
 		 682 aa  404  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00158642  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3706  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.92 
 
 		 682 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152385  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3614  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.78 
 
 		 682 aa  404  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3993  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.92 
 
 		 682 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000184974  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.57 
 
 		 817 aa  405  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1516  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.48 
 
 		 720 aa  404  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3678  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.2 
 
 		 685 aa  405  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.77 
 
 		 832 aa  403  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3954  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.2 
 
 		 682 aa  404  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0156287  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1289  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.2 
 
 		 682 aa  404  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00448212  hitchhiker  0.00000000161574 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3903  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.92 
 
 		 682 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000501886  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.82 
 
 		 862 aa  405  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.38 
 
 		 827 aa  404  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3869  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.92 
 
 		 682 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.12234e-39 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2074  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.2 
 
 		 908 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.14532 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09240  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.5 
 
 		 722 aa  401  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0945523  normal  0.830238 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2116  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.62 
 
 		 718 aa  396  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48597 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.26 
 
 		 767 aa  397  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1164  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.35 
 
 		 692 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.21 
 
 		 818 aa  398  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.54 
 
 		 829 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2279  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.17 
 
 		 749 aa  399  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.349977  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0196  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.09 
 
 		 781 aa  399  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.639349  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1224  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.57 
 
 		 679 aa  395  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1459  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.83 
 
 		 903 aa  395  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.107258 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.24 
 
 		 786 aa  394  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.15 
 
 		 712 aa  392  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3596  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.01 
 
 		 657 aa  393  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2058  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.81 
 
 		 822 aa  393  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0511004  normal  0.682636 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.49 
 
 		 717 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.15 
 
 		 779 aa  393  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16671  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.31 
 
 		 846 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.461543 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8000  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.32 
 
 		 723 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.552876  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.21 
 
 		 704 aa  390  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.1 
 
 		 822 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0764  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.38 
 
 		 818 aa  392  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.03 
 
 		 706 aa  391  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2785  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.48 
 
 		 725 aa  392  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.423247  normal  0.0848754 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.88 
 
 		 714 aa  388  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.02 
 
 		 719 aa  388  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0328  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.68 
 
 		 706 aa  386  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171796  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3642  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.65 
 
 		 706 aa  389  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.92 
 
 		 747 aa  386  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3438  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.68 
 
 		 736 aa  388  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.936124  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.79 
 
 		 702 aa  387  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.78 
 
 		 772 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3607  DEAD/DEAH box helicase-like  37.72 
 
 		 739 aa  384  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0034  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.92 
 
 		 773 aa  384  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189216  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.63 
 
 		 703 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0719  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.82 
 
 		 779 aa  382  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0581  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.3 
 
 		 706 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165207  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0646  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.47 
 
 		 733 aa  380  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0546  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.3 
 
 		 706 aa  381  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196683  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0743  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.82 
 
 		 763 aa  382  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.37 
 
 		 772 aa  382  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.8 
 
 		 748 aa  376  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.78 
 
 		 706 aa  377  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8025  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.21 
 
 		 746 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5977  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.83 
 
 		 733 aa  376  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.34 
 
 		 765 aa  376  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1682  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.33 
 
 		 671 aa  374  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.193208  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4522  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.77 
 
 		 753 aa  373  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0756  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.47 
 
 		 702 aa  371  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.622738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>