More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1600 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2279  ATP-dependent DNA helicase RecG  62.94 
 
 		 749 aa  830    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.349977  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3438  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.96 
 
 		 736 aa  721    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.936124  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1874  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.93 
 
 		 760 aa  639    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00557261  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8025  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.6 
 
 		 746 aa  664    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1169  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.04 
 
 		 733 aa  657    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182311  hitchhiker  0.00000886556 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0646  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.83 
 
 		 733 aa  722    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1279  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.9 
 
 		 733 aa  644    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1368  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.12 
 
 		 759 aa  659    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 748 aa  1469    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2116  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.49 
 
 		 718 aa  692    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48597 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2785  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.26 
 
 		 725 aa  671    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.423247  normal  0.0848754 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3607  DEAD/DEAH box helicase-like  52.71 
 
 		 739 aa  644    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5977  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.16 
 
 		 733 aa  674    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2247  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.52 
 
 		 757 aa  697    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123791 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4035  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.24 
 
 		 726 aa  674    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11220  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.52 
 
 		 758 aa  783    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.134358  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09240  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.76 
 
 		 722 aa  681    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0945523  normal  0.830238 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2304  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.75 
 
 		 747 aa  796    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.272394  hitchhiker  0.00347344 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2510  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.11 
 
 		 756 aa  686    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.475604  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1580  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.47 
 
 		 741 aa  637    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.03 
 
 		 747 aa  685    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8000  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.31 
 
 		 723 aa  684    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.552876  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1674  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.03 
 
 		 750 aa  747    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00000586532  normal  0.0155467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3285  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.37 
 
 		 750 aa  622  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130284  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.05 
 
 		 781 aa  602  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0660561 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10820  RecG-like helicase  49.19 
 
 		 741 aa  585  1.0000000000000001e-165  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0480832  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3200  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.47 
 
 		 752 aa  580  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1916  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.98 
 
 		 741 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.440344 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12988  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.92 
 
 		 737 aa  578  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1936  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.92 
 
 		 741 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.510188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1982  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.92 
 
 		 741 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4212  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.38 
 
 		 753 aa  571  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2155  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.47 
 
 		 752 aa  565  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.649606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08830  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.5 
 
 		 730 aa  545  1e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.633208  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18430  RecG-like helicase  46.22 
 
 		 739 aa  545  1e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761444  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.35 
 
 		 778 aa  493  9.999999999999999e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.837627  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0316  putative ATP-dependent DNA helicase RecG  37.23 
 
 		 792 aa  455  1.0000000000000001e-126  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.151323 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1516  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.85 
 
 		 720 aa  433  1e-120  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.86 
 
 		 815 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.65 
 
 		 819 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.65 
 
 		 819 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.55 
 
 		 818 aa  419  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.59 
 
 		 689 aa  414  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1087  RecG-like helicase  36.8 
 
 		 943 aa  414  1e-114  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.93 
 
 		 704 aa  413  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.93 
 
 		 846 aa  412  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.74 
 
 		 786 aa  411  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  34.64 
 
 		 818 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.36 
 
 		 812 aa  406  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.79 
 
 		 846 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.51 
 
 		 683 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.64 
 
 		 740 aa  403  1e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.31 
 
 		 818 aa  405  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.76 
 
 		 702 aa  405  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.59 
 
 		 818 aa  399  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.3 
 
 		 685 aa  400  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.89 
 
 		 827 aa  401  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10468  ATP-dependent DNA helicase recG  34.09 
 
 		 700 aa  402  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.938842  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08161  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.13 
 
 		 818 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.06 
 
 		 685 aa  398  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0764  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.79 
 
 		 818 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1967  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.94 
 
 		 682 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.38 
 
 		 712 aa  395  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.84 
 
 		 817 aa  395  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0923  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.67 
 
 		 680 aa  394  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1727  ATP-dependent DNA helicase RecG  40 
 
 		 772 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08171  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.9 
 
 		 815 aa  395  1e-108  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0579135  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.88 
 
 		 686 aa  395  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1164  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.85 
 
 		 692 aa  395  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0908  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.8 
 
 		 703 aa  393  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1077  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.63 
 
 		 682 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.012078  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.64 
 
 		 700 aa  391  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.17 
 
 		 717 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.97 
 
 		 779 aa  392  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2210  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.28 
 
 		 904 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.5 
 
 		 822 aa  389  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0719  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.37 
 
 		 779 aa  386  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3701  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.42 
 
 		 707 aa  388  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0517469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.36 
 
 		 842 aa  385  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.16 
 
 		 719 aa  383  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.09 
 
 		 703 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0743  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.14 
 
 		 763 aa  385  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0536  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.21 
 
 		 676 aa  382  1e-105  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.42 
 
 		 776 aa  384  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.85 
 
 		 832 aa  382  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1117  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.4 
 
 		 689 aa  382  1e-104  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1330  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.8 
 
 		 678 aa  382  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.47 
 
 		 681 aa  382  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.71 
 
 		 862 aa  382  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.22 
 
 		 767 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.18 
 
 		 842 aa  380  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1289  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.18 
 
 		 682 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00448212  hitchhiker  0.00000000161574 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0158  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.83 
 
 		 701 aa  379  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0756  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.24 
 
 		 702 aa  382  1e-104  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.622738  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4892  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.23 
 
 		 706 aa  382  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355865  normal  0.436875 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3678  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.18 
 
 		 685 aa  382  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1700  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.96 
 
 		 672 aa  380  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.828998  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2507  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.39 
 
 		 682 aa  381  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0246082  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3954  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.04 
 
 		 682 aa  381  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0156287  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.54 
 
 		 827 aa  376  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>