More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2304 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8025  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.74 
 
 		 746 aa  664    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2247  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.31 
 
 		 757 aa  693    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123791 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5977  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.76 
 
 		 733 aa  691    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0646  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.8 
 
 		 733 aa  743    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8000  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.88 
 
 		 723 aa  709    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.552876  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3438  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.99 
 
 		 736 aa  706    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.936124  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4035  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.22 
 
 		 726 aa  674    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2304  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 747 aa  1442    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.272394  hitchhiker  0.00347344 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3607  DEAD/DEAH box helicase-like  54.78 
 
 		 739 aa  655    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1674  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.61 
 
 		 750 aa  738    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00000586532  normal  0.0155467 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09240  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.39 
 
 		 722 aa  744    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0945523  normal  0.830238 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1874  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.89 
 
 		 760 aa  654    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00557261  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2116  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.64 
 
 		 718 aa  682    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48597 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.89 
 
 		 748 aa  791    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.78 
 
 		 747 aa  682    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1279  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.03 
 
 		 733 aa  674    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1368  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.07 
 
 		 759 aa  657    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2510  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.43 
 
 		 756 aa  694    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.475604  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2785  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.97 
 
 		 725 aa  694    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.423247  normal  0.0848754 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2279  ATP-dependent DNA helicase RecG  65.19 
 
 		 749 aa  869    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.349977  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1169  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.03 
 
 		 733 aa  679    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182311  hitchhiker  0.00000886556 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11220  ATP-dependent DNA helicase RecG  61.84 
 
 		 758 aa  816    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.134358  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1580  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.05 
 
 		 741 aa  627  1e-178  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3285  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.5 
 
 		 750 aa  628  1e-178  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130284  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.06 
 
 		 781 aa  593  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0660561 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3200  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.12 
 
 		 752 aa  590  1e-167  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10820  RecG-like helicase  50.07 
 
 		 741 aa  568  1e-160  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0480832  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4212  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.78 
 
 		 753 aa  554  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2155  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.48 
 
 		 752 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.649606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12988  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.8 
 
 		 737 aa  533  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1936  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.54 
 
 		 741 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.510188  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1916  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.07 
 
 		 741 aa  535  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.440344 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1982  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.54 
 
 		 741 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18430  RecG-like helicase  45.98 
 
 		 739 aa  525  1e-147  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761444  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.89 
 
 		 778 aa  520  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.837627  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08830  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.93 
 
 		 730 aa  506  9.999999999999999e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.633208  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0316  putative ATP-dependent DNA helicase RecG  35.82 
 
 		 792 aa  437  1e-121  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.151323 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.34 
 
 		 786 aa  413  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.9 
 
 		 683 aa  414  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.32 
 
 		 829 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.87 
 
 		 815 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1087  RecG-like helicase  43.72 
 
 		 943 aa  409  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.08 
 
 		 812 aa  409  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.22 
 
 		 704 aa  410  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0923  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.68 
 
 		 680 aa  409  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.8 
 
 		 702 aa  408  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.57 
 
 		 818 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1516  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.68 
 
 		 720 aa  405  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.79 
 
 		 818 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.24 
 
 		 819 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.44 
 
 		 717 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.94 
 
 		 827 aa  402  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08161  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.41 
 
 		 818 aa  401  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.24 
 
 		 819 aa  399  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.19 
 
 		 706 aa  397  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.35 
 
 		 846 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0328  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.54 
 
 		 706 aa  396  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171796  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.24 
 
 		 767 aa  397  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.27 
 
 		 817 aa  399  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.23 
 
 		 779 aa  398  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10468  ATP-dependent DNA helicase recG  34.55 
 
 		 700 aa  397  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.938842  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.95 
 
 		 778 aa  396  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08171  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.45 
 
 		 815 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0579135  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.13 
 
 		 700 aa  393  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0764  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.77 
 
 		 818 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.53 
 
 		 827 aa  394  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.34 
 
 		 846 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.99 
 
 		 772 aa  393  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.83 
 
 		 695 aa  391  1e-107  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.58 
 
 		 765 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.36 
 
 		 832 aa  392  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.91 
 
 		 704 aa  391  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.91 
 
 		 704 aa  390  1e-107  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.67 
 
 		 772 aa  391  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1216  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.39 
 
 		 712 aa  392  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.999568  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.83 
 
 		 842 aa  391  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.57 
 
 		 719 aa  391  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.4 
 
 		 706 aa  390  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.96 
 
 		 683 aa  389  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000133204 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3701  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.15 
 
 		 707 aa  388  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0517469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1727  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.77 
 
 		 772 aa  389  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0639  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.24 
 
 		 792 aa  388  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0614  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.97 
 
 		 785 aa  389  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.97 
 
 		 776 aa  387  1e-106  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2210  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.92 
 
 		 904 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.61 
 
 		 689 aa  387  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.13 
 
 		 681 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  34.12 
 
 		 818 aa  385  1e-105  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.76 
 
 		 703 aa  383  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1224  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.61 
 
 		 679 aa  382  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.43 
 
 		 862 aa  384  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.66 
 
 		 685 aa  385  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.32 
 
 		 728 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.57 
 
 		 686 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3812  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.92 
 
 		 777 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.85 
 
 		 686 aa  383  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0240  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.97 
 
 		 771 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1371  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.22 
 
 		 710 aa  384  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.393956  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2523  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.34 
 
 		 740 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174099  normal  0.914241 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0724  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.97 
 
 		 771 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>